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四倍体小麦“Langdon”低分子量谷蛋白Glu-3位点的BAC序列分析

第一章 文献综述第1-25页
   ·小麦低分子量谷蛋白分类第11-13页
   ·小麦低分子量麦谷蛋白基因的定位第13-14页
   ·小麦低分子量谷蛋白基因的克隆及结构特点第14-17页
   ·Glu-3基因特异标记的开发第17-18页
   ·小麦Glu-3位点的进化分析第18-20页
   ·低分子量谷蛋白亚基组分与品质性状的关系第20-23页
   ·立题依据及技术路线第23-25页
     ·立题依据第23页
     ·技术路线第23-25页
第二章 携带Glu-3位点BAC克隆的筛选及其BAC跨叠群的构建第25-42页
   ·材料与方法第26-36页
     ·材料第26页
     ·方法第26-36页
       ·BAC克隆插入片段检测第26-28页
       ·利用分子标记鉴定携带Glu-3阳性克隆第28-35页
       ·携带有Glu-3位点BAC克隆跨叠群的构建第35-36页
   ·结果与分析第36-41页
     ·BAC克隆插入片段大小的检测第36页
     ·携带Glu-A3和Glu-B3阳性BAC克隆的确定第36-40页
     ·BAC跨叠群的构建第40-41页
   ·讨论第41-42页
第三章 携带Glu-3基因BAC B9和D5亚克隆文库的构建及其序列分析第42-79页
   ·材料与方法第42-53页
     ·材料第42页
     ·方法第42-53页
       ·Southern杂交定位BAC B9和BAC D5第42页
       ·BAC Shotgun文库的构建第42-49页
       ·亚克隆测序第49-51页
       ·BAC末端测序第51-52页
       ·BAC全序列的拼接软件及参数选择第52-53页
       ·BAC全序列分析软件第53页
   ·结果与分析第53-74页
     ·四倍体小麦Langdon BAC B9和BAC D5的定位第53-55页
     ·BAC质粒DNA的质量和浓度检测第55页
     ·BAC质粒的切割及片段长度的选择第55-56页
     ·BAC亚克隆文库的质量评价第56-57页
     ·BAC克隆的序列组装及验证第57-60页
       ·BAC亚克隆的测序与序列组装第57-58页
       ·BAC全序列长度的验证第58-60页
     ·四倍体小麦Langdon BAC B9序列分析第60-68页
       ·BAC B9的基因分布密度第60-61页
       ·低分子量谷蛋白基因分析第61-64页
       ·BAC B9中ω-gliadin基因的序列分析第64-65页
       ·BAC B9的重复序列分布第65-66页
       ·BAC B9中基因的复制、缺失过程第66页
       ·小麦基因组之间的共线性分析第66-68页
     ·四倍体小麦Langdon BAC D5的序列分析第68-74页
       ·BAC D5的基因分布密度第68-69页
       ·BAC D5中低分子量谷蛋白基因Glu-A3的分析第69-71页
       ·BAC D5中γ-gliadin基因的序列分析第71-72页
       ·四倍体小麦Langdon BAC D5中重复序列的分布第72-73页
       ·BAC D5序列与水稻BAC序列的直向同源进化分析第73-74页
   ·讨论第74-79页
     ·BAC Shotgun文库构建、测序及序列组装时应注意问题第74-75页
     ·四倍体小麦Langdon低分子量谷蛋白基因的克隆第75-76页
     ·醇溶蛋白和低分子量谷蛋白基因之间的物理距离第76页
     ·不规则的重组是基因组扩增和紧缩的原因之一第76页
     ·基因在基因组中的分布第76-77页
     ·Glu-3-Pm3b区域在小麦属内的共线性第77页
     ·Glu-3基因所在的区域与水稻的相应区段的共线性第77-79页
第四章 全文小结第79-81页
参考文献第81-91页
附录第91-95页
致谢第95-97页
博士期间发表和待发论文第97页

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