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Anabaena PCC 7120中异形胞的发育与DNA复制协调关系的机制研究

摘要第1-8页
Abstract第8-9页
缩略语表第9-10页
1.前言—文献综述第10-46页
   ·蛋白内含子(内含肽)的研究进展第10-23页
     ·蛋白内含子(内含肽)简介第10-12页
       ·什么是蛋白内含子(内含肽)第10页
       ·蛋白内含子(内含肽)的发现第10-11页
       ·Intein和Extein名词的来历第11页
       ·蛋白内含子(内含肽)剪接和RNA剪接的对比第11-12页
     ·蛋白内含子(内含肽)的分布,类型和结构第12-16页
       ·蛋白内含子(内含肽)的分布第12-13页
       ·蛋白内含子(内含肽)的类型第13页
       ·蛋白内含子(内含肽)的结构第13-15页
       ·分离的蛋白内含子(内含肽)第15页
       ·三维结构比较第15-16页
       ·如何识别新的内含肽第16页
     ·蛋白内含子(内含肽)的剪接机制第16-18页
       ·体外实验体系促进分支蛋白质中间产物的发现第16-17页
       ·蛋白内含子(内含肽)剪接机制第17-18页
     ·蛋白内含子(内含肽)的自导和水平转移第18-20页
       ·自导作用第18-19页
       ·自导作用中的有性结合和水平转移第19-20页
     ·蛋白内含子(内含肽)的起源和宿主偏爱第20-21页
       ·蛋白内含子(内含肽)的起源第20页
       ·蛋白内含子(内含肽)的宿主偏爱第20-21页
     ·蛋白内含子(内含肽)在生物技术上的应用第21-23页
       ·蛋白质的纯化第21-22页
       ·毒素蛋白的合成第22页
       ·结构分析第22页
       ·药物学应用第22页
       ·蛋白质相互作用和活性位点剖析的研究第22-23页
       ·转基因植物上的应用第23页
     ·小结第23页
   ·蓝细菌异形胞的发育机制第23-35页
     ·蓝细菌背景介绍第23-24页
     ·蓝细菌异形胞的特征第24-26页
       ·异形胞的形态特征第24-25页
       ·异形胞的功能特征第25页
       ·蓝细菌氮源利用调节第25-26页
     ·异形胞的的发育机制第26-35页
       ·异形胞发育的调控第27-29页
       ·异形胞空间分布模式的调控第29-31页
     ·3 调控异形胞包被形成的基因第31页
       ·异形胞特异性染色体重排第31-34页
       ·异形胞代谢的调控第34-35页
   ·细胞分裂和分化第35-42页
     ·Escherichia.coli染色体复制第36-37页
     ·Caulobacter crescentus的发育第37-40页
     ·Bacillus subtilis的芽孢分化第40-42页
   ·研究目的和意义第42-46页
2.材料和方法第46-68页
   ·菌株与质粒第46页
   ·培养基配方以及培养条件第46-47页
   ·常用贮存液和缓冲液配方第47-49页
     ·贮存液第47-48页
     ·缓冲液第48-49页
       ·常用缓冲溶液第48页
       ·质粒DNA小量制备的碱裂解缓冲液第48-49页
   ·主要的分子生物学试剂第49页
   ·实验方法第49-68页
     ·Anabaena PCC 7120基因组中DNA聚合酶基因的查找与分析第49-50页
       ·Anabaena PCC 7120中的DNA聚合酶查找第49-50页
     ·Anabaena PCC 7120总DNA的抽提第50页
       ·大量抽提总DNA第50页
       ·小量抽提总DNA第50页
     ·Anabaena PCC 7120异形胞的诱导和分离第50-51页
       ·异形胞的常规分离第50-51页
       ·异形胞的快速分离第51页
     ·质粒DNA的制备及其基本操作第51-52页
       ·大肠杆菌质粒DNA的大量(少量)提取第51页
       ·质粒DNA的操作第51-52页
       ·质粒DNA去磷酸化第52页
     ·转化第52-54页
       ·大肠杆菌的常规转化第52页
       ·大肠杆菌表达宿主细胞的转化第52页
       ·Anabaena PCC 7120通过三亲本杂交进行基因转移第52-54页
     ·PCR介导的dnaA基因的体外定点突变第54-55页
     ·dnaENI和dnaECI的启动子与报告基因gfp融合载体的构建第55页
     ·重组融合表达质粒的构建第55-56页
     ·蛋白质的表达和纯化第56-60页
       ·蛋白质的诱导表达第56-57页
       ·蛋白质表达产物的小量制备第57-58页
       ·蛋白质表达产物的大量制备第58-59页
       ·蛋白质的聚丙烯酰胺凝胶电泳第59页
       ·蛋白质的纯化第59-60页
     ·抗血清的制备和纯化第60-63页
       ·家兔的免疫第60-61页
       ·抗血清的收集和保存第61-62页
       ·抗体的纯化第62-63页
     ·Anabaena PCC 7120中蛋白质的制备和定量第63-65页
       ·营养细胞中蛋白质的提取第63-64页
       ·异形胞及两种类型混合的细胞的蛋白质提取第64页
       ·蛋白质定量第64-65页
     ·Western Blotting第65-68页
       ·蛋白质印迹:从SDS—PAGE向硝酸纤维素膜上进行半干式转移第65-66页
       ·免疫杂交第66页
       ·PVDF印迹第66-68页
3.结果与分析第68-93页
   ·Anabaena PCC 7120中DNA复制蛋白质或酶的生物信息学分析第68-72页
     ·DNA复制过程中涉及到的蛋白质或酶的比较分析第68-70页
     ·蛋白内含子(内含肽)在Anabaena PCC 7120染色体上的分布第70-71页
     ·Anabaena PCC 7120和Synechocystis PCC 6803的DnaE/dnaE之间的比较第71-72页
   ·重组蛋白的表达第72-78页
     ·DnaA蛋白质的表达第72页
     ·不同的DnaE多肽的表达第72-78页
       ·DnaENI'和DnaECI'重组融合表达质粒的构建第73-75页
       ·DnaENI'和DnaECI'双重组融合表达质粒的构建第75-76页
       ·成熟的DnaE重组表达质粒的构建第76-77页
       ·不同的DnaE多肽的表达第77-78页
   ·抗血清的制备和纯化第78-79页
   ·Anabaena PCC 7120中DnaE蛋白内含子的体外反式剪接第79-81页
     ·DnaE蛋白内含子的体外反式剪接第79-80页
     ·DnaE蛋白内含子在大肠杆菌体内的反式剪接第80-81页
   ·Anabaena PCC 7120中DnaE蛋白内含子的体内反式剪接第81-84页
     ·DnaE蛋白内含子的体内反式剪接第81页
     ·DnaE蛋白内含子在两种不同类型细胞内的反式剪接第81-82页
     ·DnaE蛋白在Anabaena PCC 7120细胞中的存在形式第82-84页
       ·DnaE蛋白在Anabaena PCC 7120营养细胞中的存在形式第82-83页
       ·DnaENI蛋白在Anabaena PCC 7120两种类型细胞中的存在第83-84页
   ·dnaENI和dnaECI在Anabaena PCC 7120中的转录分析第84-88页
     ·dnaENI和dnaECI在营养细胞内的转录分析第86-87页
     ·dnaENI和dnaECl在异形胞中的转录分析第87-88页
   ·Anabaena PCC 7120中DnaA蛋白在异形胞中的表达第88页
   ·Anabaena PCC 7120温度敏感型的筛选第88-93页
     ·Anabaena PCC 7120与E. coli的DnaA蛋白质序列比较第89-90页
     ·引物的设计第90-91页
     ·高保真PCR第91页
     ·突变的dnaA基因克隆到pBluescript SK上第91页
     ·突变的dnaA基因插入到整合质粒pRL271中第91-92页
     ·温度敏感型突变株的筛选第92-93页
4.讨论第93-98页
参考文献第98-111页
致谢第111页

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