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单级自养脱氮系统中功能菌的分子生物学鉴定及氨氧化反应关键酶基因的克隆与表达

中文摘要第1-5页
英文摘要第5-11页
1 绪论第11-28页
   ·引言第11页
   ·生物脱氮工艺第11-17页
     ·传统生物脱氮第11-13页
     ·新型脱氮工艺第13-17页
   ·单级自养脱氮系统的功能菌株第17-25页
     ·氨氧化菌的研究现状第17-18页
     ·氨氧化菌的系统发育分析第18-21页
     ·氨氧化细菌研究展望第21页
     ·厌氧氨氧化菌的研究现状第21-22页
     ·厌氧氨氧化菌种形态特征第22-23页
     ·厌氧氨氧化菌系统发育研究第23-25页
   ·研究意义第25页
   ·研究目的、内容第25-26页
     ·研究目的第25页
     ·研究内容第25-26页
   ·技术路线第26-27页
   ·创新点第27-28页
2 厌氧氨氧化菌的16S rDNA 鉴定第28-37页
   ·材料与仪器第28-30页
     ·样品来源第28-29页
     ·主要培养基第29页
     ·主要试剂及药品第29-30页
     ·主要仪器设备第30页
   ·实验方法第30-33页
     ·厌氧氨氧化菌16S rDNA 特异引物第30页
     ·污泥细菌总DNA 的提取第30-31页
     ·厌氧氨氧化菌16S rDNA 部分序列的PCR 扩增第31页
     ·PCR 产物的3’加A 及克隆第31页
     ·阳性克隆的鉴定及序列分析第31-33页
   ·结果与分析第33-35页
     ·细菌总DNA 提取第33页
     ·厌氧氨氧化菌16S rDNA 部分序列PCR 扩增第33-34页
     ·阳性克隆的鉴定及序列分析第34-35页
   ·讨论第35-37页
3 氨氧化细菌的16S rDNA 鉴定第37-45页
   ·材料与仪器第37页
     ·样品来源第37页
     ·主要培养基第37页
     ·主要试剂第37页
   ·实验方法第37-39页
     ·氨氧化菌的富集培养第37页
     ·DNA 的提取第37页
     ·引物设计第37-38页
     ·氨氧化菌的16S rDNA 部分序列的扩增和克隆第38页
     ·阳性克隆的鉴定和进化分析第38-39页
   ·结果分析第39-42页
     ·细菌总DNA 的提取第39-40页
     ·氨氧化菌的16S rDNA 部分序列的扩增第40页
     ·阳性克隆的鉴定第40-42页
     ·氨氧化菌16S rDNA 的进化树分析第42页
   ·讨论第42-45页
4 氨氧化菌功能基因氨单加氧酶基因(amoA)和羟胺氧化酶基因(hao)的克隆及进化分析第45-57页
   ·材料与仪器第45页
     ·材料来源第45页
     ·菌种和质粒第45页
     ·主要培养基第45页
     ·主要试剂第45页
     ·主要酶类第45页
     ·主要仪器第45页
   ·实验方法第45-49页
     ·富集后氨氧化菌DNA 的提取第45页
     ·引物设计第45-46页
     ·amoA、hao 全长片段的PCR 扩增、克隆第46页
     ·阳性克隆的鉴定及进化分析第46-49页
   ·结果分析第49-54页
     ·amoA扩增PC R全长片段的第49-50页
     ·pMD19-amoA 阳性克隆的鉴定第50-51页
     ·hao 全长基因的PCR 扩增第51页
     ·pMD19-hao 阳性克隆的鉴定第51-52页
     ·氨氧化菌的amoA 基因的系统进化分析第52-53页
     ·氨氧化菌的hao 基因的系统进化分析第53-54页
   ·讨论第54-57页
5 氨氧化菌氨单加氧酶基因(amoA)和羟胺氧化酶基因(hao)的原 核表达和酶活的检测第57-73页
   ·材料与仪器第57-59页
     ·菌种和质粒第57页
     ·主要培养基第57页
     ·主要试剂及药品第57-59页
     ·其他主要试剂第59页
     ·主要仪器设备第59页
   ·实验方法第59-64页
     ·pET-32a-amoA 原核表达载体的构建第59-60页
     ·重组质粒pET-32a-amoA 转化BL21(DE3)第60页
     ·重组质粒的鉴定及测序第60页
     ·pET-32a-hao 原核表达载体的构建第60-61页
     ·重组质粒pET-32a-hao 转化BL21(DE3)第61页
     ·重组质粒的鉴定及测序第61页
     ·IPTG 诱导表达第61页
     ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳和Western Blot 鉴定第61-62页
     ·功能基因的活性检测第62-64页
   ·结果与分析第64-72页
     ·重组质粒pET-32a-amoA 的鉴定第64-65页
     ·重组质粒pET-32a-hao 的鉴定第65-67页
     ·AMOa 蛋白表达第67页
     ·HAO 蛋白表达第67-68页
     ·Western Blot 的鉴定第68-69页
     ·关键酶的活性检测第69-72页
   ·讨论第72-73页
6 主要结论和后续工作展望第73-75页
   ·主要结论第73-74页
   ·后续工作展望第74-75页
致谢第75-77页
参考文献第77-87页
附录第87-92页
 测序结果第87-92页
 作者在攻读硕士学位期间发表论文的目录第92页

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