| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9页 |
| 1 前言 | 第10-22页 |
| 1.1 红豆杉属植物资源及其天然产物的研究现状 | 第10-12页 |
| 1.1.1 红豆杉属植物及其概述 | 第10页 |
| 1.1.2 红豆杉属植物的主要药理学作用和其成分 | 第10-11页 |
| 1.1.3 红豆杉分子生物学研究进展 | 第11页 |
| 1.1.4 红豆杉组织培养和发酵罐培养技术 | 第11-12页 |
| 1.2 转录组测序及其应用 | 第12-14页 |
| 1.2.1 测序技术的发展 | 第12-13页 |
| 1.2.2 基因组学和转录组测序 | 第13页 |
| 1.2.3 高通量测序技术在红豆杉属植物中的研究概述 | 第13-14页 |
| 1.3 植物中干细胞的研究概述及其应用 | 第14-17页 |
| 1.4 相关的转录因子家族 | 第17-21页 |
| 1.4.1 LBD转录因子家族 | 第17-18页 |
| 1.4.2 AP2/EREBP转录因子家族 | 第18-19页 |
| 1.4.3 NAC转录因子家族 | 第19-21页 |
| 1.5 立题依据与研究意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-40页 |
| 2.1 材料 | 第22-26页 |
| 2.2 方法 | 第26-40页 |
| 3 实验结果 | 第40-71页 |
| 3.1 转录组测序及测序数据质控 | 第40-41页 |
| 3.2 红豆杉无参转录组组装和注释 | 第41-43页 |
| 3.2.1 组装质量统计 | 第41-42页 |
| 3.2.2 Unigene基本功能注释 | 第42-43页 |
| 3.3 功能注释分析 | 第43-46页 |
| 3.3.1 物种分布统计 | 第43-44页 |
| 3.3.2 COG/KOG数据库注释分析 | 第44-46页 |
| 3.3.3 KEGG代谢通路功能注释 | 第46页 |
| 3.3.4 GO功能分类注释 | 第46页 |
| 3.4 分组间的差异表达分析 | 第46-55页 |
| 3.4.1 表达量统计 | 第46-48页 |
| 3.4.2 样品关系分析 | 第48-50页 |
| 3.4.3 差异表达模式聚类分析 | 第50页 |
| 3.4.4 分组间差异表达量分析 | 第50-52页 |
| 3.4.5 分组间差异基因功能显著性富集分析 | 第52-55页 |
| 3.5 分组趋势分析 | 第55-56页 |
| 3.6 挑选目的研究基因 | 第56-59页 |
| 3.7 挑选基因的生物学研究 | 第59-71页 |
| 3.7.1 转基因植株的表型初步观察 | 第60-63页 |
| 3.7.2 石蜡切片和GUS染色 | 第63-65页 |
| 3.7.3 挑选基因与生长点调控 | 第65页 |
| 3.7.4 U24功能进一步研究 | 第65-71页 |
| 4 讨论与展望 | 第71-73页 |
| 4.1 U24与AS2在功能上相似度 | 第71页 |
| 4.2 其他Unigene与维管分生组织的调控 | 第71页 |
| 4.3 其他基因的功能研究 | 第71页 |
| 4.4 转录组数据的开发 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-80页 |
| 附录 | 第80-83页 |
| 附录1 qPCR引物 | 第80-82页 |
| 附录2 相关基因的进化树 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83页 |