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多能干细胞诱导因子及其家族蛋白的生物信息学分析

中文摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 绪论第11-17页
   ·课题研究背景及意义第11-12页
   ·国内外研究概况第12-13页
   ·主要研究方法第13-14页
   ·本文主要研究内容第14-17页
第二章 干细胞诱导因子家族蛋白在多个物种中的筛选第17-24页
   ·家族蛋白的定义第17页
   ·Blast 方法及在本文中的应用第17-24页
     ·Blast 算法简介第17-19页
     ·Blast 序列比对及家族蛋白的筛选第19-24页
第三章 干细胞诱导因子的进化树分析第24-31页
   ·系统进化树理论第24页
   ·进化树构建算法第24-27页
   ·进化树构建的实现第27-31页
第四章 干细胞诱导因子在多个物种中的结构域及可变剪切分析第31-44页
   ·蛋白的结构域第31页
   ·诱导因子的结构域分析第31-39页
     ·pfam 的蛋白结构域分析第32-34页
     ·蛋白结构域可视化表示的实现第34-35页
     ·干细胞诱导因子中的结构域组成第35-39页
   ·诱导因子可变剪切分析第39-44页
     ·可变剪切简介第39页
     ·可变剪切分析第39-41页
     ·可变剪切的图形化表示第41-44页
第五章 干细胞诱导因子表达分析及功能第44-50页
   ·基因表达及分析方法第44-45页
   ·四因子基因表达的分析第45-47页
   ·Oct4 及其家族基因的表达第47-50页
第六章 Oct4 家族蛋白作用关系和 microRNA 预测第50-56页
   ·Oct4 蛋白的调控网络第50-53页
   ·参与 Oct4 家族基因调控的 microRNA 预测第53-56页
第七章 总结与展望第56-58页
参考文献第58-60页
致谢第60-61页
攻读学位期间发表的学术论文目录第61-62页
附录第62-65页

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