| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-12页 |
| 1 前言 | 第12-22页 |
| ·环境微生物多样性研究方法的研究进展 | 第12-16页 |
| ·传统方法 | 第12-13页 |
| ·生物标记物(Biomakers)方法 | 第13-14页 |
| ·现代分子生物学技术 | 第14-16页 |
| ·湖光岩玛珥湖研究进展 | 第16-20页 |
| ·湖光岩玛珥湖概况 | 第16-17页 |
| ·湖光岩玛珥湖的研究现状 | 第17-20页 |
| ·本课题的研究目的及意义 | 第20-22页 |
| 2 实验材料及方法 | 第22-32页 |
| ·实验材料 | 第22-25页 |
| ·仪器设备 | 第22页 |
| ·试剂和溶液 | 第22-23页 |
| ·引物 | 第23-24页 |
| ·分析软件 | 第24-25页 |
| ·实验方法 | 第25-32页 |
| ·样品的采集、前期处理 | 第25-26页 |
| ·环境样品总DNA 和总RNA 的提取 | 第26-27页 |
| ·用DNase Ⅰ处理RNA | 第27页 |
| ·RT-PCR、PCR 扩增16S rDNA 基因 | 第27-28页 |
| ·弧菌的分离 | 第28-29页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第29页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第29-30页 |
| ·连接与转化 | 第30页 |
| ·阳性克隆的PCR 检测 | 第30-31页 |
| ·测序与同源性分析 | 第31-32页 |
| 3 实验结果及分析 | 第32-61页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游总菌与浮游活性菌的多样性 | 第32-44页 |
| ·浮游总菌、活性菌16S rDNA 基因序列扩增结果 | 第32-33页 |
| ·浮游总菌、活性菌16S rDNA 克隆文库的构建 | 第33-36页 |
| ·各文库浮游菌门类统计 | 第36-37页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游总菌、活性菌16S rDNA 序列同源性 | 第37页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游总菌、活性菌系统发育树 | 第37-44页 |
| ·湖光岩玛珥湖七类湖泊常见类群细菌多样性 | 第44-56页 |
| ·用7 对通用引物扩增浮游总菌、活性菌16S rDNA 基因结果 | 第44-45页 |
| ·七类湖泊常见类群16S rDNA 克隆文库的构建 | 第45-48页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游总菌、活性菌七类常见类群系统发育分析 | 第48-56页 |
| ·湖光岩玛珥湖弧菌的遗传多样性 | 第56-61页 |
| ·用TCBS 选择培养基分离弧菌 | 第56页 |
| ·rpoB 及ITS 基因序列扩增结果 | 第56-57页 |
| ·湖光岩玛珥湖分离弧菌及海水分离弧菌序列同源性 | 第57-61页 |
| 4 讨论 | 第61-77页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游总菌与浮游活性菌的多样性 | 第61-67页 |
| ·16S rDNA 用于菌群多样性分析 | 第61-62页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游细菌的遗传多样性 | 第62-64页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游总菌和活性菌的系统发育和同源性 | 第64-65页 |
| ·不同水层浮游细菌多样性差异 | 第65-66页 |
| ·不同水层浮游总菌与浮游活性菌多样性差异 | 第66-67页 |
| ·湖光岩玛珥湖七类湖泊常见类群细菌多样性 | 第67-73页 |
| ·七类常见湖泊细菌类群16S rDNA 克隆文库的构建 | 第67-69页 |
| ·湖光岩玛珥湖浮游细菌的系统发育和同源性 | 第69-70页 |
| ·不同水层7 个常见类群浮游细菌多样性 | 第70-71页 |
| ·不同文库浮游总菌和浮游活性菌多样性 | 第71-73页 |
| ·湖光岩玛珥湖弧菌的遗传多样性 | 第73-77页 |
| ·ITS 基因与rpoB 基因 | 第73-74页 |
| ·湖光岩玛珥湖及湛江港分离弧菌的同源性 | 第74-75页 |
| ·使用ITS 基因和rpoB 基因分类鉴定细菌的差异 | 第75-77页 |
| 5 结论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 附录1 | 第90-98页 |
| 附录2 | 第98-106页 |
| 附录3 | 第106-111页 |
| 附录4 | 第111-116页 |
| 作者简历 | 第116-117页 |
| 导师简介 | 第117页 |
