北方花鳅线粒体基因组测序及鳅类系统发育分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第1章 前言 | 第10-18页 |
| ·线粒体概况 | 第10-11页 |
| ·线粒体简介 | 第10页 |
| ·动物线粒体基因组的主要特征 | 第10-11页 |
| ·线粒体基因组的一般结构特征 | 第11-12页 |
| ·线粒体基因组碱基组成及含量变化 | 第11页 |
| ·线粒体的基因组成特点 | 第11-12页 |
| ·线粒体基因组的遗传及进化特征 | 第12-14页 |
| ·mtDNA的遗传特点 | 第12-13页 |
| ·mtDNA的进化特点 | 第13-14页 |
| ·鱼类线粒体基因组的分子系统学研究 | 第14-16页 |
| ·分子系统学概况 | 第14-15页 |
| ·鱼类线粒体基因组的研究进展 | 第15-16页 |
| ·研究的目的和意义 | 第16-18页 |
| ·鳅类简介 | 第16-17页 |
| ·物种的介绍 | 第17页 |
| ·研究意义 | 第17-18页 |
| 第2章 材料和方法 | 第18-29页 |
| ·实验材料及其用具 | 第18-20页 |
| ·取材、鉴定及处理 | 第18页 |
| ·实验仪器及相关的试剂 | 第18-20页 |
| ·实验方法 | 第20-29页 |
| ·总DNA的提取及检测 | 第20-21页 |
| ·PCR扩增及纯化 | 第21-26页 |
| ·扩增产物测序 | 第26页 |
| ·序列拼接与分析 | 第26页 |
| ·利用线粒体数据建立鳅类系统发育关系 | 第26-29页 |
| 第3章 北方花鳅线粒体基因组分析 | 第29-44页 |
| ·北方花鳅DNA提取结果 | 第29页 |
| ·PCR扩增结果 | 第29-31页 |
| ·LA-PCR扩增及其产物的纯化 | 第29-30页 |
| ·Sub-PCR扩增及其产物的纯化 | 第30-31页 |
| ·序列的拼接和调零 | 第31页 |
| ·北方花鳅线粒体基因组全序列分析 | 第31-40页 |
| ·北方花鳅线粒体基因组基本组成特征 | 第31页 |
| ·北方花鳅核苷酸组成 | 第31-34页 |
| ·北方花鳅tRNA基因及结构 | 第34-36页 |
| ·北方花鳅rRNA基因和二级结构 | 第36-40页 |
| ·北方花鳅控制区(D-loop区) | 第40页 |
| ·北方花鳅与其他鱼类线粒体基因组的比较分析 | 第40-44页 |
| ·线粒体基因组碱基组成分析 | 第40页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第40-41页 |
| ·tRNA基因 | 第41页 |
| ·rRNA基因 | 第41-42页 |
| ·非编码区 | 第42-44页 |
| 第4章 鳅类系统发育分析 | 第44-58页 |
| ·收集数据 | 第44页 |
| ·数据集数据序列组成分析 | 第44-45页 |
| ·系统发育信号检验 | 第45-48页 |
| ·碱基替换饱和性分析 | 第45-46页 |
| ·g1检验和PTP检验 | 第46-48页 |
| ·鳅类系统发育关系分析 | 第48-55页 |
| ·最大似然法 | 第48-52页 |
| ·贝叶斯法 | 第52-55页 |
| ·讨论 | 第55-58页 |
| 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第66页 |
