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中国野生香鱼(Plecoglossus altivelis)遗传多样性分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 前言第11-23页
 1 香鱼概述第11-15页
   ·香鱼生物学第11-12页
   ·国内外香鱼研究概述第12-15页
     ·香鱼分类地位的研究第12-13页
     ·香鱼遗传多样性研究概述第13-14页
       ·国外香鱼遗传多样性研究概述第13页
       ·国内香鱼遗传多样性研究概述第13-14页
     ·小结第14-15页
 2 遗传多样性及其研究方法第15-19页
   ·遗传多样性概念第15页
   ·遗传多样性研究常用的分子标记第15-19页
     ·RFLP第16页
     ·RAPD第16-17页
     ·AFLP第17页
     ·SSR第17-18页
     ·DNA序列分析法第18-19页
 3 鱼类线粒体DNA分子简介第19-22页
   ·鱼类线粒体DNA分子的一般结构第19-20页
   ·鱼类线粒体DNA分子的特征第20页
   ·鱼类线粒体控制区的一般特征第20-21页
   ·鱼类线粒体ND2和ND4基因的一般特征第21-22页
 4 研究目的与意义第22-23页
第二章 材料和方法第23-31页
 1 实验材料第23-25页
 2 研究方法第25-31页
   ·香鱼DNA的提取及检测第25-26页
   ·PCR扩增第26-27页
   ·扩增产物测序第27-28页
   ·数据处理第28-31页
     ·序列比对及人工校对第28页
     ·控制区结构分析第28页
     ·遗传多样性及遗传结构第28-29页
     ·系统发育树及网状支系图第29-30页
     ·种群历史动态分析第30-31页
第三章 结果与分析第31-58页
 第一节 控制区全序列分析第31-45页
   ·香鱼线粒体控制区全序列特征第31-34页
     ·香鱼线粒体控制区的组成第31页
     ·香鱼线粒体控制区的结构第31-34页
   ·香鱼群体遗传多样性第34-36页
     ·单倍型分布情况第34-35页
     ·香鱼的遗传多样性指数第35-36页
   ·香鱼群体遗传结构第36-40页
     ·遗传距离第36页
     ·群体间系统树第36-37页
     ·香鱼系统发育树第37-38页
     ·遗传分化系数和基因流第38-39页
     ·地理隔离模式第39-40页
   ·香鱼的种群动态第40-42页
     ·中性检测第40页
     ·歧点分布第40-41页
     ·单倍型间网状支系分析第41-42页
   ·分子变异分析第42-43页
   ·中国香鱼的分类地位第43-45页
 第二节 ND4基因片段分析第45-49页
   ·香鱼线粒体ND4基因序列特征第45页
   ·香鱼群体遗传多样性第45-46页
     ·单倍型分布情况第45-46页
     ·遗传多样性指数第46页
   ·中国香鱼的分类地位第46-49页
     ·群体间系统树第46-47页
     ·香鱼系统发育树第47-49页
 第三节 ND2基因全序列分析第49-58页
   ·香鱼线粒体ND2基因全序列特征第49-51页
     ·香鱼ND2基因序列组成第49-50页
     ·香鱼ND2基因密码子偏倚性分析第50-51页
   ·香鱼群体遗传多样性第51-53页
     ·单倍型分布情况第51-52页
     ·香鱼的遗传多样性指数第52-53页
   ·香鱼群体遗传结构第53-55页
     ·遗传距离第53页
     ·群体间系统树第53-54页
     ·香鱼系统发育树第54页
     ·遗传分化系数和基因流第54-55页
   ·香鱼的种群动态第55-57页
     ·中性检测第55-56页
     ·单倍型间网状支系分析第56-57页
   ·分子变异分析第57-58页
第四章 讨论第58-65页
   ·中国香鱼分类地位的讨论第58页
   ·中国香鱼的群体遗传结构第58-60页
   ·中国香鱼的遗传多样性第60-61页
   ·中国香鱼的种群历史动态第61-62页
   ·三种分子标记功能比较第62-63页
   ·中国香鱼遗传多样性保护策略第63-65页
第五章 结论第65-66页
参考文献第66-79页
攻读硕士学位期间发表的论文第79-80页
致谢第80页

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