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甘露聚糖酶Man23的基因表达体系优化及其分子改造

摘要第1-6页
Abstract第6-14页
第一章 前言第14-47页
 1 甘露聚糖酶简介第14-25页
   ·甘露聚糖酶来源和种类第14页
   ·甘露聚糖酶的结构特征第14-17页
   ·甘露聚糖酶的多样性第17-20页
     ·甘露聚糖酶的多样性表现第17-18页
     ·甘露聚糖酶多样性的分析第18-20页
   ·甘露聚糖酶的生理功能第20-21页
   ·甘露聚糖酶的研究概况第21-25页
 2 芽孢杆菌表达体系的简介第25-28页
 3 蛋白质体外改造及其技术第28-43页
   ·蛋白质的理性设计第29-30页
   ·蛋白质的非理性设计第30-41页
     ·易错PCR技术第31页
     ·DNA shuffling第31-33页
     ·DNA家族改组第33页
     ·StEP重组第33-34页
     ·部分基因片段改组第34页
     ·单链DNA家族改组第34页
     ·简并引物基因改组第34-35页
     ·基因组改组第35页
     ·随机引物体外重组法第35页
     ·过渡模板随机嵌合生长第35-36页
     ·酵母增强组合文库第36-37页
     ·渐增切割法产生杂和酶第37-38页
     ·不依赖序列同源性的蛋白质重组第38页
     ·其他分子进化的方法第38-40页
     ·突变库筛选策略第40-41页
   ·蛋白质的半合理设计第41-43页
     ·基于结构的有选择的随机突变第41-42页
     ·随机突变后的定点饱和突变第42页
     ·随机突变与定点饱和突变同步第42页
     ·计算机辅助的半合理设计第42-43页
 4 酶制剂的稳定性第43-47页
第二章 甘露聚糖酶的基因表达体系优化及其酶学表征第47-70页
 1 试验材料第47-50页
   ·仪器第47-48页
   ·主要试剂第48页
   ·菌种和质粒第48-49页
   ·溶液配置第49-50页
 2 方法第50-59页
   ·细菌总DNA的提取第50页
   ·质粒的制备第50-51页
   ·目的基因的克隆第51页
   ·PCR产物的电泳检测第51-52页
   ·PCR产物的纯化和回收第52页
   ·PCR产物的酶切第52页
   ·质粒pHY-p43的酶切、产物纯化及去磷酸化处理第52-53页
   ·目的基因与载体的连接第53页
   ·重组质粒pHY-p43-man23的构建和转化第53-54页
     ·重组质粒pHY-p43-man23的构建第53-54页
     ·重组质粒的转化第54页
   ·重组质粒pBPS-man23的构建和转化第54-55页
     ·Brevibacillus brevis细胞壁蛋白基因的启动子和信号肽的分析和克隆第54页
     ·质粒pKF34的构建第54-55页
     ·重组基因pBPS-man23的构建及其转化第55页
   ·酶的分离纯化第55-56页
   ·蛋白质含量测定第56-57页
     ·蛋白质标准曲线的制作第56-57页
     ·蛋白质浓度测定第57页
   ·酶活力的测定第57-58页
     ·甘露糖标准曲线的制作第57页
     ·甘露聚糖酶活力的测定第57-58页
   ·表达产物的电泳检测第58-59页
 3 结果第59-68页
   ·重组基因pHY-p43-man23的获得第59-62页
     ·甘露聚糖酶Man23全基因的克隆第59-60页
     ·质粒pHY-p43的制备和鉴定第60页
     ·基因man23和质粒pHY-p43的酶切及鉴定第60-61页
     ·酶切产物的连接及重组子的转化第61-62页
   ·重组表达质粒宿主菌的优化第62-64页
   ·man23基因启动子的确定第64-65页
     ·短短芽胞杆菌细胞壁蛋白基因的启动子和信号肽编码序列的获得第64-65页
     ·重组基因pBPS-man23在短短芽胞杆菌中的分泌表达第65页
   ·重组酶的纯化及酶学性质第65-68页
     ·重组酶的反应温度第65-66页
     ·重组酶的反应pH范围第66-67页
     ·重组酶的反应动力学第67-68页
 4 讨论第68-70页
   ·外源基因表达系统宿主菌的选择第68页
   ·芽孢杆菌体系中表达载体的选择第68-70页
第三章 甘露聚糖酶Man23活性中心的鉴定及其催化效率的优化第70-91页
 1 材料与方法第71-77页
   ·材料第71-72页
     ·菌种和质粒第71页
     ·试剂第71页
     ·生物学分析软件和数据库第71页
     ·仪器第71-72页
   ·方法第72-77页
     ·酶的制备第72页
     ·酶的化学修饰第72页
     ·二硫键的测定第72-73页
     ·蛋白质含量的测定第73页
     ·催化活力的测定第73页
     ·酶与底物结合的荧光光谱测定第73页
     ·吲哚基与羧基修饰作用动力学参数测定第73页
     ·催化反应的米氏常数测定第73-74页
     ·酶Man23分子结构的计算机辅助分析第74页
     ·基因man23在大肠杆菌中的转化第74-75页
     ·定点突变库的建立及筛选第75-77页
 2 结果第77-89页
   ·甘露聚糖酶Man23的活性相关基因第77-82页
     ·巯基修饰剂对酶活力的影响第77-78页
     ·羧基修饰剂对酶活力的影响第78-79页
     ·吲哚基修饰剂对酶活力的影响第79-81页
     ·其他修饰剂对酶活力的影响第81-82页
   ·基于结构信息学的计算机辅助分析第82-86页
   ·甘露聚糖酶Man23活性相关的特定位点第86-88页
   ·甘露聚糖酶Man23特定位点的饱和突变第88-89页
 3 讨论第89-91页
   ·半合理设计思路在鉴定酶的活性中心中的运用第89-90页
   ·甘露聚糖酶Man23活性中心的分子基础第90-91页
第四章 甘露聚糖酶的稳定性研究第91-112页
 1 材料与方法第92-94页
   ·菌种和质粒第92页
   ·试剂第92页
   ·仪器第92页
   ·计算机辅助设计方法第92-93页
   ·突变库的构建方法第93页
   ·蛋白质含量的测定第93页
   ·酶活力的测定第93页
   ·催化动力学的测定第93页
   ·酶的纯化和SDS-PAGE的方法第93页
   ·酶稳定性的评价第93-94页
     ·稳定剂对酶Man23耐热性的影响第93-94页
     ·稳定剂对酶Man23保存期的影响第94页
     ·复合稳定剂中组分及其比例的正交试验第94页
 2 结果第94-110页
   ·基于非共价键形成的定点突变第94-95页
   ·基于分子表面电荷分布的定点突变第95-96页
   ·基于立体键角合理化的定点突变第96-98页
   ·最终突变体M0710的获得第98-99页
   ·突变酶M0710的纯化及酶学性质的表征第99页
   ·单一稳定剂对甘露聚糖酶M0710稳定性的影响第99-105页
     ·多元醇类作为稳定剂对酶的影响第99-101页
     ·防腐剂作为稳定剂对酶的影响第101-103页
     ·金属离子作为稳定剂对酶的影响第103-104页
     ·糖类作为稳定剂对酶的影响第104-105页
   ·复合稳定剂对甘露聚糖酶Ma0710稳定性的影响第105-110页
     ·同类稳定剂协同作用对酶稳定性的影响第105-107页
     ·不同类型稳定剂协同作用对酶稳定性的影响第107页
     ·复合稳定剂最佳添加量的配比第107-108页
     ·复合稳定剂的长效试验第108-110页
 3 讨论第110-112页
   ·酶耐热性的分子基础第110-111页
   ·酶耐热性的微环境第111-112页
第五章 研究结论和创新点第112-114页
 1 研究结论第112-113页
 2 创新点第113-114页
参考文献第114-128页
作者简历第128页
在读期间发表文章第128-129页
在读期间参与课题第129页
博士在读期间获奖情况第129-130页
致谢第130-131页

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