组合虚拟筛选发现选择性雌激素受体β配体和对硝基苄基酯酶及突变体的分子模拟研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第1章 计算机辅助药物设计概述 | 第9-20页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·虚拟筛选 | 第10-14页 |
| ·基于蛋白受体的虚拟筛选 | 第10-12页 |
| ·基于小分子配体的虚拟筛选 | 第12-14页 |
| ·同源模建 | 第14-15页 |
| ·分子动力学 | 第15-17页 |
| ·预测分子的类药性 | 第17-19页 |
| ·论文的总体安排 | 第19-20页 |
| 第2章 组合虚拟筛选发现选择性雌激素受体p配体 | 第20-41页 |
| ·引言 | 第20-29页 |
| ·雌激素受体的分布与结构 | 第20-22页 |
| ·雌激素受体的作用机制 | 第22-23页 |
| ·不同效应的配体作用下的ER LBD构象 | 第23-27页 |
| ·ERs的生理功能与配体 | 第27-29页 |
| ·实验方法 | 第29-32页 |
| ·小分子数据库的准备 | 第30页 |
| ·蛋白受体的准备 | 第30页 |
| ·虚拟筛选 | 第30-31页 |
| ·体外的激动和拮抗活性测试 | 第31-32页 |
| ·结果和讨论 | 第32-40页 |
| ·虚拟筛选方法的验证 | 第32页 |
| ·虚拟筛选结果 | 第32-37页 |
| ·虚拟筛选分析与讨论 | 第37-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第3章 对硝基苄基酯酶及突变体的分子模拟研究 | 第41-56页 |
| ·引言 | 第41-46页 |
| ·酯酶的分类 | 第41页 |
| ·酯酶的分子结构 | 第41-42页 |
| ·酯酶的催化机理 | 第42-45页 |
| ·酯酶的应用 | 第45-46页 |
| ·实验方法 | 第46-47页 |
| ·蛋白模型的构建 | 第46页 |
| ·蛋白模型的结构优化 | 第46-47页 |
| ·蛋白模型的准备 | 第47页 |
| ·底物小分子的准备 | 第47页 |
| ·分子对接与MM-GBSA自由能计算 | 第47页 |
| ·结果与讨论 | 第47-54页 |
| ·同源模建结果与讨论 | 第47-49页 |
| ·分子对接与自由能计算结果与讨论 | 第49-54页 |
| ·本章小结 | 第54-56页 |
| 第4章 全文总结 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-67页 |
| 研究生期间发表论文 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
