| 附件 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 英文缩略表 | 第14-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-27页 |
| ·研究背景 | 第15页 |
| ·研究的目的和意义 | 第15页 |
| ·国内外研究进展 | 第15-27页 |
| ·产甲烷条件下降解石油烃的微生物 | 第15-18页 |
| ·互营菌的代谢特点与保守结构域 | 第18-21页 |
| ·宏基因组研究策略 | 第21-27页 |
| 第二章 中温正十六烷烃厌氧降解产甲烷富集物群落分析 | 第27-34页 |
| ·实验目的 | 第27页 |
| ·材料和方法 | 第27-30页 |
| ·样品来源 | 第27页 |
| ·仪器和试剂 | 第27-28页 |
| ·培养基 | 第28页 |
| ·实验方法 | 第28-30页 |
| ·结果 | 第30-32页 |
| ·样品概况 | 第30-31页 |
| ·微生物群落分析 | 第31-32页 |
| ·讨论 | 第32-34页 |
| 第三章 ‘Candidatus Smithella cisternae’基因组获得与遗传特性研究 | 第34-62页 |
| ·实验目的与技术路线 | 第34-35页 |
| ·实验目的 | 第34页 |
| ·技术路线 | 第34-35页 |
| ·材料和方法 | 第35-36页 |
| ·样品来源 | 第35页 |
| ·仪器与试剂 | 第35页 |
| ·实验方法 | 第35-36页 |
| ·实验结果 | 第36-60页 |
| ·序列过滤 | 第36-37页 |
| ·序列拼接 | 第37-38页 |
| ·宏基因组基因概况 | 第38-40页 |
| ·基因组聚类 | 第40-43页 |
| ·菌株M82_1 基因组注释 | 第43-60页 |
| ·讨论 | 第60-62页 |
| ·draft genome中gaps的填补 | 第60页 |
| ·烷烃的起始降解机制 | 第60页 |
| ·代谢产物丁酰Co A、乙酰Co A、丙酰Co A的循环利用 | 第60-61页 |
| ·延胡索酸的回补 | 第61-62页 |
| 第四章 结论、不足与展望 | 第62-64页 |
| ·全文总结 | 第62-63页 |
| ·中温正十六烷烃厌氧降解产甲烷富集物群落分析 | 第62页 |
| ·中温正十六烷烃厌氧降解产甲烷富集物宏基因组分析 | 第62-63页 |
| ·工作不足与展望 | 第63-64页 |
| ·未获得其他菌的基因组 | 第63页 |
| ·实验验证 | 第63页 |
| ·分离出单菌 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-71页 |
| 附录 | 第71-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 作者简历 | 第81页 |
