基于软计算的基因调控网络应用研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·选题背景和研究意义 | 第7-10页 |
| ·功能基因组学 | 第7-8页 |
| ·软计算方法 | 第8-10页 |
| ·研究意义 | 第10页 |
| ·研究现状 | 第10-11页 |
| ·研究内容 | 第11-12页 |
| ·论文结构 | 第12-13页 |
| 第二章 基因调控网络概述 | 第13-19页 |
| ·与基因调控网络有关的生物学知识 | 第13-14页 |
| ·基因表达调控 | 第14-15页 |
| ·基因调控网络 | 第15-17页 |
| ·细胞周期调控 | 第16页 |
| ·埃希氏菌属大肠杆菌SOS DNA 修复网络 | 第16-17页 |
| ·利用生物学工具和计算技术分析和重建基因调控网络 | 第17-19页 |
| ·利用生物学工具获得大量基因表达数据 | 第17-18页 |
| ·利用计算技术分析和重建基因调控网络 | 第18-19页 |
| 第三章 基因调控网络模型概要 | 第19-25页 |
| ·布尔网络模型 | 第19-21页 |
| ·传统的布尔网络模型 | 第19-20页 |
| ·改进的布尔网络模型——概率布尔网络 | 第20-21页 |
| ·线性微分方程模型 | 第21-22页 |
| ·贝叶斯网络模型 | 第22-23页 |
| ·普通贝叶斯网络模型 | 第22-23页 |
| ·动态贝叶斯网络模型 | 第23页 |
| ·递归神经网络模型 | 第23-25页 |
| 第四章 结合软计算方法推断基因调控网络模型 | 第25-41页 |
| ·进化计算方法介绍 | 第25-27页 |
| ·遗传算法 | 第26页 |
| ·粒子群优化算法 | 第26-27页 |
| ·稳态系统模型 | 第27-35页 |
| ·稳态系统模型介绍 | 第27-28页 |
| ·使用遗传算法重构网络模型 | 第28-30页 |
| ·使用粒群优化算法重构网络模型 | 第30页 |
| ·实验及结果 | 第30-35页 |
| ·基于惯性法则的微分动力学模型 | 第35-40页 |
| ·基于惯性法则的二阶微分动力学模型 | 第35-36页 |
| ·对模型进行非线性化改进 | 第36页 |
| ·引入递归神经网络进行仿真 | 第36-37页 |
| ·实验及结果 | 第37-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第五章 总结与展望 | 第41-43页 |
| ·总结 | 第41页 |
| ·展望 | 第41-43页 |
| 致谢 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-47页 |
| 附录：作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第47页 |
