基因序列数据的启动子识别系统研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-18页 |
| ·课题研究的背景和意义 | 第10-12页 |
| ·生物信息学简介 | 第10-11页 |
| ·论文研究的目的和意义 | 第11-12页 |
| ·国内外研究现状 | 第12-16页 |
| ·本文的主要工作 | 第16-18页 |
| 第2章 启动子序列的特征提取与压缩 | 第18-37页 |
| ·生物学背景知识 | 第18-23页 |
| ·基因 | 第18-21页 |
| ·启动子 | 第21-23页 |
| ·生物数据库及数据格式 | 第23-28页 |
| ·生物信息学中的数据库 | 第23-24页 |
| ·GenBank数据库及其数据格式 | 第24-27页 |
| ·FASTA数据格式 | 第27-28页 |
| ·启动子特征 | 第28-31页 |
| ·序列信号特征 | 第29页 |
| ·序列内容特征 | 第29-31页 |
| ·特征提取 | 第31-32页 |
| ·位置权重矩阵 | 第31页 |
| ·核苷酸联体矩阵 | 第31-32页 |
| ·特征压缩 | 第32-36页 |
| ·主成分分析概述 | 第33-35页 |
| ·基于PCA的特征压缩 | 第35-36页 |
| ·本章小结 | 第36-37页 |
| 第3章 启动子识别算法的设计 | 第37-48页 |
| ·分类器的选择 | 第37-44页 |
| ·BP神经网络简介 | 第37-42页 |
| ·BP神经网络设计 | 第42-44页 |
| ·CpG岛相关特征 | 第44-45页 |
| ·启动子识别算法 | 第45-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第4章 启动子识别系统的设计与实现 | 第48-61页 |
| ·实验数据的获取 | 第48-50页 |
| ·启动子识别系统结构 | 第50-54页 |
| ·总体结构 | 第50页 |
| ·特征向量创建和主成分分析模块 | 第50-51页 |
| ·分类器设计 | 第51-54页 |
| ·CpG岛模块 | 第54页 |
| ·数据处理模块 | 第54页 |
| ·实验结果分析 | 第54-60页 |
| ·系统分类器训练 | 第54-57页 |
| ·系统分类结果 | 第57-58页 |
| ·系统性能比较 | 第58-60页 |
| ·本章小结 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-69页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文和取得的科研成果 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
