基于RNA-Seq技术的红鳍东方鲀鳃和鳔转录组的初步研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 符号说明 | 第12-13页 |
| 第一章 文章综述 | 第13-26页 |
| ·红鳍东方鲀简介 | 第13-14页 |
| ·转录组及转录组技术 | 第14-20页 |
| ·转录组与测序技术 | 第14-15页 |
| ·RNA-Seq 技术及其在鱼类中的研究进展 | 第15-20页 |
| ·鱼鳔的研究进展 | 第20-22页 |
| ·鳔的结构与功能 | 第20页 |
| ·鳔与肺的进化关系 | 第20-21页 |
| ·鳔的分子生物学研究 | 第21-22页 |
| ·鱼鳃的免疫基因研究进展 | 第22-24页 |
| ·鳃的结构与发生 | 第22页 |
| ·鳃的免疫相关基因 | 第22-24页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第24-26页 |
| ·目的意义 | 第24页 |
| ·研究内容 | 第24-25页 |
| ·技术路线 | 第25页 |
| ·课题受资助情况 | 第25-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-29页 |
| ·实验材料 | 第26页 |
| ·实验方法 | 第26-29页 |
| ·红鳍东方鲀鳃和鳔总 RNA 提取 | 第26页 |
| ·总 RNA 的质量检测 | 第26页 |
| ·转录组文库构建 | 第26页 |
| ·转录组文库上机测序 | 第26页 |
| ·测序数据的组装 | 第26-27页 |
| ·生物信息学分析 | 第27-29页 |
| 第三章 实验结果 | 第29-54页 |
| ·总 RNA 的质量检测 | 第29-30页 |
| ·总 RNA 电泳检测 | 第29页 |
| ·总 RNA 纯度检测 | 第29-30页 |
| ·红鳍东方鲀鳔和鳃的转录组分析 | 第30-54页 |
| ·数据集整理与统计 | 第30页 |
| ·RNA-seq 数据 mapping | 第30-32页 |
| ·注释及基因表达定量分析 | 第32-35页 |
| ·基因注释 | 第35-41页 |
| ·差异基因分析 | 第41-52页 |
| ·SNP 分析 | 第52-54页 |
| 第四章 讨论 | 第54-69页 |
| ·红鳍东方鲀鳔与哺乳动物肺的进化 | 第54-61页 |
| ·红鳍东方鲀鳃的免疫信号通路 | 第61-69页 |
| 结论 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-82页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-85页 |
