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小麦蓝矮植原体基因组序列测定及其分泌蛋白功能研究

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-11页
第一章 文献综述第16-35页
    1.1 植原体研究第16-30页
        1.1.1 植原体及其发现第16页
        1.1.2 植原体病害及其症状第16-18页
        1.1.3 植原体病害的传播第18页
        1.1.4 植原体检测第18-21页
        1.1.5 植原体系统发育地位及植原体的分类第21-24页
        1.1.6 植原体基因组第24-26页
        1.1.7 植原体分泌蛋白及其在植原体致病中的作用第26-29页
        1.1.8 植原体对寄主植物的影响第29-30页
    1.2 小麦蓝矮病研究第30-34页
        1.2.1 小麦蓝矮病及其症状第30-31页
        1.2.2 小麦蓝矮病的危害第31页
        1.2.3 小麦蓝矮病病原第31-32页
        1.2.4 小麦蓝矮病传播介体及传播特性第32页
        1.2.5 小麦蓝矮植原体的寄主范围第32-33页
        1.2.6 小麦蓝矮植原体致病机理第33页
        1.2.7 小麦蓝矮病的防治第33-34页
    1.3 本实验研究目的和意义第34-35页
第二章 WBD质粒克隆及其拷贝数分析第35-54页
    2.1 实验材料第35-36页
        2.1.1 材料第35-36页
        2.1.2 试剂与耗材第36页
    2.2 实验方法第36-42页
        2.2.1 田间小麦样品的检测第36-39页
        2.2.2 WBD的传播和繁殖第39页
        2.2.3 WBD质粒片段的克隆第39页
        2.2.4 序列拼接与分析第39-40页
        2.2.5 Southern杂交第40-42页
        2.2.6 实时荧光定量PCR第42页
    2.3 结果第42-52页
        2.3.1 WBD小麦植株采集第42-45页
        2.3.2 WBD由感病小麦传播到长春花第45-46页
        2.3.3 WBD质粒片段的扩增第46-47页
        2.3.4 WBD质粒的分子特征第47-48页
        2.3.5 WBD质粒的Southern blot验证第48-49页
        2.3.6 WBD质粒的系统发育地位第49页
        2.3.7 WBD质粒的拷贝数特征第49-52页
    2.4 讨论第52-54页
第三章 WBD染色体的分离纯化第54-65页
    3.1 实验材料第54-55页
        3.1.1 材料第54页
        3.1.2 试剂与耗材第54-55页
    3.2 实验方法第55-58页
        3.2.1 WBD染色体的提取第55页
        3.2.2 WBD染色体DNA的纯化与回收第55页
        3.2.3 WBD染色体DNA的PCR和Southern blot检验第55-56页
        3.2.4 实时荧光定量PCR分析植原体纯化效果第56页
        3.2.5 电洗脱液的浓缩第56页
        3.2.6 基因组扩增(WGA)第56页
        3.2.7 全基因组扩增产物中植原体DNA含量的测定第56-58页
    3.3 结果与分析第58-63页
        3.3.1 植原体提取及染色体DNA的分离第58页
        3.3.2 WBD染色体DNA的PCR检验第58-59页
        3.3.3 WBD染色体DNA的Southern blot检验第59页
        3.3.4 WBD染色体DNA的浓缩与扩增第59-60页
        3.3.5 全基因组扩增第60页
        3.3.6 植原体染色体DNA纯化效果第60-61页
        3.3.7 全基因组扩增产物的检测第61-63页
    3.4 讨论第63-65页
第四章 WBD基因组序列测定及分析第65-90页
    4.1 实验方法第65-66页
        4.1.1 基因组文库的构建及测序第65页
        4.1.2 序列拼接第65页
        4.1.3 WBD植原体序列的筛选第65页
        4.1.4 WBD植原体序列再拼接第65-66页
        4.1.5 基因组注释第66页
        4.1.6 比较基因组分析第66页
    4.2 结果第66-89页
        4.2.1 测序文库的构建及序列测定第66-67页
        4.2.2 测序序列的拼接第67-71页
        4.2.3 WBD基因组草图基本特征第71-73页
        4.2.4 比较基因组分析第73-89页
    4.3 讨论第89-90页
第五章 诱导植物产生植原体病害症状的分泌蛋白筛选第90-105页
    5.1 实验材料第90页
        5.1.1 植物材料第90页
        5.1.2 载体与菌种第90页
        5.1.3 试剂第90页
    5.2 方法第90-97页
        5.2.1 载体构建第90-95页
        5.2.2 农杆菌GV3101 点击感受态制备第95页
        5.2.3 pGR107 重组质粒转化农杆菌GV3101第95页
        5.2.4 农杆菌注射烟草第95-96页
        5.2.5 RNA提取第96页
        5.2.6 DNA的去除及反转录第96-97页
        5.2.7 实时荧光定量定量PCR第97页
        5.2.8 亚细胞定位第97页
    5.3 结果第97-104页
        5.3.1 WBD分泌蛋白和植原体致病因子的比较第97-98页
        5.3.2 分泌蛋白基因的克隆第98-99页
        5.3.3 分泌蛋白基因-pGR107 重组质粒的构建第99-100页
        5.3.4 重组质粒转化农杆菌GV3101第100-101页
        5.3.5 SWP1 能够诱导植物的增殖第101页
        5.3.6 SWP1 核定位信号不是SWP1 的定位和功能所必需的第101-103页
        5.3.7 SWP1 在长春花中的表达特性第103-104页
    5.4 讨论第104-105页
第六章 激发或抑制寄主过敏性反应的分泌蛋白筛选第105-120页
    6.1 实验材料第105-106页
        6.1.1 植物材料第105-106页
        6.1.2 菌种与载体第106页
    6.2 方法第106-108页
        6.2.1 分泌蛋白在农杆菌中的表达第106页
        6.2.2 台盼蓝染色第106页
        6.2.3 基因沉默抑制子鉴定第106页
        6.2.4 二氨基联苯胺(DAB)染色第106页
        6.2.5 苯胺蓝染色第106-107页
        6.2.6 定量分析第107页
        6.2.7 亚细胞定位第107-108页
        6.2.8 抑制SWP11 诱导的寄主过敏性坏死反应的分泌蛋白筛选第108页
        6.2.9 抑制Bax和INF1 诱导的寄主过敏性坏死反应的分泌蛋白筛选第108页
    6.3 结果第108-118页
        6.3.1 SWP11 能够激发本氏烟的过敏性坏死反应第108-109页
        6.3.2 SWP11 不是一个基因沉默抑制子第109-110页
        6.3.3 SWP11 诱导植物过氧化氢的产生和胼胝质的积累第110-111页
        6.3.4 SWP11 诱导过敏性坏死和寄主防御反应相关的基因的表达第111-112页
        6.3.5 SWP11 的亚细胞定位第112-114页
        6.3.6 SWP11 N端序列为引起植物过敏性坏死的功能区第114-115页
        6.3.7 SWP11 的在寄主植物植原体中的表达规律第115-116页
        6.3.8 其他植原体中存在与SWP11 相似的蛋白第116页
        6.3.9 抑制SWP11 激发的过敏性坏死反应的分泌蛋白筛选第116-117页
        6.3.10 抑制其他激发子介导的过敏性坏死反应的分泌蛋白筛选第117-118页
    6.4 讨论第118-120页
第七章 全文结论及创新点第120-123页
    7.1 全文结论第120-121页
    7.2 创新点第121-122页
    7.3 展望第122-123页
参考文献第123-138页
附录第138-163页
缩略词第163-164页
致谢第164-165页
作者简介第165页

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