中国野生香鱼(Plecoglossus altivelis)遗传多样性分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-23页 |
| 1 香鱼概述 | 第11-15页 |
| ·香鱼生物学 | 第11-12页 |
| ·国内外香鱼研究概述 | 第12-15页 |
| ·香鱼分类地位的研究 | 第12-13页 |
| ·香鱼遗传多样性研究概述 | 第13-14页 |
| ·国外香鱼遗传多样性研究概述 | 第13页 |
| ·国内香鱼遗传多样性研究概述 | 第13-14页 |
| ·小结 | 第14-15页 |
| 2 遗传多样性及其研究方法 | 第15-19页 |
| ·遗传多样性概念 | 第15页 |
| ·遗传多样性研究常用的分子标记 | 第15-19页 |
| ·RFLP | 第16页 |
| ·RAPD | 第16-17页 |
| ·AFLP | 第17页 |
| ·SSR | 第17-18页 |
| ·DNA序列分析法 | 第18-19页 |
| 3 鱼类线粒体DNA分子简介 | 第19-22页 |
| ·鱼类线粒体DNA分子的一般结构 | 第19-20页 |
| ·鱼类线粒体DNA分子的特征 | 第20页 |
| ·鱼类线粒体控制区的一般特征 | 第20-21页 |
| ·鱼类线粒体ND2和ND4基因的一般特征 | 第21-22页 |
| 4 研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 材料和方法 | 第23-31页 |
| 1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2 研究方法 | 第25-31页 |
| ·香鱼DNA的提取及检测 | 第25-26页 |
| ·PCR扩增 | 第26-27页 |
| ·扩增产物测序 | 第27-28页 |
| ·数据处理 | 第28-31页 |
| ·序列比对及人工校对 | 第28页 |
| ·控制区结构分析 | 第28页 |
| ·遗传多样性及遗传结构 | 第28-29页 |
| ·系统发育树及网状支系图 | 第29-30页 |
| ·种群历史动态分析 | 第30-31页 |
| 第三章 结果与分析 | 第31-58页 |
| 第一节 控制区全序列分析 | 第31-45页 |
| ·香鱼线粒体控制区全序列特征 | 第31-34页 |
| ·香鱼线粒体控制区的组成 | 第31页 |
| ·香鱼线粒体控制区的结构 | 第31-34页 |
| ·香鱼群体遗传多样性 | 第34-36页 |
| ·单倍型分布情况 | 第34-35页 |
| ·香鱼的遗传多样性指数 | 第35-36页 |
| ·香鱼群体遗传结构 | 第36-40页 |
| ·遗传距离 | 第36页 |
| ·群体间系统树 | 第36-37页 |
| ·香鱼系统发育树 | 第37-38页 |
| ·遗传分化系数和基因流 | 第38-39页 |
| ·地理隔离模式 | 第39-40页 |
| ·香鱼的种群动态 | 第40-42页 |
| ·中性检测 | 第40页 |
| ·歧点分布 | 第40-41页 |
| ·单倍型间网状支系分析 | 第41-42页 |
| ·分子变异分析 | 第42-43页 |
| ·中国香鱼的分类地位 | 第43-45页 |
| 第二节 ND4基因片段分析 | 第45-49页 |
| ·香鱼线粒体ND4基因序列特征 | 第45页 |
| ·香鱼群体遗传多样性 | 第45-46页 |
| ·单倍型分布情况 | 第45-46页 |
| ·遗传多样性指数 | 第46页 |
| ·中国香鱼的分类地位 | 第46-49页 |
| ·群体间系统树 | 第46-47页 |
| ·香鱼系统发育树 | 第47-49页 |
| 第三节 ND2基因全序列分析 | 第49-58页 |
| ·香鱼线粒体ND2基因全序列特征 | 第49-51页 |
| ·香鱼ND2基因序列组成 | 第49-50页 |
| ·香鱼ND2基因密码子偏倚性分析 | 第50-51页 |
| ·香鱼群体遗传多样性 | 第51-53页 |
| ·单倍型分布情况 | 第51-52页 |
| ·香鱼的遗传多样性指数 | 第52-53页 |
| ·香鱼群体遗传结构 | 第53-55页 |
| ·遗传距离 | 第53页 |
| ·群体间系统树 | 第53-54页 |
| ·香鱼系统发育树 | 第54页 |
| ·遗传分化系数和基因流 | 第54-55页 |
| ·香鱼的种群动态 | 第55-57页 |
| ·中性检测 | 第55-56页 |
| ·单倍型间网状支系分析 | 第56-57页 |
| ·分子变异分析 | 第57-58页 |
| 第四章 讨论 | 第58-65页 |
| ·中国香鱼分类地位的讨论 | 第58页 |
| ·中国香鱼的群体遗传结构 | 第58-60页 |
| ·中国香鱼的遗传多样性 | 第60-61页 |
| ·中国香鱼的种群历史动态 | 第61-62页 |
| ·三种分子标记功能比较 | 第62-63页 |
| ·中国香鱼遗传多样性保护策略 | 第63-65页 |
| 第五章 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-79页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80页 |