苹果轮纹病抗性相关miRNA的筛选
| 目录 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-31页 |
| 1 苹果轮纹病研究进展 | 第13-17页 |
| ·苹果轮纹病菌生物学特性、发病症状及规律 | 第13-14页 |
| ·苹果轮纹病菌的病原 | 第13页 |
| ·苹果轮纹病的发病症状 | 第13-14页 |
| ·苹果轮纹病的发病规律 | 第14页 |
| ·轮纹病菌在苹果枝干及果实上的侵入途径 | 第14-16页 |
| ·品种抗病性机制 | 第16-17页 |
| ·果实中内含物的变化与抗病性的关系 | 第16-17页 |
| ·皮孔组织与抗病性的关系 | 第17页 |
| 2 miRNA概述 | 第17-25页 |
| ·miRNA的概念 | 第17页 |
| ·miRNA的形成 | 第17-19页 |
| ·miRNA前体的转录 | 第18页 |
| ·miRNA的加工和运输 | 第18-19页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第19页 |
| ·植物miRNA的特点 | 第19-20页 |
| ·植物miRNA与动物miRNA的比较 | 第19-20页 |
| ·植物miRNA与siRNA的比较 | 第20页 |
| ·植物miRNA的功能 | 第20-22页 |
| ·miRNA与植物生长发育 | 第20-21页 |
| ·miRNA与植物逆境胁迫 | 第21-22页 |
| ·miRNA与植物激素调节及信号转导 | 第22页 |
| ·miRNA的研究手段 | 第22-25页 |
| ·遗传学筛选法 | 第22-23页 |
| ·miRNA的克隆 | 第23-24页 |
| ·生物信息学方法 | 第24页 |
| ·基因芯片 | 第24页 |
| ·高通量测序 | 第24-25页 |
| 3 本研究的研究目的意义 | 第25-26页 |
| 参考文献 | 第26-31页 |
| 第二章 高通量测序“富士苹果”中的miRNA | 第31-45页 |
| 摘要 | 第31-32页 |
| 1 材料和方法 | 第32-36页 |
| ·实验材料 | 第32页 |
| ·植物材料 | 第32页 |
| ·菌株 | 第32页 |
| ·主要生化试剂 | 第32页 |
| ·总RNA的提取 | 第32页 |
| ·LMW RNA的提取 | 第32页 |
| ·3'末端加poly(A) | 第32-33页 |
| ·cDNA的合成 | 第33页 |
| ·小RNA cDNA文库的构建和测序 | 第33页 |
| ·生物信息学的分析 | 第33页 |
| ·富士苹果miRNA靶基因的预测 | 第33-34页 |
| ·半定量PCR检测新的miRNA | 第34-36页 |
| ·miRNA目的片段的回收 | 第34页 |
| ·目的片段和载体的连接 | 第34页 |
| ·目的片段的转化、克隆及测序 | 第34-36页 |
| 2 结果分析 | 第36-41页 |
| ·富士苹果小RNA的测序分析 | 第36-37页 |
| ·富士苹果中已知家族miRNA的鉴定 | 第37-40页 |
| ·富士苹果中新的miRNA | 第40页 |
| ·靶基因预测 | 第40页 |
| ·检测新的miRNA的表达分析 | 第40-41页 |
| 3 讨论 | 第41-43页 |
| 参考文献 | 第43-45页 |
| 第三章 高通量测序“湖北海棠”中miRNA | 第45-59页 |
| 摘要 | 第45-46页 |
| 1 材料和方法 | 第46-49页 |
| ·实验材料 | 第46页 |
| ·植物材料 | 第46页 |
| ·菌株 | 第46页 |
| ·主要生化试剂 | 第46页 |
| ·总RNA的提取 | 第46页 |
| ·LMW RNA的提取 | 第46页 |
| ·3'末端加poly(A) | 第46页 |
| ·cDNA的合成 | 第46-47页 |
| ·小RNA cDNA文库的构建和测序 | 第47页 |
| ·生物信息学的分析 | 第47页 |
| ·湖北海棠miRNA靶基因的预测 | 第47页 |
| ·半定量PCR检测新的miRNA | 第47-49页 |
| ·miRNA目的片段的回收 | 第47页 |
| ·目的片段和载体的连接 | 第47页 |
| ·目的片段的转化、克隆及测序 | 第47-49页 |
| 2 结果分析 | 第49-55页 |
| ·湖北海棠中小RNA的测序分析 | 第49-50页 |
| ·湖北海棠中已知家族miRNA的鉴定 | 第50-53页 |
| ·湖北海棠中新的miRNA的发现 | 第53页 |
| ·靶基因的预测 | 第53页 |
| ·检测新的miRNA的表达 | 第53-55页 |
| 3 讨论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-59页 |
| 第四章 富士苹果和湖北海棠中miRNA比较 | 第59-71页 |
| 摘要 | 第59-60页 |
| 1 材料和方法 | 第60-62页 |
| ·实验材料 | 第60页 |
| ·植物材料 | 第60页 |
| ·主要生化试剂 | 第60页 |
| ·LMW RNA的提取 | 第60页 |
| ·3'末端加poly(A) | 第60页 |
| ·cDNA的合成 | 第60页 |
| ·荧光定量PCR检测表达差异的miRNA | 第60-62页 |
| 2 结果分析 | 第62-67页 |
| ·知家族miRNA的比较 | 第62-65页 |
| ·新的候选miRNA的比较 | 第65页 |
| ·荧光定量PCR分析差异表达的miRNA | 第65-67页 |
| ·差异表达的miRNA的靶基因的分析 | 第67页 |
| 3 讨论 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 第五章 高通量测序苹果轮纹病侵染相关miRNA | 第71-87页 |
| 摘要 | 第71-72页 |
| 1 材料和方法 | 第72-75页 |
| ·实验材料 | 第72页 |
| ·植物材料 | 第72页 |
| ·菌株 | 第72页 |
| ·主要生化试剂 | 第72页 |
| ·总RNA的提取 | 第72-73页 |
| ·LMW RNA的提取 | 第73页 |
| ·3'末端加poly(A) | 第73页 |
| ·cDNA的合成 | 第73页 |
| ·小RNA cDNA文库的构建和测序 | 第73页 |
| ·生物信息学的分析 | 第73页 |
| ·湖北海棠miRNA靶基因的预测 | 第73页 |
| ·荧光定量PCR检测表达差异的miRNA | 第73-75页 |
| 2 结果分析 | 第75-81页 |
| ·高通量测序小RNA | 第75-76页 |
| ·知家族miRNA的鉴定 | 第76-79页 |
| ·新的miRNA | 第79页 |
| ·检测miRNA的表达差异 | 第79-80页 |
| ·与轮纹病菌相关miRNA靶基因的预测 | 第80-81页 |
| 3 讨论 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-87页 |
| 附件 | 第87-107页 |
| 全文结论 | 第107-109页 |
| 创新点 | 第109-111页 |
| 攻读硕士期间发表论文 | 第111-113页 |
| 致谢 | 第113页 |
