| 中文摘要 | 第1-8页 |
| 英文摘要 | 第8-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-22页 |
| 1．1 野生稻，水稻改良中一个有用的基因库 | 第11页 |
| 1．2 对于亚洲栽培稻（Oryza sativa）改良，长雄野生稻（Oryza longisatminata）是24个稻属种中潜在的有利基因库之一 | 第11-13页 |
| 1．3 遗传标记 | 第13-14页 |
| 1．4 数量性状位点（QTL）作图方法 | 第14-15页 |
| 1．5 基因定位及QTL作图群体 | 第15-16页 |
| 1．6 分子标记在稻作遗传育种中的应用 | 第16-18页 |
| 1．6．1 分子连锁图的构建 | 第16页 |
| 1．6．2 基因标记（定位） | 第16页 |
| 1．6．3 QTL作图 | 第16-17页 |
| 1．6．4 标记辅助选择（MAS） | 第17页 |
| 1．6．5 图位克隆 | 第17-18页 |
| 1．7 水稻全基因组序列草图 | 第18-22页 |
| 2 引言 | 第22-26页 |
| 3 材料与方法 | 第26-32页 |
| 3．1 遗传分析材料 | 第26页 |
| 3．2 作图群体的培育 | 第26页 |
| 3．3 田间试验与设计 | 第26-27页 |
| 3．4 性状调查及标准 | 第27-28页 |
| 3．4．1 地下茎的调查及标准 | 第27页 |
| 3．4．2 与多年生性有关性状的调查及标准 | 第27-28页 |
| 3．5 表现型分析 | 第28页 |
| 3．6 微卫星（SSR）标记 | 第28页 |
| 3．7 DNA的提取、准备，SSR扩增反应和扩增产物的电泳、检测 | 第28-30页 |
| 3．7．1 DNA的提取 | 第28-29页 |
| 3．7．2 DNA浓度的矫正 | 第29页 |
| 3．7．3 SSR扩增反应 | 第29-30页 |
| 3．7．4 PCR产物的电泳、染色和数据的读取 | 第30页 |
| 3．8 作图方法 | 第30页 |
| 3．9 图谱的比较 | 第30页 |
| 3．10 分子定位方法 | 第30-31页 |
| 3．11 QTL作图方法 | 第31页 |
| 3．12 QTL的命名 | 第31-32页 |
| 4 结果与分析 | 第32-59页 |
| 4．1 微卫星（SSR）标记的亲本多态性 | 第32页 |
| 4．2 分子连锁图 | 第32页 |
| 4．3 稻属（Oryza）中新的SSR引物位点 | 第32页 |
| 4．4 染色体区域的偏分离 | 第32-42页 |
| 4．5 SSR标记的偏分离 | 第42页 |
| 4．6 地下茎性状的田间表现及遗传分析 | 第42-44页 |
| 4．6．1 两个亲本及F_1的地下茎表现 | 第42-44页 |
| 4．6．2 两个回交世代的地下茎表现 | 第44页 |
| 4．6．3 F_2地下茎表现及两对显性互补基因遗传模型的假设 | 第44页 |
| 4．7 地下茎基因的分子定位 | 第44-51页 |
| 4．7．1 地下茎基因与分子标记连锁分析 | 第45-51页 |
| 4．7．2 两对显性互补基因控制地下茎表达遗传模型的验证 | 第51页 |
| 4．7．3 地下茎主基因在染色体上的定位 | 第51页 |
| 4．8 地下茎生长性状的表型变异分析 | 第51-55页 |
| 4．9 地下茎生长性状的相关分析 | 第55页 |
| 4．10 地下茎生长性状的QTLs效应 | 第55-59页 |
| 5 讨论 | 第59-68页 |
| 5．1 长雄野生稻（O．longistaminata）的多样性和杂合性 | 第59-61页 |
| 5．2 标记的偏分离 | 第61页 |
| 5．3 双基因遗传模型的基因定位方法 | 第61-62页 |
| 5．4 长雄野生稻地下茎遗传的问题 | 第62-66页 |
| 5．5 双基因互补的验证 | 第66页 |
| 5．6 关于BC_1R（F_1/RD23）群体中地下茎表达的问题 | 第66-68页 |
| 6 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-80页 |
| 在学期间发表论文 | 第80-81页 |
| 在学期间承担过的科研课题 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82-84页 |
| 附录A： 表目录 | 第84-85页 |
| 附录B： 图目录 | 第85页 |
