变量选择和变换的新方法研究
摘要 | 第1-8页 |
Abstract | 第8-14页 |
第Ⅰ部分 前言和方法综述 | 第14-41页 |
第1章 前言 | 第14-19页 |
·化学计量学和化学信息学的发展和新任务 | 第14页 |
·生物统计和生物信息学 | 第14-15页 |
·课题来源 | 第15-17页 |
·本文的主要内容和成果 | 第17-19页 |
第2章 方法综述 | 第19-41页 |
·QSAR | 第19-26页 |
·QSAR的发展 | 第19页 |
·QSAR的步骤 | 第19-26页 |
·分子结构参数 | 第20页 |
·建模方法 | 第20-24页 |
·QSAR中的变量选择方法 | 第24-26页 |
·超大规模数据的降维 | 第26-31页 |
·分类问题的变量选择 | 第27-29页 |
·T检验法 | 第28页 |
·Wilkins法 | 第28-29页 |
·Chi-square法 | 第29页 |
·变量变换 | 第29-31页 |
·线性组合 | 第30页 |
·非线性组合 | 第30-31页 |
·核函数 | 第31-41页 |
·核函数的发展 | 第31-35页 |
·核函数构造方法简介 | 第35-36页 |
·常用的核函数方法 | 第36-38页 |
·Kernel PLS | 第36页 |
·KPCA | 第36页 |
·KFDA | 第36-37页 |
·核聚类方法 | 第37-38页 |
·核方法的特点 | 第38-41页 |
第Ⅱ部分 蛋白质芯片数据分析 | 第41-77页 |
第3章 KPLS分类预报 | 第42-56页 |
·蛋白质组学概述 | 第42-44页 |
·SELDI-TOF | 第44-48页 |
·SELDI-MS操作步骤 | 第45-47页 |
·SELDI-TOF在血清肿瘤标志物检测中的应用 | 第47-48页 |
·KPLS | 第48-50页 |
·卵巢癌SELDI-TOF数据分析 | 第50-54页 |
·结果评价 | 第50-51页 |
·低分辨率卵巢癌数据处理 | 第51-53页 |
·高分辨率卵巢癌数据分析 | 第53-54页 |
·结论 | 第54-56页 |
第4章 多阶统计量变换 | 第56-62页 |
·多阶统计量 | 第56-57页 |
·结果 | 第57-62页 |
第5章 模式变量 | 第62-77页 |
·模式挖掘 | 第62-63页 |
·挖掘流程 | 第63-71页 |
·计算结果 | 第71-75页 |
·肿瘤模式 | 第71-73页 |
·对照模式 | 第73-75页 |
·讨论 | 第75-77页 |
第Ⅲ部分 核函数变换应用于其它实例 | 第77-112页 |
第6章 基因芯片数据分析 | 第78-85页 |
·基因芯片技术概述 | 第78-79页 |
·基因表达谱数据处理策略 | 第79-80页 |
·数据预处理 | 第79页 |
·特征提取 | 第79-80页 |
·芯片数据分析 | 第80-85页 |
·降维 | 第80-81页 |
·自组织映射 | 第81-83页 |
·结果与讨论 | 第83-85页 |
·数据和处理方法 | 第83页 |
·验证 | 第83-85页 |
第7章 多肽保留时间预测 | 第85-92页 |
·多肽鉴定概述 | 第85-87页 |
·多肽保留时间的相关研究 | 第87-88页 |
·计算结果 | 第88-92页 |
·多肽的描述变量 | 第88-89页 |
·保留时间预测结果 | 第89-92页 |
第8章 持久性有机污染物-PCDD/FS | 第92-107页 |
·有机污染物QSAR概述 | 第92-94页 |
·DIOXINS简介 | 第94-96页 |
·PCDD/Fs结构参数 | 第96-98页 |
·保留时间预测结果与讨论 | 第98-103页 |
·模型的比较 | 第99-102页 |
·模型验证 | 第102-103页 |
·DIOXINS毒性研究与芳烃受体蛋白 | 第103-107页 |
·Dioxins与芳烃受体蛋白 | 第103-104页 |
·Dioxins毒性与结构关系研究 | 第104-107页 |
第9章 药物分子设计中的定量构效关系研究 | 第107-112页 |
·神经氨酸酶抑制剂 | 第108-109页 |
·计算步骤 | 第109-110页 |
·结果与讨论 | 第110-111页 |
·小结 | 第111-112页 |
第Ⅳ部分 结语和展望 | 第112-114页 |
致谢 | 第114-115页 |
个人简历 在读期间发表的学术论文与研究成果 | 第115-116页 |
参考文献 | 第116-135页 |