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紫枝玫瑰花色变异的转录组分析

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第一章 文献综述第10-26页
    1 玫瑰概述第10-11页
    2 高效液相色谱技术(HPLC)概述第11页
    3 玫瑰花色研究第11-17页
        3.1 花色素的构成第11-12页
        3.2 玫瑰花色合成途径中及相关结构基因第12-17页
    4 转录组研究概述第17-23页
        4.1 转录组测序发展背景第17页
        4.2 测序技术的发展第17-18页
        4.3 第三代测序技术的发展第18页
        4.4 高通量测序技术在植物研究中的应用第18-22页
        4.5 数字基因表达谱技术第22-23页
    5 有关代谢途径的认知第23-24页
    6 研究目的、内容和技术路线第24-26页
        6.1 研究的目的和意义第24页
        6.2 主要研究内容第24-25页
        6.3 研究技术路线第25-26页
第二章 紫枝玫瑰及其花色变异品种花色素成分的定性和定量分析第26-33页
    1 材料与方法第26页
        1.1 试验材料与试剂第26页
    2 花色素成分的定性定量分析及鉴定第26-28页
    3 结果与分析第28-32页
        3.1 紫枝玫瑰及其花色变异品种花色素成分的定性定量分析第28-32页
    4 讨论第32-33页
第三章 紫枝玫瑰及其花色变异品种的转录组测序与基因表达谱分析第33-56页
    1 试验材料第33页
    2 试验方法第33-37页
        2.1 RNA-Seq生物信息学分析第34-35页
        2.2 Unigene功能注释第35-36页
        2.3 显著差异表达基因的筛选第36-37页
    3 结果与分析第37-54页
        3.1 转录组样品测序质量评估第37页
        3.2 Trinity组装第37-41页
        3.3 Unigene功能注释第41-46页
        3.4 unigene的代谢通路分析第46页
        3.5 编码蛋白框(CDS)预测第46-48页
        3.6 显著差异表达基因的分布与筛选第48-50页
        3.7 花色相关显著差异表达基因的通路分析第50-54页
    4 讨论第54-56页
第四章 紫枝玫瑰花色素成分生物合成关键基因的表达分析第56-64页
    1 材料与方法第56-61页
        1.1 试验材料第56页
        1.2 试验方法第56-61页
            1.2.1 RNA 提取第56-58页
            1.2.2 RT-PCR引物设计第58-59页
            1.2.3 cDNA的合成第59-60页
            1.2.4 qPCR反应第60-61页
    2 结果与分析第61-62页
    3 结论与讨论第62-64页
参考文献第64-70页
致谢第70-71页
攻读学位期间发表的学术论文第71-73页
附录第73-77页

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