| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-19页 |
| ·课题背景 | 第13-15页 |
| ·课题研究的内容及意义 | 第15-16页 |
| 参考文献 | 第16-19页 |
| 第二章 计算化学方法的计算瓶颈与 GPU 计算基础 | 第19-33页 |
| 引言 | 第19页 |
| ·基于量子力学的计算化学方法 | 第19-22页 |
| ·从头算方法（Ab initio Method） | 第19-20页 |
| ·密度泛函理论（Density Functional Theory，DFT） | 第20页 |
| ·从头算方法和密度泛函理论的计算瓶颈 | 第20-21页 |
| ·半经验计算方法（Semi-empirical Method） | 第21页 |
| ·GPU 计算突破量子化学计算瓶颈 | 第21-22页 |
| ·分子动力学 | 第22-25页 |
| ·分子力场 | 第22-23页 |
| ·分子动力学 | 第23-24页 |
| ·分子动力学中的计算问题 | 第24-25页 |
| ·并行计算 | 第25页 |
| ·GPU 通用计算 | 第25-28页 |
| ·CUDA 架构 | 第28-31页 |
| 参考文献 | 第31-33页 |
| 第三章 GPU 计算化学程序的发展及在 QM/MM 计算中的尝试 | 第33-48页 |
| ·计算化学在 GPU 上实现的方法和算法 | 第33-34页 |
| ·基于 GPU 的计算化学程序 | 第34-38页 |
| ·量子化学程序 TeraChem | 第34-35页 |
| ·GPU 分子动力学程序 | 第35-38页 |
| ·GPU 在 AceK 解离机理 QM/MM 计算中的尝试 | 第38-43页 |
| ·计算程序的安装 | 第40-41页 |
| ·GPU QM/MM 计算的实现 | 第41-43页 |
| ·结语 | 第43页 |
| 参考文献 | 第43-48页 |
| 第四章 半经验方法在 GPU 上的实现 | 第48-60页 |
| ·引言 | 第48页 |
| ·半经验方法和计算 | 第48-50页 |
| ·半经验计算在 GPU 上的实现 | 第50-56页 |
| ·结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
| 第五章 从头算方法双电子排斥积分算法在 GPU 上的实现 | 第60-73页 |
| ·引言 | 第60页 |
| ·双电子排斥积分 | 第60-63页 |
| ·双电子排斥积分的 CPU 和 GPU 程序实现 | 第63-70页 |
| ·结语 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-73页 |
| 攻读学位期间发表文章和学术活动情况 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
