致谢 | 第1-5页 |
中文摘要 | 第5-7页 |
英文摘要 | 第7-21页 |
第一部分 文献综述 | 第21-67页 |
第一章 鲟形目鱼类的种类与分布 | 第21-49页 |
1 鲟形目鱼类的种类及主要形态特征 | 第21-28页 |
·鲟形目鱼类的种类组成 | 第21-25页 |
·现生鲟鱼类的主要形态特征 | 第25-28页 |
·科属的鉴别特征 | 第25页 |
·种的鉴别特征 | 第25-28页 |
2 鲟鱼类的系统发育关系及其争论性问题 | 第28-40页 |
·鲟形目鱼类系统发育研究现状 | 第28-37页 |
·形态学上的系统发育关系 | 第28-29页 |
·骨骼学上的系统发育关系 | 第29-30页 |
·细胞遗传学上的系统发育关系 | 第30-31页 |
·分子水平上的系统发育关系 | 第31-37页 |
·系统发育研究中的争议性问题 | 第37-40页 |
·Huso 与Acipenser | 第37-38页 |
·A. medirostris 与A. mikadoi | 第38-39页 |
·A. sturio 与A. oxyrinchus | 第39页 |
·A. gueldenstaedtii 与A. persicus | 第39页 |
·关于鲟属的单源性问题 | 第39-40页 |
·铲鲟与拟铲鲟 | 第40页 |
3 鲟鱼的起源与分布 | 第40-46页 |
·鲟鱼的起源 | 第40-42页 |
·现生鲟鱼的分布 | 第42-46页 |
·亚欧大陆及沿海的鲟鱼分布 | 第42-45页 |
·北美鲟鱼的分布 | 第45-46页 |
4 鲟鱼种类与分布之间的联系 | 第46-49页 |
第二章 微卫星DNA 的进化及应用 | 第49-67页 |
1 微卫星简介 | 第49-51页 |
2 微卫星进化 | 第51-62页 |
·微卫星DNA 突变的分子机制 | 第51-54页 |
·微卫星突变的偏向性 | 第54-56页 |
·微卫星突变的理论模型 | 第56-58页 |
·微卫星突变模型的检验 | 第58-59页 |
·微卫星的产生与死亡 | 第59-62页 |
3 微卫星标记的局限性 | 第62-63页 |
4 鲟鱼类微卫星DNA 研究的现状及本研究的目的意义 | 第63-67页 |
第二部分 Spl-106 位点特性的初步研究 | 第67-123页 |
第三章 鲟鱼中微卫星Spl-106 位点高度变异性的发现 | 第67-87页 |
1 前言 | 第67-68页 |
2 材料与方法 | 第68-74页 |
·实验材料 | 第68-70页 |
·鲟鱼分子材料的采集 | 第68页 |
·引物来源 | 第68-70页 |
·实验方法 | 第70-74页 |
·中华鲟基因组DNA 的提取 | 第70-71页 |
·PCR 扩增 | 第71页 |
·电泳 | 第71-72页 |
·PCR 产物片段回收与TA 克隆 | 第72页 |
·重组质粒转化感受态细胞 | 第72-74页 |
·PCR 鉴定连接转化效果和DNA 测序 | 第74页 |
3 实验结果 | 第74-82页 |
·湖鲟和铲鲟微卫星引物在中华鲟上的扩增 | 第74-77页 |
·影子带现象 | 第77-78页 |
·各引物PCR 产物序列在鲟鱼间的差异比较 | 第78页 |
·关于Spl-106 位点高度变异性的确认 | 第78-82页 |
·引物As-100 与原引物Spl-106 扩增产物序列比较 | 第78-80页 |
·Spl-106 位点在5 种鲟鱼中的序列比较 | 第80-82页 |
4 讨论 | 第82-87页 |
·微卫星引物选用标准 | 第82-84页 |
·Spl-106 位点在鲟鱼种间复杂变异的初步认定 | 第84-87页 |
第四章 Spl-106 位点多态性及异源同形现象 | 第87-109页 |
1 前言 | 第87页 |
2 材料与方法 | 第87-94页 |
·实验材料 | 第87-88页 |
·引物 | 第87-88页 |
·鲟鱼材料 | 第88页 |
·实验方法 | 第88-92页 |
·基因组DNA 的提取 | 第88页 |
·PCR 扩增 | 第88-92页 |
·电泳 | 第92页 |
·琼脂糖胶回收DNA 实验步骤 | 第92页 |
·TA 克隆 | 第92页 |
·重组质粒转化感受态细胞 | 第92页 |
·蓝白显色与挑克隆 | 第92页 |
·PCR 鉴定连接转化效果和DNA 测序 | 第92页 |
·数据分析 | 第92-94页 |
3 结果 | 第94-101页 |
·Spl-106 位点引物在各种鲟鱼中的交叉扩增 | 第94页 |
·Spl-106 位点在各种鲟鱼种群中的多态性分析 | 第94-96页 |
·等位基因的出现频率与长度分布 | 第96-100页 |
·各鲟鱼种群内的等位基因频率分布 | 第96-99页 |
·中华鲟家系内部的等位基因频率与分布 | 第99-100页 |
·异源同形现象(Size homoplasy) | 第100-101页 |
4 讨论 | 第101-109页 |
·微卫星引物的种间交叉扩增及多态性分析 | 第101-102页 |
·影响微卫星标记数据准确性的因素 | 第102-104页 |
·中华鲟及其他鲟鱼的倍性分析 | 第104-109页 |
第五章 Spl-106 位点引物As-100 的多位点扩增现象 | 第109-123页 |
1 前言 | 第109-110页 |
2 材料与方法 | 第110页 |
·材料 | 第110页 |
·实验方法 | 第110页 |
·序列数据分析 | 第110页 |
3 结果 | 第110-119页 |
·引物As-100 在各种鲟鱼中的多位点扩增现象 | 第110-114页 |
·20 个不同位点5’端侧翼序列的比较 | 第114页 |
·欧洲鲟中多个位点的序列分析及与Spl-106 位点的比较 | 第114-116页 |
·几个特殊位点的序列结构特点 | 第116-119页 |
4 讨论 | 第119-123页 |
·多位点扩增现象对微卫星标记的影响 | 第119-120页 |
·各位点序列比较分析 | 第120-121页 |
·关于微卫星的产生和死亡 | 第121-123页 |
第三部分 Spl-106 位点复杂变异的研究 | 第123-159页 |
第六章 Spl-106 位点等位基因序列在鲟鱼种内与种间的变异 | 第123-145页 |
1 前言 | 第123页 |
2 材料与方法 | 第123-126页 |
·实验材料与方法 | 第123-124页 |
·鲟鱼材料 | 第123-124页 |
·实验步骤 | 第124页 |
·数据分析 | 第124-126页 |
·突变类型的统计方法 | 第124-125页 |
·突变频率的计算 | 第125-126页 |
3 结果 | 第126-141页 |
·中华鲟种群及家系Spl-106 位点的序列变异 | 第126-128页 |
·其他鲟鱼Spl-106 位点的序列变异 | 第128-137页 |
·达氏鲟 | 第128页 |
·西伯利亚鲟 | 第128-129页 |
·史氏鲟 | 第129页 |
·俄罗斯鲟 | 第129页 |
·达乌尔鳇 | 第129-130页 |
·小体鲟 | 第130页 |
·欧洲鳇 | 第130页 |
·高首鲟 | 第130-131页 |
·湖鲟 | 第131页 |
·闪光鲟 | 第131-137页 |
·Spl-106 位点等位基因序列在鲟鱼种间的比较 | 第137-139页 |
·核心重复序列的比较 | 第137-139页 |
·Spl-106 位点侧翼序列在各种鲟鱼间的变异 | 第139页 |
·Spl-106 位点的突变类型分析及种间突变频率的比较 | 第139-141页 |
4 讨论 | 第141-145页 |
·Spl-106 位点突变的复杂性及鲟鱼种间的亲缘度分析 | 第141-143页 |
·Spl-106 位点突变类型及进化方向 | 第143-145页 |
第七章 Spl-106 位点的突变模式及鲟形目若干种类的演化关系 | 第145-157页 |
1 前言 | 第145-146页 |
2 材料与方法 | 第146页 |
·实验材料和方法 | 第146页 |
·数据分析 | 第146页 |
3 结果与讨论 | 第146-157页 |
·Spl-106 位点的突变模式分析 | 第146-150页 |
·鲟形目若干种类的系统发育关系分析 | 第150-157页 |
·基于Spl-106 位点侧翼序列构建分子系统树 | 第150-154页 |
·各鲟鱼种间的亲缘关系分析 | 第154-155页 |
·微卫星侧翼序列用于物种系统进化关系研究的可行性 | 第155-157页 |
第八章 小结 | 第157-159页 |
参考文献 | 第159-181页 |
缩略语表 | 第181-183页 |
附录 | 第183-191页 |
发表文章 | 第191页 |