| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 综述 | 第13-50页 |
| 第一节 分子标记概述 | 第13-37页 |
| ·遗传标记及其发展 | 第13-15页 |
| ·形态标记 | 第13-14页 |
| ·细胞学标记 | 第14页 |
| ·生化标记 | 第14-15页 |
| ·分子标记 | 第15页 |
| ·分子标记及其应用 | 第15-23页 |
| ·分子标记的分类 | 第15-22页 |
| ·分子标记的用途 | 第22-23页 |
| ·SNP 的检测及分型方法 | 第23-37页 |
| ·基于电泳的SNP 检测方法 | 第23-26页 |
| ·基于杂交的SNP 检测方法 | 第26-29页 |
| ·基于测序的SNP 检测方法 | 第29-32页 |
| ·基于等位基因特异性扩增的SNP 检测方法 | 第32-33页 |
| ·基于连接酶的SNP 检测方法 | 第33-35页 |
| ·基于酶切的SNP 检测方法 | 第35-37页 |
| 第二节 皱纹盘鲍研究现状 | 第37-45页 |
| ·鲍的育种和养殖现状 | 第37-38页 |
| ·鲍染色体组型研究 | 第38-39页 |
| ·皱纹盘鲍分子生物学研究进展 | 第39-45页 |
| ·分子标记技术及其应用 | 第39-42页 |
| ·遗传连锁图谱构建 | 第42-43页 |
| ·功能基因的克隆及表达分析 | 第43页 |
| ·存在的问题 | 第43-45页 |
| 第三节 SNP 在水产动物中的研究进展 | 第45-48页 |
| ·在鱼类等中的研究进展 | 第45-46页 |
| ·在贝类中的研究进展 | 第46-48页 |
| 第四节 本研究立论依据及目的意义 | 第48-50页 |
| ·研究背景及立论依据 | 第48页 |
| ·研究内容 | 第48页 |
| ·研究目的及意义 | 第48-50页 |
| 第二章 基于EST 序列比对分析的皱纹盘鲍SNP 筛选 | 第50-58页 |
| 前言 | 第50-51页 |
| ·材料与方法 | 第51-53页 |
| ·序列获得 | 第51页 |
| ·公共数据库EST 序列获得 | 第51页 |
| ·构建cDNA 文库获得EST | 第51页 |
| ·序列整理及筛选 | 第51页 |
| ·序列拼接 | 第51-52页 |
| ·SNP 开发 | 第52-53页 |
| ·SNP 筛选标准 | 第52页 |
| ·SNP 位点统计 | 第52页 |
| ·含有SNP 的EST 功能推测 | 第52-53页 |
| ·结果与分析 | 第53-56页 |
| ·序列拼接 | 第53页 |
| ·EST-contig 分析 | 第53-56页 |
| ·SNP 统计 | 第56页 |
| ·讨论 | 第56-58页 |
| 第三章 皱纹盘鲍SNP 检测及分型方法探讨 | 第58-87页 |
| 前言 | 第58-59页 |
| 第一节 DNA 测序法在SNP 验证中的应用 | 第59-71页 |
| ·材料与方法 | 第59-63页 |
| ·材料 | 第59页 |
| ·试剂及仪器 | 第59-60页 |
| ·基因组DNA 制备 | 第60-61页 |
| ·引物设计 | 第61页 |
| ·引物筛选 | 第61-62页 |
| ·PCR 扩增及测序 | 第62-63页 |
| ·结果与分析 | 第63-69页 |
| ·PCR 模板制备 | 第63-64页 |
| ·引物设计及筛选 | 第64-66页 |
| ·SNP 验证 | 第66-69页 |
| ·讨论 | 第69-71页 |
| 第二节 等位基因特异PCR 的建立及优化 | 第71-87页 |
| ·材料与方法 | 第71-78页 |
| ·DNA 提取 | 第71页 |
| ·参考样品制备及基因型分析 | 第71页 |
| ·AS-PCR 引物设计原则 | 第71-72页 |
| ·引物错配对PCR 扩增的影响 | 第72-75页 |
| ·单管4 引物AS-PCR 引物设计 | 第75-76页 |
| ·AS-PCR 反应条件确定 | 第76-77页 |
| ·鲍鱼个体SNP 基因型检测 | 第77-78页 |
| ·结果与分析 | 第78-83页 |
| ·与模板含有错配的引物PCR 扩增结果 | 第78-81页 |
| ·AS-PCR 优化 | 第81页 |
| ·SNP 检测 | 第81-83页 |
| ·讨论 | 第83-87页 |
| ·引物-模板错配对PCR 的影响 | 第83-85页 |
| ·AS-PCR 引物设计 | 第85-86页 |
| ·AS-PCR 反应条件 | 第86页 |
| ·AS-PCR 的准确性 | 第86-87页 |
| 第四章 皱纹盘鲍作图家系基因相关SNP 标记开发及分析 | 第87-116页 |
| 前言 | 第87-88页 |
| 第一节 基因相关SNP 标记开发 | 第88-111页 |
| ·材料与方法 | 第88-90页 |
| ·材料 | 第88页 |
| ·SNP 开发策略 | 第88-89页 |
| ·引物设计、扩增及测序 | 第89-90页 |
| ·结果与分析 | 第90-109页 |
| ·用于设计基因组扩增引物的EST 序列 | 第90-97页 |
| ·基因组扩增结果 | 第97-103页 |
| ·测序结果及SNPs 统计 | 第103-109页 |
| ·讨论 | 第109-111页 |
| ·引物设计及筛选 | 第109页 |
| ·寻找内含子中的SNP 位点 | 第109页 |
| ·直接测序开发SNP | 第109-110页 |
| ·内含子序列的多态性 | 第110-111页 |
| 第二节 SNP 在作图家系中的分离方式检验 | 第111-116页 |
| ·材料与方法 | 第111页 |
| ·动物材料 | 第111页 |
| ·引物设计及筛选 | 第111页 |
| ·SNP 基因型分析 | 第111页 |
| ·结果与分析 | 第111-115页 |
| ·讨论 | 第115-116页 |
| 第五章 总结 | 第116-118页 |
| 参考文献 | 第118-135页 |
| 致谢 | 第135页 |