| 摘要 | 第4-8页 |
| Abstract | 第8-13页 |
| 英文缩略词 | 第26-31页 |
| 引言 | 第31-35页 |
| 第一章 重症手足口病的免疫与代谢预测因子分析 | 第35-48页 |
| 1 前言 | 第35-37页 |
| 2 材料与方法 | 第37-39页 |
| 2.1 研究对象 | 第37-38页 |
| 2.1.1 研究对象与分组 | 第37页 |
| 2.1.2 纳入与排除标准 | 第37页 |
| 2.1.3 调查内容 | 第37-38页 |
| 2.1.4 样本量估算 | 第38页 |
| 2.2 研究方法 | 第38-39页 |
| 2.2.1 研究设计 | 第38页 |
| 2.2.2 统计分析方法 | 第38-39页 |
| 3 结果 | 第39-45页 |
| 3.1 农村生活、高热与HFMD严重程度有关 | 第39页 |
| 3.2 HFMD病例外周血免疫和代谢指标的变化 | 第39-41页 |
| 3.3 HFMD病例外周血免疫指标分析 | 第41-43页 |
| 3.4 HFMD病例外周血代谢指标分析 | 第43-44页 |
| 3.5 HFMD病例外周血炎症指标变化 | 第44页 |
| 3.6 重症HFMD预测因子的多元回归分析 | 第44-45页 |
| 4 讨论 | 第45-47页 |
| 5 小结 | 第47-48页 |
| 第二章 肠道病毒71型重症手足口病的血清代谢组学研究 | 第48-76页 |
| 1 前言 | 第48-50页 |
| 2 材料与方法 | 第50-55页 |
| 2.1 研究对象 | 第50-52页 |
| 2.1.1 研究对象与分组 | 第50页 |
| 2.1.2 纳入与排除标准 | 第50页 |
| 2.1.3 调查内容 | 第50-51页 |
| 2.1.4 血清收集 | 第51页 |
| 2.1.5 仪器与试剂 | 第51-52页 |
| 2.2 研究方法 | 第52-55页 |
| 2.2.1 代谢物的提取 | 第52页 |
| 2.2.2 上机检测 | 第52-53页 |
| 2.2.3 LC-MS检测进样步骤 | 第53-54页 |
| 2.2.4 数据预处理 | 第54页 |
| 2.2.5 统计学分析 | 第54-55页 |
| 3 结果 | 第55-73页 |
| 3.1 样本的基本信息 | 第55页 |
| 3.2 健康对照组、轻症组和重症组病例炎症水平比较 | 第55-56页 |
| 3.3 代谢轮廓分析 | 第56-62页 |
| 3.3.1 LC-MS代谢组学数据预处理 | 第56-57页 |
| 3.3.2 代谢轮廓LC-MS谱图获得及比较 | 第57-58页 |
| 3.3.3 质量控制与保证 | 第58-59页 |
| 3.3.4 代谢谱 | 第59-60页 |
| 3.3.5 PCA主成分析 | 第60-61页 |
| 3.3.6 PLS-DA分析 | 第61页 |
| 3.3.7 OPLS-DA分析 | 第61-62页 |
| 3.4 差异代谢物的筛选和鉴定 | 第62-66页 |
| 3.4.1 差异代谢物相关性矩阵分析 | 第65页 |
| 3.4.2 差异代谢产物热图分析 | 第65-66页 |
| 3.5 生物功能分析 | 第66-68页 |
| 3.6 主要差异表达代谢产物比较 | 第68-70页 |
| 3.7 ROC曲线分析 | 第70-72页 |
| 3.8 差异代谢产物与临床炎症相关指标的相关分析 | 第72-73页 |
| 4 讨论 | 第73-75页 |
| 5 小结 | 第75-76页 |
| 第三章 肠道病毒71型手足口病动物模型的构建 | 第76-117页 |
| 1 前言 | 第76-77页 |
| 2 材料与方法 | 第77-94页 |
| 2.1 材料 | 第77-83页 |
| 2.1.1 细胞株 | 第77页 |
| 2.1.2 实验动物 | 第77页 |
| 2.1.3 病毒 | 第77-78页 |
| 2.1.4 主要仪器与耗材 | 第78-79页 |
| 2.1.5 主要试剂与溶液配制 | 第79-82页 |
| 2.1.6 抗体信息 | 第82页 |
| 2.1.7 构建EV71受体h SCARB2 KI小鼠模型所用仪器和试剂 | 第82-83页 |
| 2.2 实验方法 | 第83-89页 |
| 2.2.1 细胞复苏与培养 | 第83页 |
| 2.2.2 细胞的传代和冻存 | 第83页 |
| 2.2.3 病毒的富集 | 第83-84页 |
| 2.2.4 病毒的TCID50测定和感染复数 | 第84页 |
| 2.2.5 病毒核酸提取与RT-PCR验证 | 第84-85页 |
| 2.2.6 EV71的VP1扩增片段测序与系统进化树 | 第85页 |
| 2.2.7 体外细胞感染实验 | 第85-86页 |
| 2.2.8 EV71感染动物模型 | 第86-87页 |
| 2.2.9 组织病理学检测 | 第87页 |
| 2.2.10 免疫组化 | 第87页 |
| 2.2.11 组织病毒载量 | 第87-88页 |
| 2.2.12 透射电镜 | 第88页 |
| 2.2.13 激光共聚焦 | 第88页 |
| 2.2.14 Western blot检测 | 第88-89页 |
| 2.3 EV71受体人源SCARB2 KI小鼠的构建流程与鉴定 | 第89-94页 |
| 2.3.1 实验动物 | 第89-90页 |
| 2.3.2 构建流程 | 第90-91页 |
| 2.3.3 小鼠基因型鉴定方法 | 第91-92页 |
| 2.3.4 hSCARB2 mRNA的表达鉴定 | 第92-93页 |
| 2.3.5 hSCARB2蛋白表达鉴定 | 第93页 |
| 2.3.6 KI小鼠对EV71感染的易感性 | 第93-94页 |
| 2.4 统计分析方法 | 第94页 |
| 3 结果 | 第94-114页 |
| 3.1 EV71毒株PCR鉴定与进化树分析 | 第94-95页 |
| 3.2 EV71感染的体外毒力研究 | 第95-98页 |
| 3.2.1 EV71感染对RD和Vero细胞活性的影响 | 第95-97页 |
| 3.2.2 EV71感染诱导RD细胞线粒体膜电位下降和线粒体损伤 | 第97-98页 |
| 3.3 EV71感染小鼠模型 | 第98-107页 |
| 3.3.1 不同的感染途径 | 第98-106页 |
| 3.3.2 EV71感染的年龄依赖性 | 第106-107页 |
| 3.4 EV71受体hSCARB2 KI小鼠 | 第107-114页 |
| 3.4.1 Founder小鼠基因型鉴定结果 | 第107-108页 |
| 3.4.2 Founder小鼠与野生型C57BL/6Ncrl小鼠的杂交繁育 | 第108-109页 |
| 3.4.3 KI小鼠hSCARB2 mRNA表达量检测 | 第109-112页 |
| 3.4.4 KI小鼠hSCARB2蛋白表达检测 | 第112-113页 |
| 3.4.5 KI小鼠对EV71感染的易感性增加 | 第113-114页 |
| 4 讨论 | 第114-116页 |
| 5 小结 | 第116-117页 |
| 第四章 肠道病毒71型感染致重症的免疫学机制研究 | 第117-165页 |
| 1 前言 | 第117-118页 |
| 2 材料与方法 | 第118-136页 |
| 2.1 材料 | 第118-126页 |
| 2.1.1 病毒株 | 第118页 |
| 2.1.2 实验动物 | 第118页 |
| 2.1.3 主要仪器与耗材 | 第118-120页 |
| 2.1.4 主要试剂、抗体、试剂盒与溶液配制 | 第120-126页 |
| 2.2 方法 | 第126-136页 |
| 2.2.1 日龄BALB/c小鼠EV71感染动物模型构建 | 第126页 |
| 2.2.2 肺组织脏器系数 | 第126页 |
| 2.2.3 组织病理学分析 | 第126-127页 |
| 2.2.4 肺组织病毒载量 | 第127页 |
| 2.2.5 激光共聚焦 | 第127页 |
| 2.2.6 乳鼠外周血免疫细胞表型检测 | 第127-129页 |
| 2.2.7 乳鼠肺组织免疫细胞表型检测 | 第129-132页 |
| 2.2.8 组织匀浆炎症细胞因子及活性物质检测 | 第132页 |
| 2.2.9 肺组织细胞因子的微阵列分析 | 第132-134页 |
| 2.2.10 脑组织和肺组织全蛋白TMT标记定量蛋白质组学研究 | 第134-135页 |
| 2.2.12 Western blot检测方法 | 第135-136页 |
| 2.3 统计分析方法 | 第136页 |
| 3 结果 | 第136-161页 |
| 3.1 EV71感染后乳鼠外周血免疫细胞的变化 | 第136-138页 |
| 3.2 EV71感染引起明显肺水肿 | 第138-140页 |
| 3.3 EV71感染后乳鼠肺组织细胞因子变化 | 第140-141页 |
| 3.4 EV71感染引起脑、肺和骨骼肌组织肥大细胞活化和Th2型炎症反应 | 第141-144页 |
| 3.5 EV71感染后乳鼠肺组织免疫细胞亚群变化 | 第144-146页 |
| 3.6 肥大细胞在EV71感染致重症过程中的作用 | 第146-150页 |
| 3.7 脑组织和肺组织蛋白质组学检测结果 | 第150-156页 |
| 3.7.1 蛋白质差异表达分析 | 第150-152页 |
| 3.7.2 差异表达蛋白质聚类和GO分析 | 第152-154页 |
| 3.7.3 主要差异表达蛋白质表达聚类及功能解释和KEGG分析 | 第154-156页 |
| 3.8 EV71感染对脑组织和肺组织天然免疫信号转导、炎症信号和凋亡信号的影响 | 第156-161页 |
| 4 讨论 | 第161-164页 |
| 5 小结 | 第164-165页 |
| 第五章 结论、创新点、局限性和展望 | 第165-167页 |
| 参考文献 | 第167-178页 |
| 综述 | 第178-203页 |
| 背景 | 第178-179页 |
| 1 EV71型手足口病的流行病学特征 | 第179-181页 |
| 1.1 EV71型手足口病的地区分布 | 第179-180页 |
| 1.2 EV71型手足口病的时间分布 | 第180页 |
| 1.3 EV71型手足口病的人群分布 | 第180-181页 |
| 2 EV71的生物学特征 | 第181-183页 |
| 2.1 EV71的结构和基因组 | 第181-182页 |
| 2.2 EV71的宿主结合受体或分子 | 第182页 |
| 2.3 EV71在宿主内的复制 | 第182-183页 |
| 3 EV71感染的路径和进程 | 第183-184页 |
| 4 EV71感染与天然免疫逃逸 | 第184-189页 |
| 4.1 阻断RLRs介导的抗病毒信号 | 第185-186页 |
| 4.2 阻断MAVS介导的抗病毒信号 | 第186页 |
| 4.3 阻断IFN和JAK/STAT信号转导 | 第186页 |
| 4.4 干扰IRF信号 | 第186-187页 |
| 4.5 抑制核因子（nuclear factor-κB , NF-κB）信号 | 第187页 |
| 4.6 抑制TLRs介导的信号转导 | 第187-188页 |
| 4.7 抑制NLRP3炎性小体的活化 | 第188页 |
| 4.8 参与EV71感染相关天然免疫应答的其他分子 | 第188-189页 |
| 5 EV71感染的病理生理学机制 | 第189-191页 |
| 5.1 体外细胞模型 | 第189页 |
| 5.2 EV71感染动物模型 | 第189-191页 |
| 6 EV71感染的潜在治疗方法 | 第191-193页 |
| 6.1 抗EV71病毒药物 | 第191页 |
| 6.2 单克隆抗体 | 第191-192页 |
| 6.3 疫苗 | 第192页 |
| 6.4 对症治疗 | 第192-193页 |
| 7 结论与展望 | 第193-194页 |
| 参考文献 | 第194-203页 |
| 个人简历及在学期间发表的学术论文 | 第203-208页 |
| 致谢 | 第208-209页 |
