摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
1 文献综述 | 第13-26页 |
1.1 酶 | 第13-14页 |
1.1.1 溶菌酶 | 第13-14页 |
1.1.2 多酚氧化酶 | 第14页 |
1.2 蛋白质-药物小分子相互作用的研究进展 | 第14-15页 |
1.3 蛋白质-药物小分子相互作用的研究方法 | 第15-20页 |
1.3.1 药物-蛋白质相互作用的常见的实验法 | 第15-16页 |
1.3.2 药物-蛋白质相互作用的计算机模拟法 | 第16-20页 |
1.3.2.1 分子对接技术法 | 第16-17页 |
1.3.2.2 分子动力学模拟法 | 第17-20页 |
1.4 荧光法分析蛋白质-药物小分子相互作用的原理 | 第20-24页 |
1.4.1 荧光猝灭机理 | 第20-21页 |
1.4.2 结合位点和结合常数 | 第21-23页 |
1.4.3 作用力类型 | 第23页 |
1.4.4 蛋白质构象变化 | 第23页 |
1.4.5 能量转移机制 | 第23-24页 |
1.5 本论文研究内容及意义 | 第24-26页 |
1.5.1 研究内容 | 第24-25页 |
1.5.2 研究意义 | 第25-26页 |
2 光谱法结合分子动力学研究没食子酸与溶菌酶的作用机制 | 第26-42页 |
2.1 前言 | 第26页 |
2.2 实验部分 | 第26-28页 |
2.2.1 实验试剂与仪器 | 第26-27页 |
2.2.2 实验方法 | 第27-28页 |
2.2.2.1 紫外及荧光光谱的测定 | 第27页 |
2.2.2.2 同步荧光光谱的测定及荧光相图的绘制 | 第27页 |
2.2.2.3 分子对接及分子动力学模拟 | 第27-28页 |
2.2.2.4 MM-PBSA结合自由能的计算 | 第28页 |
2.3 结果与讨论 | 第28-41页 |
2.3.1 光谱实验分析GA与LYS相互作用机制 | 第28-35页 |
2.3.1.1 紫外及荧光光谱分析 | 第28-29页 |
2.3.1.2 荧光猝灭机理分析 | 第29-30页 |
2.3.1.3 结合机制分析 | 第30-31页 |
2.3.1.4 热力学参数的求取 | 第31-32页 |
2.3.1.5 非辐射能量转移参数的测定 | 第32-33页 |
2.3.1.6 结合反应对LYS构象变化的影响 | 第33-35页 |
2.3.2 分子动力学模拟法分析GA与LYS相互作用机制 | 第35-41页 |
2.3.2.1 模拟体系的稳定性和柔性 | 第35-36页 |
2.3.2.2 模拟后体系的结合模型研究 | 第36-39页 |
2.3.2.3 基于结合自由能计算的相互作用机理分析 | 第39-41页 |
2.4 本章小结 | 第41-42页 |
3 光谱法结合分子动力学研究绿原酸与溶菌酶的作用机制 | 第42-56页 |
3.1 前言 | 第42页 |
3.2 实验部分 | 第42-43页 |
3.2.1 实验试剂与仪器 | 第42-43页 |
3.2.2 实验方法 | 第43页 |
3.2.2.1 紫外及荧光光谱的测定 | 第43页 |
3.2.2.2 同步荧光光谱的测定及荧光相图的绘制 | 第43页 |
3.2.2.3 分子对接及分子动力学模拟 | 第43页 |
3.2.2.4 MM-PBSA结合自由能的计算 | 第43页 |
3.3 结果与讨论 | 第43-54页 |
3.3.1 光谱实验分析CGA与LYS相互作用机制 | 第43-49页 |
3.3.1.1 紫外及荧光光谱分析 | 第43-44页 |
3.3.1.2 荧光猝灭机理分析 | 第44-45页 |
3.3.1.3 结合机制分析 | 第45-46页 |
3.3.1.4 热力学参数的求取 | 第46-47页 |
3.3.1.5 非辐射能量转移参数的测定 | 第47-48页 |
3.3.1.6 结合反应对LYS构象变化的影响 | 第48-49页 |
3.3.2 分子动力学模拟法分析CGA与LYS相互作用机制 | 第49-54页 |
3.3.2.1 模拟体系的稳定性和柔性 | 第49-50页 |
3.3.2.2 模拟后体系的结合模型研究 | 第50-53页 |
3.3.2.3 基于结合自由能计算的相互作用机理分析 | 第53-54页 |
3.4 本章小结 | 第54-56页 |
4 香草酸与多酚氧化酶相互作用机制研究及新型指纹谱构建 | 第56-64页 |
4.1 引言 | 第56页 |
4.2 实验部分 | 第56-57页 |
4.2.1 实验试剂与仪器 | 第56-57页 |
4.2.2 实验方法 | 第57页 |
4.2.2.1 紫外及荧光光谱的测定 | 第57页 |
4.2.2.2 三维指纹谱的构建 | 第57页 |
4.2.2.3 分子模拟 | 第57页 |
4.3 结果与讨论 | 第57-63页 |
4.3.1 光谱法分析VA-PPO相互作用机制 | 第57-60页 |
4.3.1.1 紫外及荧光光谱分析 | 第57-58页 |
4.3.1.2 VA与PPO相互作用的结合常数分析 | 第58-59页 |
4.3.1.3 VA与PPO相互作用的热力学参数及作用力类型 | 第59页 |
4.3.1.4 非辐射能量转移参数的测定 | 第59-60页 |
4.3.2 VA-PPO多维指纹图谱的构建 | 第60-61页 |
4.3.3 分子模拟法分析VA-PPO相互作用机制 | 第61-63页 |
4.4 本章小结 | 第63-64页 |
5 结论与展望 | 第64-66页 |
5.1 结论 | 第64-65页 |
5.2 展望 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-73页 |
个人简介 | 第73-74页 |
攻读硕士学位期间发表/投稿的论文 | 第74-75页 |
致谢 | 第75页 |