| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 微生物湿法冶金技术与嗜酸微生物 | 第13-69页 |
| ·微生物湿法冶金技术 | 第13-17页 |
| ·关于微生物湿法冶金技术的几个概念 | 第13-14页 |
| ·微生物湿法冶金的类型及现状 | 第14-15页 |
| ·微生物生物氧化的机理 | 第15-17页 |
| ·嗜酸微生物和主要的嗜酸浸矿细菌的多样性 | 第17-30页 |
| ·概述 | 第17-18页 |
| ·地球上的酸性生态系统多样性 | 第17-18页 |
| ·嗜酸微生物生态地理学 | 第18页 |
| ·嗜酸微生物多样性 | 第18-23页 |
| ·细菌(Bacteria) | 第19-22页 |
| ·古菌(Archaea) | 第22页 |
| ·真核微生物(Eucarya) | 第22-23页 |
| ·目前与微生物湿法冶金相关的主要嗜酸原核生物 | 第23-30页 |
| ·常温原核生物(Mesophiles) | 第23-26页 |
| ·中度嗜热原核生物(Moderate thermophiles) | 第26-28页 |
| ·嗜热原核生物(Thermophiles) | 第28页 |
| ·极端嗜热原核生物(Extreme thermophiles) | 第28-29页 |
| ·菌群互作与协同作用 | 第29-30页 |
| ·嗜酸浸矿原核生物的分类学、系统学研究 | 第30-46页 |
| ·细菌分类学及系统学研究方法 | 第30-39页 |
| ·经典分类 | 第32-33页 |
| ·数值分类 | 第33页 |
| ·化学分类 | 第33页 |
| ·现代分类 | 第33-39页 |
| ·常见嗜酸细菌及浸矿细菌分类学、系统学研究 | 第39-46页 |
| ·硫杆菌(Thiobacillus)分类学及分子系统学研究进展 | 第39-44页 |
| ·氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)的系统学地位 | 第44-46页 |
| ·嗜酸浸矿细菌的遗传多样性研究 | 第46-53页 |
| ·氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)及氧化硫硫杆菌(Acidithiobacillus thiooxidans)的遗传多样性 | 第46-53页 |
| ·氧化亚铁硫杆菌和氧化硫硫杆菌的遗传多样性 | 第46-48页 |
| ·氧化亚铁硫杆菌和氧化硫硫杆菌菌株的分子鉴别 | 第48-51页 |
| ·铁氧化钩端螺菌(Leptospirillum)的遗传多样性 | 第51-53页 |
| ·自然环境和工业浸矿实践中嗜酸微生物的分子生态学研究 | 第53-58页 |
| ·微生物分子生态学研究的一般方法和原理 | 第53-56页 |
| ·分子生物学技术在嗜酸浸矿微生物分子生态学研究中的应用 | 第56-57页 |
| ·自然环境和工业浸出实践中嗜酸浸矿细菌的群落结构 | 第57-58页 |
| ·本论文的立论依据及其主要研究内容 | 第58-61页 |
| ·硫杆菌(Thiobacillus)及其它嗜酸浸矿细菌分子系统学研究目标及意义 | 第59页 |
| ·不同环境中嗜酸浸矿细菌的遗传多样性研究及其意义 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-69页 |
| 第二章 硫杆菌及其它浸矿细菌的筛选与分离纯化 | 第69-81页 |
| ·材料与方法 | 第69-74页 |
| ·采样点 | 第69页 |
| ·采样方法 | 第69页 |
| ·细菌的分离纯化 | 第69-70页 |
| ·培养基方案 | 第70-74页 |
| ·结果 | 第74-76页 |
| ·实验分离菌株及模式菌株、参比菌株 | 第74页 |
| ·分离细菌的形态学及生理学初步鉴定 | 第74-76页 |
| ·讨论 | 第76-79页 |
| 参考文献 | 第79-81页 |
| 第三章 硫杆菌及其它浸矿细菌的生理生化 | 第81-93页 |
| ·材料与方法 | 第81-83页 |
| ·形态学显微镜观察 | 第81页 |
| ·生理多样性 | 第81-83页 |
| ·不同金属离子对细菌生长的影响 | 第81页 |
| ·不同有机物对细菌生长的影响 | 第81-82页 |
| ·温度对细菌菌株的生长影响及生长的最适温度、最高温度 | 第82页 |
| ·pH对不同细菌菌株生长的影响及其最适、最低生长pH | 第82页 |
| ·不同Acidithiobacillus spp.菌株在硫粉作能源的培养基中的生长 | 第82页 |
| ·数据处理 | 第82-83页 |
| ·Fe~(2+)含量的测定方法 | 第82页 |
| ·Fe~(2+)标准曲线的测定 | 第82-83页 |
| ·数据处理方法 | 第83页 |
| ·结果 | 第83-88页 |
| ·形态学显微镜观察 | 第83页 |
| ·浸矿细菌的生理多样性 | 第83-88页 |
| ·讨论 | 第88-92页 |
| 参考文献 | 第92-93页 |
| 第四章 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)、氧化硫硫杆菌(A.thiooxidans)遗传多样性研究 | 第93-142页 |
| ·材料与方法 | 第93-101页 |
| ·供试菌株及参比菌株 | 第93页 |
| ·细菌DNA的制备 | 第93-94页 |
| ·细菌DNA的提取 | 第93-94页 |
| ·细菌DNA的定量测定和纯度分析 | 第94页 |
| ·随机扩增多态性分析(RAPD,random amplified polymorphic DNA)及AP-PCR | 第94-96页 |
| ·模板的制备 | 第94页 |
| ·引物选择 | 第94-95页 |
| ·PCR扩增 | 第95-96页 |
| ·凝胶电泳及成像分析 | 第96页 |
| ·扩增16S rDNA及ITS序列限制性酶切分析(ARDRA,aplified ribosomal DNA restriction analysis) | 第96-98页 |
| ·引物选择及PCR扩增 | 第96-97页 |
| ·限制性酶切反应 | 第97-98页 |
| ·凝胶电泳及成像分析 | 第98页 |
| ·rep-APD(repetitive primer amplified polymorphic DNA) | 第98-99页 |
| ·引物选择及PCR扩增 | 第98-99页 |
| ·凝胶电泳及成像分析 | 第99页 |
| ·数据处理 | 第99页 |
| ·根据16S rDNA及16S-23S ISR间隔序列的系统学分析 | 第99-101页 |
| ·引物选择及PCR扩增 | 第99-100页 |
| ·测序 | 第100页 |
| ·数据处理 | 第100页 |
| ·序列登陆号 | 第100-101页 |
| ·结果 | 第101-133页 |
| ·细菌DNA的制备 | 第101页 |
| ·随机扩增多态性分析(RAPD) | 第101-114页 |
| ·扩增16S rDNA及ISR序列限制性酶切分析(ARDRA,aplified ribosomal DNA restriction analysis) | 第114-119页 |
| ·rep-APD(repetitive primer amplified polymorphic DNA) | 第119-122页 |
| ·16S rRNA基因及ISR间隔序列的系统学分析 | 第122-133页 |
| ·中国Acidithiobacillus spp.ISR间隔序列特点 | 第122页 |
| ·基于ISR间隔序列的系统学分析 | 第122-129页 |
| ·基于16S rRNA基因的系统学分析 | 第129-133页 |
| ·讨论 | 第133-138页 |
| ·不同分子分型技术的分辩指数比较 | 第133-134页 |
| ·Acidithiobacillus spp.遗传多态性形成的原因分析 | 第134-136页 |
| ·Acidithiobacillus spp.遗传分型与生理学分组之间的相关性 | 第136-138页 |
| 参考文献 | 第138-142页 |
| 小结 | 第142-145页 |
| 致谢 | 第145-147页 |
| 附图 | 第147页 |
