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水稻染色质变构因子DDM1和CHR729的功能研究

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩略词表第10-11页
1 文献综述第11-22页
   ·表观遗传学概述第11页
   ·表观遗传调控分子机制第11-21页
     ·真核生物染色质结构第11-12页
     ·DNA甲基化第12-17页
       ·DNA甲基化定义以及分类第12-14页
       ·DNA甲基化与其他表观修饰之间的关系第14-17页
     ·DNA去甲基化第17页
     ·染色质变构因子第17-19页
     ·组蛋白修饰第19-21页
   ·研究的目的和意义第21-22页
2 材料与方法第22-32页
   ·水稻材料第22页
   ·序列分析第22页
   ·实验所用菌株、质粒、载体以及感受态第22页
   ·DNA的抽提和Southern杂交第22-23页
   ·PCR、RT-PCR和Real-time PCR的检测第23页
   ·遗传转化第23-24页
   ·蛋白质操作方法第24-25页
     ·水稻叶片组蛋白的抽提第24页
     ·水稻总蛋白的抽提方法第24页
     ·Western杂交及所用抗体第24-25页
     ·DDM1b抗体的获得第25页
   ·体外组蛋白结合实验第25页
   ·生物素多肽结合实验第25-26页
   ·染色质免疫沉淀(ChIP)第26页
   ·生长调控因子处理第26页
   ·酵母双杂交技术第26-32页
3 实验结果与分析第32-70页
   ·水稻染色质重塑因子DDM1基因的功能研究第32-42页
     ·水稻染色质重塑因子DDM1基因信息的获取、结构分析以及表达谱的检测第32-33页
     ·水稻染色质重塑因子DDM1基因全长cDNA克隆第33-34页
     ·水稻染色质重塑因子DDM1b超表达材料的检测第34-35页
     ·水稻染色质重塑因子DDM1突变体材料的获取、检测以及表型鉴定第35-36页
     ·ddm1b拷贝数以及DNA甲基化的检测第36-39页
     ·ddm1b对5-aza(DNA甲基化抑制剂)更敏感第39-40页
     ·水稻染色质重塑因子DDM1b多克隆抗体的制备以及检测第40-41页
     ·水稻染色质重塑因子DDM1b互作蛋白筛选第41-42页
   ·水稻染色质重塑因子CHR729基因的功能研究第42-70页
     ·chr729以及dsCHR729材料表型的观察以及性状分析第42-47页
     ·CHR729蛋白能与H3K27me3以及H3K4me2结合第47-49页
     ·CHR729基因影响生长素合成而不影响生长素应答第49-50页
     ·chr729对细胞分裂素响应减缓以及细胞分裂素氧化增强第50-53页
     ·CHR729参与细胞分裂素诱导H3K4me3修饰增加第53页
     ·CHR729参与调控水稻开花途径第53-56页
     ·chr729的CHIP-seq分析第56-58页
     ·chr729中H3K4me3和H3K27me3修饰大幅下降第58-62页
     ·chr729的芯片中下降表达的基因主要是因为H3K4me3的丢失第62-68页
     ·chr729中AP2基因表达下调与其H3K4me3的修饰有着密切的关系第68-70页
4 讨论第70-74页
   ·水稻DDM1基因功能第70页
   ·水稻DDM1在水稻表观育种中的作用第70-71页
   ·水稻CHR729基因功能第71-72页
   ·水稻CHR729可能调节水稻正常生长发育的模型第72-74页
参考文献第74-83页
致谢第83页

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