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基于空间弹性细杆模型的DNA平衡几何构型与稳定性研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第15-24页
    1.1 引言第15页
    1.2 DNA几何构型与力学性能的研究方法第15-16页
    1.3 弹性细杆模拟DNA分子的应用背景第16-18页
    1.4 弹性细杆力学研究的历史与现状第18-20页
    1.5 界面张力与拉压力对DNA平衡构型与稳定性的影响的研究意义第20-21页
    1.6 本文的主要研究工作与工作安排第21-24页
第二章 界面张力作用下DNA弹性细杆模型的Kirchhoff方程第24-35页
    2.1 引言第24页
    2.2 DNA弹性细杆的几何描述第24-27页
        2.2.1 曲线的几何学第24-26页
        2.2.2 曲杆的几何学第26-27页
    2.3 Kirchhoff基本假定与Kirchhoff方程第27-29页
        2.3.1 Kirchhoff基本假定第27-28页
        2.3.2 Kirchhoff方程第28-29页
    2.4 界面与Young-Laplace方程第29-32页
        2.4.1 界面层与相内区第29-30页
        2.4.2 界面张力和界面自由能第30-31页
        2.4.3 Young-Laplace方程第31-32页
    2.5 溶液与弹性细杆之间的界面张力第32-34页
    2.6 本章小结第34-35页
第三章 溶液浓度对DNA弹性细杆几何构型的影响第35-55页
    3.1 引言第35页
    3.2 溶液浓度对界面张力与DNA弹性模量的影响第35-39页
        3.2.1 溶液表面现象基本原理第35-36页
        3.2.2 Gibbs吸附方程与Langmuir吸附方程第36-37页
        3.2.3 溶液浓度对界面张力的影响第37页
        3.2.4 长链高分子的弹性第37-39页
        3.2.5 溶液浓度对弹性模量的影响第39页
    3.3 龙格-库塔数值算法(Runge-Kutta algor ithm)第39-43页
        3.3.1 泰勒级数展开法第40页
        3.3.2 龙格-库塔数值算法的基本思想第40-41页
        3.3.3 经典龙格-库塔算法第41-43页
    3.4 DNA弹性杆空间模型针对不同溶液浓度的计算结果及分析第43-54页
    3.5 本章小结第54-55页
第四章 界面张力与拉力作用下DNA的几何构型与弹性响应第55-69页
    4.1 引言第55页
    4.2 边值问题与打靶法第55-56页
    4.3 无约束最优化方法第56-62页
        4.3.1 搜索区间第56-58页
        4.3.2 黄金分割法第58-60页
        4.3.3 改进的鲍威尔法第60-62页
    4.4 边界条件与目标函数第62页
    4.5 模拟计算与分析第62-67页
    4.6 本章小结第67-69页
第五章 DNA螺旋线的Euler-Lagrange方程第69-80页
    5.1 引言第69页
    5.2 曲线变分的变分量第69-72页
    5.3 哈密顿原理与Lagrange方程第72-73页
    5.4 曲线的Euler-Lagrange方程第73-77页
    5.5 曲线的能量密度函数第77-79页
        5.5.1 能量密度函数只与曲线曲率k相关第77-78页
        5.5.2 能量密度函数与曲线的曲率k和挠率τ相关第78-79页
    5.6 本章小结第79-80页
第六章 杆截面的几何特性对DNA弹性细杆平衡构型的影响第80-96页
    6.1 引言第80页
    6.2 曲杆的Euler-Lagrange方程第80-82页
    6.3 弹性杆的应变能密度函数第82-85页
    6.4 弹性细杆模型描述A-, B-, Z-DNA的几何构型第85-92页
        6.4.1 B-DNA构象第85-86页
        6.4.2 A-DNA构象第86页
        6.4.3 Z-DNA构象第86-87页
        6.4.4 圆截面弹性细杆模型与A-, B-DNA第87-88页
        6.4.5 椭圆截面弹性细杆模型与Z-DNA第88-92页
    6.5 截面的几何特性对螺旋带影响第92-95页
        6.5.1 螺旋角第92-93页
        6.5.2 螺旋带第93-95页
    6.6 本章小结第95-96页
第七章 初始曲率与初始扭率对DNA弹性细杆在端部拉力作用下的平衡稳定性的影响第96-106页
    7.1 引言第96-97页
    7.2 端部力作用下DNA弹性细杆的Euler-Lagrange方程组第97-99页
    7.3 具有初始曲率与初始扭率的圆截面弹性细杆能量密度函数第99-101页
    7.4 DNA弹性细杆的拉伸稳定性第101-104页
    7.5 本章小结第104-106页
第八章 总结与展望第106-109页
    8.1 总结第106-108页
    8.2 展望第108-109页
参考文献第109-120页
致谢第120-121页
在学期间的研究成果及发表的学术论文第121页

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