| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 目录 | 第9-13页 |
| 第一章 综述 | 第13-44页 |
| 1. 我国海洋贝类养殖业概况 | 第13-14页 |
| 2. 贝类遗传育种的理论基础 | 第14-19页 |
| ·育种性状的选择 | 第14页 |
| ·选配制度 | 第14-15页 |
| ·遗传力 | 第15-16页 |
| ·杂种优势 | 第16页 |
| ·配合力 | 第16-17页 |
| ·近交衰退 | 第17-18页 |
| ·基因型与环境互作 | 第18页 |
| ·贝类遗传育种技术路线 | 第18-19页 |
| 3. 海洋贝类遗传育种研究进展 | 第19-26页 |
| ·选择育种 | 第19-21页 |
| ·杂交育种 | 第21-22页 |
| ·细胞工程育种 | 第22-23页 |
| ·分子标记辅助选择育种 | 第23-25页 |
| ·分子标记连锁图谱的构建 | 第24页 |
| ·QTL 定位 | 第24-25页 |
| ·基因组选择育种 | 第25-26页 |
| 4. 分子标记技术 | 第26-40页 |
| ·分子标记类型 | 第26-36页 |
| ·微卫星标记技术 | 第27-30页 |
| ·微卫星概述 | 第27-29页 |
| ·微卫星标记的优缺点 | 第29-30页 |
| ·SNP 标记技术 | 第30-36页 |
| ·SNP 概述 | 第30-31页 |
| ·SNP 开发 | 第31-33页 |
| ·SNP 检测技术 | 第33-36页 |
| ·分子标记在贝类遗传育种中的应用 | 第36-40页 |
| ·贝类遗传多样性分析 | 第36-37页 |
| ·贝类亲缘关系研究 | 第37-38页 |
| ·贝类遗传连锁图谱构建 | 第38页 |
| ·贝类 QTL 定位 | 第38-39页 |
| ·贝类分子标记辅助选育 | 第39-40页 |
| 5. 文蛤遗传育种研究背景 | 第40-43页 |
| ·文蛤的特性 | 第40页 |
| ·文蛤的养殖和苗种培育 | 第40-41页 |
| ·文蛤分子育种的相关基础研究现状 | 第41-43页 |
| 6. 研究目的与意义 | 第43-44页 |
| 第二章 人工繁育条件下文蛤亲本贡献率和有效群体大小评估 | 第44-56页 |
| 1. 前言 | 第44-45页 |
| 2. 实验材料和方法 | 第45-49页 |
| ·文蛤 3×3 完全双列杂交实验设计 | 第45-46页 |
| ·幼虫养成 | 第46页 |
| ·样品收集和 DNA 准备 | 第46页 |
| ·微卫星分析 | 第46-48页 |
| ·遗传多样性分析 | 第48页 |
| ·亲权分析 | 第48页 |
| ·数据分析 | 第48-49页 |
| 3. 结果 | 第49-53页 |
| ·模拟分析和亲权鉴定 | 第49-50页 |
| ·亲本和子代的遗传多样性 | 第50页 |
| ·亲本贡献率 | 第50-52页 |
| ·有效亲本数量 | 第52-53页 |
| 4. 讨论 | 第53-56页 |
| 第三章 基于微卫星标记揭示的文蛤小群体近交的遗传效应 | 第56-68页 |
| 1. 前言 | 第56-57页 |
| 2. 实验材料和方法 | 第57-60页 |
| ·实验设计和取样 | 第57-58页 |
| ·微卫星分析 | 第58-59页 |
| ·数据分析 | 第59-60页 |
| ·模拟分析 | 第60页 |
| 3. 结果 | 第60-65页 |
| ·遗传多样性分析 | 第60-61页 |
| ·近交系数和近交衰退 | 第61-63页 |
| ·全同胞交配中的遗传漂变 | 第63-64页 |
| ·不同亲本数量（Ne）下的杂合度变化趋势模拟 | 第64-65页 |
| 4. 讨论 | 第65-68页 |
| 第四章 基于文蛤家系双列杂交的配合力和杂种优势研究 | 第68-77页 |
| 1. 前言 | 第68-69页 |
| 2. 实验材料和方法 | 第69-70页 |
| ·家系建立和实验设计 | 第69页 |
| ·取样和数据记录 | 第69页 |
| ·统计分析 | 第69-70页 |
| 3. 结果 | 第70-74页 |
| ·方差分析 | 第70-71页 |
| ·不同组合及环境间的生长表现差异 | 第71-72页 |
| ·配合力分析 | 第72-73页 |
| ·杂种优势 | 第73-74页 |
| 4. 讨论 | 第74-77页 |
| 第五章 文蛤生长性状相关 SNP 标记的开发和鉴定 | 第77-90页 |
| 1. 前言 | 第77-78页 |
| 2. 实验材料和方法 | 第78-84页 |
| ·文蛤群体和样品收集 | 第78-79页 |
| ·DNA 样品准备 | 第79页 |
| ·候选的生长相关 EST-SNP 筛选 | 第79-80页 |
| ·多重 SNaPshot 分型 | 第80-83页 |
| ·遗传多样性分析 | 第83页 |
| ·SNP 与生长性状的关联分析 | 第83-84页 |
| 3. 结果 | 第84-88页 |
| ·SNP 开发 | 第84-85页 |
| ·生长比较 | 第85页 |
| ·遗传多样性 | 第85-86页 |
| ·SNP 与生长性状的关联分析 | 第86-87页 |
| ·生长相关 SNP 的功能注释 | 第87-88页 |
| 4. 讨论 | 第88-90页 |
| 第六章 长链酯酰辅酶 A 合成酶 1 基因的克隆以及与文蛤生长的相关分析 | 第90-110页 |
| 1. 前言 | 第90-91页 |
| 2. 实验材料和方法 | 第91-98页 |
| ·文蛤材料和样本收集 | 第91页 |
| ·文蛤饥饿实验 | 第91页 |
| ·RNA 提取和 cDNA 合成 | 第91-92页 |
| ·文蛤 ACSL 基因的克隆 | 第92-95页 |
| ·MmeACSL1 基因的序列分析 | 第95页 |
| ·MmeACSL1 基因在不同组织以及不同营养条件下的表达 | 第95-96页 |
| ·MmeACSL1 基因的 SNP 鉴定和分型 | 第96-97页 |
| ·数据分析 | 第97-98页 |
| 3. 结果 | 第98-106页 |
| ·MmeACSL1 基因的序列分析 | 第98-102页 |
| ·MmeACSL1 基因在文蛤不同组织中的表达 | 第102页 |
| ·MmeACSL1 基因在不同营养条件下的表达 | 第102-103页 |
| ·MmeACSL1 基因中的 SNP 鉴定 | 第103-104页 |
| ·SNP 和单倍型与生长性状的关联分析 | 第104-106页 |
| 4. 讨论 | 第106-110页 |
| 第七章 文蛤细胞周期蛋白依赖性激酶 10 基因的鉴定及其 SNPs 与生长性状的关联分析 | 第110-120页 |
| 1. 前言 | 第110-111页 |
| 2. 实验材料和方法 | 第111-113页 |
| ·文蛤材料和样本收集 | 第111页 |
| ·RNA 提取和 cDNA 合成 | 第111页 |
| ·文蛤 CDK 基因的克隆 | 第111页 |
| ·MmeCDK10 基因的序列分析 | 第111-112页 |
| ·MmeCDK10 基因在不同组织中的表达 | 第112页 |
| ·MmeCDK10 基因的 SNP 鉴定和分型 | 第112-113页 |
| ·数据分析 | 第113页 |
| 3. 结果 | 第113-118页 |
| ·MmeCDK10 基因的序列分析 | 第113页 |
| ·MmeCDK10 基因在文蛤不同组织中的表达 | 第113-114页 |
| ·MmeCDK10 基因中的 SNP 鉴定 | 第114-117页 |
| ·SNP 与生长性状的关联分析 | 第117-118页 |
| 4. 讨论 | 第118-120页 |
| 结论 | 第120-121页 |
| 参考文献 | 第121-147页 |
| 个人简历 | 第147-148页 |
| 在学期间发表和完成的文章 | 第148-149页 |
| 致谢 | 第149-150页 |
