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BER通路功能性SNP与鼻咽癌易感性的关联分析及其生物学功能研究

个人简历第1-8页
缩写对照第8-11页
中文摘要第11-23页
英文摘要第23-35页
第一部分 单碱基切除修复通路中关键基因的功能性SNP筛选及其与鼻咽癌的关联分析第35-59页
 前言第35-39页
 1. 材料、仪器及技术服务第39-40页
   ·材料第39-40页
   ·仪器第40页
   ·服务公司第40页
 2. 研究对象第40-41页
 3. 方法第41-45页
   ·利用生物信息学技术对碱基切除修复通路中关键基因的筛选第41-42页
   ·BER通路中基因中候选SNP位点的初步筛选第42-43页
   ·Taqman探针验证初筛的SNP位点第43-44页
   ·统计学分析第44-45页
 4. 结果第45-53页
   ·生物信息学筛选出BER通路各候选基因的tagSNP第45-46页
     ·候选基因中SNP初步筛选结果第46-49页
   ·hOGG1 rs1052133和hMUTYH rs3219472 SNP与NPC易感性关联分析验证第49-53页
   ·NPC细胞株HK1、HONE1、CNE1、CNE2、TWO3、HNE1、5-8F、6.10B、淋巴瘤细胞株Raji和正常鼻咽粘膜永生化细胞株的hOGG1rs1052133 SNP检测第53页
 5. 讨论第53-58页
 6. 结论第58-59页
第二部分 hOGG1 rs1052133多态性与鼻咽癌临床相关研究第59-86页
 前言第59-60页
 1. 材料和仪器第60-61页
   ·材料第60页
   ·仪器第60-61页
 2. 研究对象第61页
 3. 实验方法第61-70页
   ·免疫荧光染色第61-62页
   ·ELISA检测不同基因型NPC病人血清8-0HdG含量第62-63页
   ·实时荧光定量PCR检测hOGG1mRNA表达水平第63-67页
   ·hOGG1 rs1052133 SNP与NPC患者预后相关性研究第67-68页
   ·统计学分析第68-70页
 4. 结果第70-81页
   ·免疫荧光染色第70-72页
   ·ELISA检测不同基因型NPC患者血清8-OHdG含量第72-73页
   ·鼻咽部组织中hOGG1表达差异的检测第73-74页
   ·hOGG1 rs 1052133 SNP与371例NPC患者预后相关性第74-81页
 5. 讨论第81-85页
 6. 结论第85-86页
第三部分 hOGG1 rs1052133多态性与鼻咽癌关联性的体外功能研究第86-135页
 前言第86-88页
 1. 材料、仪器及服务公司第88-90页
   ·材料第88-89页
   ·仪器第89-90页
   ·技术服务公司第90页
 2. 实验方法第90-110页
   ·实时荧光测定不同鼻咽癌细胞系及永生化正常鼻咽部细胞系hOGG1表达第90-94页
   ·hOGG1基因表达载体的慢病毒包装第94-95页
   ·慢病毒感染HK1细胞第95-96页
   ·转染效率及目标基因测序鉴定第96-102页
   ·HK1、N-HK1、OGG1-CC-HK1、OGG1-GG-HK1正常培养状态下增殖活力检测第102-103页
   ·低剂量5-ALA-PDT损伤后不同细胞修复能力的检测第103-104页
   ·细胞内免疫印迹(in-cell Western,ICW)检测5-ALA-PDT后8-OHdG/hOGG1含量变化第104-106页
   ·ELISA检测5-ALA-PDT处理后细胞培养液上清中8-OHdG含量第106-107页
   ·流式细胞仪细胞周期检测第107-108页
   ·转录组测序第108-110页
   ·统计学方法第110页
 3. 实验结果第110-127页
   ·各个鼻咽癌和鼻咽正常细胞株中hOGG1mRNA表达水平的差异第110-111页
   ·慢病毒N-HK1,OGG1-CC-HK1,OGG1-GG-HK1细胞的构建第111-115页
   ·无应激压力时细胞株生长曲线第115-116页
   ·MTT观察氧化应激损伤情况下细胞修复能力变化第116-117页
   ·ELISA测试5-ALA-PDT后各组细胞上清液及细胞内8-OHdG的表达情况第117-119页
   ·流式细胞仪检测细胞周期变化第119-122页
   ·转录组测序结果第122-127页
 4. 讨论第127-134页
 5. 结论第134-135页
第四部分 hOGG1rs1052133多态性在荷瘤裸鼠体内的功能研究第135-141页
 前言第135-136页
 1. 材料和仪器第136-137页
   ·材料第136页
   ·主要仪器第136-137页
 2 实验方法第137-138页
   ·细胞培养第137页
   ·动物分组第137页
   ·细胞准备与接种第137页
   ·成瘤效果观察第137页
   ·实时荧光定量PCR检测移植瘤内hOGG1mRNA水平第137-138页
   ·统计学分析第138页
 3. 结果第138-139页
   ·移植瘤成瘤情况第138-139页
   ·移植瘤中hOGG1mRNA表达差异第139页
 4. 讨论第139-140页
 5. 结论第140-141页
参考文献第141-149页
文献综述 碱基切除修复基因单核苷酸多态性与头颈部恶性肿瘤易感性的研究进展第149-174页
 参考文献第166-174页
致谢第174-175页
攻读博士学位期间的主要研究成果第175页

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