| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-29页 |
| ·鱼类肠道菌群结构与环境微生态分析 | 第13-15页 |
| ·鱼类肠道微生物的组成 | 第13-14页 |
| ·鱼类肠道微生物与环境 | 第14-15页 |
| ·大菱鲆养殖常见细菌性病原菌 | 第15-19页 |
| ·弧菌属病原 | 第15-17页 |
| ·迟缓爱德华氏菌 | 第17-18页 |
| ·其他细菌性病原 | 第18-19页 |
| ·常见海水病原菌的毒力因子 | 第19-24页 |
| ·细菌表面成分 | 第19-20页 |
| ·多型分泌系统 | 第20-21页 |
| ·胞外分泌细胞毒素 | 第21-23页 |
| ·毒力调控基因 | 第23页 |
| ·胞外蛋白酶 | 第23-24页 |
| ·铁吸收系统 | 第24页 |
| ·病原菌检测技术的研究进展 | 第24-27页 |
| ·基于核酸扩增的检测技术 | 第25-26页 |
| ·免疫检测技术 | 第26页 |
| ·基因探针技术 | 第26-27页 |
| ·本论文研究目的及研究内容 | 第27-29页 |
| 第二章 养殖大菱鲆腹水病病原菌分离鉴定 | 第29-42页 |
| ·前言 | 第29页 |
| ·材料和方法 | 第29-32页 |
| ·病原菌的分离和培养 | 第29-30页 |
| ·病原菌致病性的初步判断 | 第30页 |
| ·DNA提取和分子鉴定 | 第30-31页 |
| ·人工感染实验 | 第31页 |
| ·药物敏感性实验 | 第31-32页 |
| ·结果 | 第32-40页 |
| ·患腹水病大菱鲆幼鱼的病变特征 | 第32页 |
| ·病原菌的分离和鉴定 | 第32-33页 |
| ·初步感染实验结果 | 第33-35页 |
| ·分离株分子鉴定及系统发育树构建 | 第35-37页 |
| ·人工感染实验及半致死浓度的确定 | 第37-39页 |
| ·抗药性测试 | 第39-40页 |
| ·讨论 | 第40页 |
| ·小结 | 第40-42页 |
| 第三章 海水养殖环境中细菌多样性分析及潜在病原弧菌探究 | 第42-62页 |
| ·前言 | 第42-43页 |
| ·材料与方法 | 第43-47页 |
| ·养殖环境样本的采集 | 第43页 |
| ·养殖环境细菌 16S rRNA基因宏基因组测序 | 第43-44页 |
| ·环境分离株的分子鉴定及毒力相关基因检测 | 第44-47页 |
| ·生理生化活性检测 | 第47页 |
| ·人工感染实验 | 第47页 |
| ·结果 | 第47-58页 |
| ·养殖环境细菌 16S rRNA基因宏基因组测序结果 | 第47-51页 |
| ·养殖环境细菌分离情况 | 第51-54页 |
| ·初步感染实验结果 | 第54-55页 |
| ·潜在病原菌的毒力相关基因携带情况 | 第55-58页 |
| ·讨论 | 第58-60页 |
| ·小结 | 第60-62页 |
| 第四章 基于多重PCR技术的水产病原菌寡核苷酸芯片检测体系的优化 | 第62-78页 |
| ·前言 | 第62-63页 |
| ·材料和方法 | 第63-68页 |
| ·菌株信息 | 第63页 |
| ·引物及探针设计 | 第63-64页 |
| ·多重PCR扩增和标记 | 第64页 |
| ·基因芯片的制备 | 第64-65页 |
| ·芯片的杂交及检测 | 第65页 |
| ·芯片杂交条件探究 | 第65-66页 |
| ·芯片经济性优化 | 第66页 |
| ·不同芯片点样液的效果探究 | 第66-68页 |
| ·优化后的芯片特异性和灵敏性检测 | 第68页 |
| ·统计分析 | 第68页 |
| ·结果 | 第68-75页 |
| ·杂交时长对芯片检测的影响 | 第68-69页 |
| ·杂交温度对芯片检测的影响 | 第69-70页 |
| ·芯片经济性优化 | 第70-72页 |
| ·不同点样液的杂交效果 | 第72-74页 |
| ·优化后的芯片特异性检验 | 第74页 |
| ·优化后的芯片灵敏度检测 | 第74-75页 |
| ·讨论 | 第75-77页 |
| ·小结 | 第77-78页 |
| 第五章 水产病原微生物寡核苷酸检测芯片体系的建立与评价 | 第78-91页 |
| ·前言 | 第78页 |
| ·材料和方法 | 第78-85页 |
| ·实验材料 | 第78-79页 |
| ·引物及探针设计 | 第79-83页 |
| ·基因芯片的制备 | 第83页 |
| ·全基因组DNA的提取 | 第83-84页 |
| ·PCR扩增与荧光标记 | 第84页 |
| ·芯片杂交及检测 | 第84页 |
| ·检测患病大菱鲆中病原微生物的不同方法的评价 | 第84-85页 |
| ·结果 | 第85-88页 |
| ·基因扩增电泳检测结果 | 第85页 |
| ·基因芯片检测结果 | 第85-86页 |
| ·患病大菱鲆病原微生物检测结果 | 第86-88页 |
| ·讨论 | 第88-89页 |
| ·小结 | 第89-91页 |
| 第六章 总结与展望 | 第91-93页 |
| ·总结 | 第91-92页 |
| ·展望 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-102页 |
| 攻读硕士学位期间撰写的论文 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103页 |
