| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 前言 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-35页 |
| ·植物基因组研究进展 | 第15-24页 |
| ·DNA测序技术 | 第15-18页 |
| ·植物基因组测序 | 第18-22页 |
| ·植物基因组重测序研究进展 | 第22-24页 |
| ·基因组数据库研究进展 | 第24-25页 |
| ·基因组数据库的分类及特点 | 第24页 |
| ·世界上大型生物信息数据库现状 | 第24-25页 |
| ·植物miRNA研究进展 | 第25-32页 |
| ·miRNA合成与作用方式 | 第25-27页 |
| ·植物miRNA功能 | 第27-30页 |
| ·miRNA分离与鉴定 | 第30-32页 |
| ·植物EST-SSR研究进展 | 第32-35页 |
| 第二章 不结球白菜基因组数据库的构建 | 第35-47页 |
| 摘要 | 第35页 |
| ABSTRACT | 第35-36页 |
| ·材料与方法 | 第36-39页 |
| ·硬件平台 | 第36页 |
| ·Linux集群系统构建 | 第36-37页 |
| ·网络服务器及数据库管理系统 | 第37页 |
| ·不结球白菜基因组数据库构建 | 第37页 |
| ·数据库生物信息软件 | 第37-39页 |
| ·结果与分析 | 第39-45页 |
| ·不结球白菜基因组及相关数据资源整理 | 第39-41页 |
| ·网站架构 | 第41-45页 |
| ·讨论 | 第45-47页 |
| 第三章 大白菜保守microRNA和靶基因的预测 | 第47-63页 |
| 摘要 | 第47页 |
| ABSTRACT | 第47-49页 |
| ·材料与方法 | 第49-52页 |
| ·材料 | 第49页 |
| ·方法 | 第49-52页 |
| ·结果与分析 | 第52-60页 |
| ·大白菜保守miRNA的确定 | 第52页 |
| ·大白菜miRNA的特点 | 第52-55页 |
| ·大白菜中的反义miRNA | 第55-56页 |
| ·前体miRNA在大白菜基因组的定位 | 第56-57页 |
| ·miRNA靶基因的预测 | 第57-59页 |
| ·GO分类和KEGG分析 | 第59-60页 |
| ·讨论 | 第60-63页 |
| 第四章 不结球白菜miRNA组织特异性表达及其在低温条件下的表达情况 | 第63-71页 |
| 摘要 | 第63页 |
| ABSTRACT | 第63-64页 |
| ·材料与方法 | 第64-67页 |
| ·材料 | 第64-65页 |
| ·方法 | 第65-67页 |
| ·结果与分析 | 第67-69页 |
| ·不结球白菜miRNA的组织特异性表达 | 第67-68页 |
| ·低温条件下不结球白菜miRNA表达情况 | 第68-69页 |
| ·讨论 | 第69-71页 |
| 第五章 甘蓝microRNA和靶基因的预测与鉴定 | 第71-87页 |
| 摘要 | 第71页 |
| ABSTRACT | 第71-72页 |
| ·材料与方法 | 第72-76页 |
| ·材料 | 第72-73页 |
| ·方法 | 第73-76页 |
| ·结果与分析 | 第76-84页 |
| ·甘蓝保守miRNA的确定 | 第76-77页 |
| ·甘蓝miRNA的特点 | 第77-78页 |
| ·甘蓝前体miRNA的特点 | 第78-79页 |
| ·甘蓝中反义miRNA | 第79-81页 |
| ·甘蓝miRNA的表达分析 | 第81页 |
| ·miRNA靶基因的预测 | 第81-82页 |
| ·利用qRT-PCR对miRNA靶基因进行表达分析 | 第82-83页 |
| ·甘蓝miRNA靶基因mRNA剪切的鉴定 | 第83页 |
| ·甘蓝miRNA靶基因的GO分类和KEGG分析 | 第83-84页 |
| ·讨论 | 第84-87页 |
| 第六章 芸薹属EST-SSR分子标记的开发 | 第87-97页 |
| 摘要 | 第87页 |
| ABSTRACT | 第87-88页 |
| ·材料与方法 | 第88-91页 |
| ·材料 | 第88-89页 |
| ·方法 | 第89-91页 |
| ·结果 | 第91-95页 |
| ·EST数据集 | 第91页 |
| ·EST-SSR的分布和频率 | 第91-93页 |
| ·引物设计和芸薹属作物之间的可转移性 | 第93页 |
| ·EST的功能注释和分类 | 第93-95页 |
| ·讨论 | 第95-97页 |
| 全文结论 | 第97-99页 |
| 本文创新点 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-115页 |
| 附表 | 第115-133页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第133-135页 |
| 致谢 | 第135页 |