| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第10-23页 |
| ·BACKGROUND | 第10-18页 |
| ·Chimerie RNA mechanisms | 第11-16页 |
| ·Splicing | 第12-14页 |
| ·Chromosomal Translocation | 第14-16页 |
| ·Sequencing Technologies for chimeric RNA Identification | 第16-18页 |
| ·LITERATURE REVIEW | 第18-22页 |
| ·Current study of chimeric RNA in humans,mice and fruit flies | 第18-19页 |
| ·Current study of chimerie RNA in pigs | 第19-20页 |
| ·Current Studies of Transcriptomes in Skeletal Muscles of Pigs | 第20-22页 |
| ·OBJECTIVE | 第22-23页 |
| CHAPTER 2 MATERIALS AND METHODS | 第23-35页 |
| ·MATERIALS AND METHODS | 第23-35页 |
| ·Animals and tissue preparation | 第23页 |
| ·Equipments and Reagents | 第23-24页 |
| ·The following apparatus were used | 第23页 |
| ·Reagent and Materials | 第23-24页 |
| ·RNA Extraction | 第24-25页 |
| ·DNaseⅠDigestion of RNA before RNA Cleanup | 第25页 |
| ·RNA Purification | 第25-26页 |
| ·cDNA library preparation | 第26页 |
| ·Trinity method | 第26-28页 |
| ·The pipeline of generation of chimeric RNA | 第28页 |
| ·Reverse Transcription(cDNA synthesis) | 第28页 |
| ·PCR | 第28-29页 |
| ·DNA Recovery | 第29页 |
| ·Cloning,Enzyme digestion,ligation and transformation | 第29-30页 |
| ·Cloning | 第29页 |
| ·Enzyme digestion | 第29-30页 |
| ·Ligation | 第30页 |
| ·Transformation | 第30页 |
| ·Real-time Quantitative PCR | 第30-31页 |
| ·Plasmid Extraction | 第31-32页 |
| ·Cell culture | 第32-33页 |
| ·Cell Recovery | 第32页 |
| ·Cell passage | 第32-33页 |
| ·Cell frozen | 第33页 |
| ·G418 concentration screen | 第33页 |
| ·Plasmid DNA Transfection and G418 selection | 第33页 |
| ·CCK-8 | 第33-35页 |
| CHAPTER 3 RESULTS AND ANALYSIS | 第35-47页 |
| ·RESULTS AND ANALYSIS | 第35-47页 |
| ·RNA Quality | 第35页 |
| ·Output Statistics of RNA-Seq | 第35页 |
| ·The output of Trinity | 第35-36页 |
| ·COG Classification | 第36-37页 |
| ·The result of candidate chimeric RNA | 第37-39页 |
| ·The confirmation of porcine chimeric RNA | 第39页 |
| ·The expression of chimeric RNA during skeletal muscle development | 第39-40页 |
| ·The tissue expression of top1 chimeric RNA | 第40-41页 |
| ·The clone of top1 chimeric RNA | 第41-42页 |
| ·Vector construction | 第42-43页 |
| ·G418 concentration screen | 第43-44页 |
| ·The over expression of top1 chimeric RNA | 第44页 |
| ·The expression of Myog and MHC | 第44-45页 |
| ·Cell proliferation assay | 第45-47页 |
| DISCUSSION AND CONCLUSION | 第47-50页 |
| APPENDIX | 第50-51页 |
| REFERENCES | 第51-58页 |
| ACKNOWLEDGMENTS | 第58-59页 |
| DEDICATION | 第59-60页 |
| RESUME | 第60页 |
