| 缩略词 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 前言 | 第13-15页 |
| 材料与方法 | 第15-24页 |
| 1 实验菌株 | 第15页 |
| 2 主要试剂和仪器 | 第15页 |
| 3 主要应用软件 | 第15-16页 |
| 4 菌株分离培养与生化鉴定 | 第16-17页 |
| 5 TIANamp bacteria DNA kit提取测序菌株全基因组DNA及分子生物学鉴定 | 第17-19页 |
| 6 PCR法检测毒素基因(genotyping) | 第19页 |
| 7 Multilocus sequence typing(MLST) | 第19-20页 |
| 8 Sanger测序tcdA和tcdB | 第20-22页 |
| 9 其他菌株序列的获得 | 第22页 |
| 10 95株艰难梭菌tcdA和tcdB序列的数据分析 | 第22-23页 |
| 11 引物比对 | 第23页 |
| 12 引物设计和菌株验证 | 第23-24页 |
| 结果 | 第24-41页 |
| 1 基本信息 | 第24-25页 |
| 2 tcdA序列分析 | 第25-30页 |
| 3 tcdB序列分析 | 第30-34页 |
| 4 进化分析 | 第34-35页 |
| 5 引物比对结果 | 第35-39页 |
| 6 引物设计并验证结果 | 第39-41页 |
| 讨论 | 第41-43页 |
| 小结 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-47页 |
| 综述 | 第47-58页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 附录 | 第58-74页 |
| 附录1 菌株信息 | 第58-61页 |
| 附录2 管家基因信息 | 第61-62页 |
| 附录3 引物信息 | 第62-64页 |
| 附录4 数据库获取的菌株信息 | 第64-65页 |
| 附录5 1991-2011年检测tcdA/tcdB的引物及其相关文献 | 第65-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 攻读硕士学位期间获奖及发表的学术论文 | 第75页 |
