| 中文摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 概述 | 第12-23页 |
| 1.1 芽胞杆菌 | 第12-19页 |
| 1.1.1 芽胞杆菌的种类 | 第12-17页 |
| 1.1.2 芽胞杆菌的生长环境 | 第17页 |
| 1.1.3 芽胞杆菌的应用领域 | 第17-19页 |
| 1.2 类芽胞杆菌属 | 第19-21页 |
| 1.2.1 类芽胞杆菌属的特征描述 | 第19页 |
| 1.2.2 类芽胞杆菌的应用 | 第19-20页 |
| 1.2.3 类芽胞杆菌属基因组学研究进展 | 第20-21页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第21-23页 |
| 第二章 类芽胞杆菌属的基因组基本信息 | 第23-80页 |
| 2.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.1.1 基因组序列来源 | 第23页 |
| 2.1.2 软件与网站 | 第23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-26页 |
| 2.2.1 类芽胞杆菌属的分类和基因组测序信息获取 | 第23-24页 |
| 2.2.2 基因组组分分析 | 第24-26页 |
| 2.3 结果分析与讨论 | 第26-80页 |
| 2.3.1 类芽胞杆菌属基因组被测序的种类 | 第26-29页 |
| 2.3.2 基因组基本信息 | 第29-80页 |
| 第三章 类芽胞杆菌属的比较基因组学 | 第80-122页 |
| 3.1 试验材料 | 第80页 |
| 3.1.1 基因组序列来源 | 第80页 |
| 3.1.2 软件与数据库 | 第80页 |
| 3.2 实验方法 | 第80-82页 |
| 3.2.1 基因组成分比较分析 | 第80-81页 |
| 3.2.2 功能基因组的比较分析 | 第81页 |
| 3.2.3 物质转运与碳代谢途径 | 第81页 |
| 3.2.4 信号转导调控系统 | 第81页 |
| 3.2.5 芽胞形成相关基因的调控 | 第81-82页 |
| 3.3 结果分析与讨论 | 第82-122页 |
| 3.3.1 基因组成分比较分析 | 第82-97页 |
| 3.3.2 功能基因组学的比较分析 | 第97-100页 |
| 3.3.3 物质转运与代谢途径 | 第100-112页 |
| 3.3.4 信号转导调控系统 | 第112-118页 |
| 3.3.5 芽胞形成相关基因的调控 | 第118-122页 |
| 第四章 基于全基因组的类芽胞杆菌属系统发育与进化初步分析 | 第122-142页 |
| 4.1 试验材料 | 第122-123页 |
| 4.1.1 菌种序列 | 第122页 |
| 4.1.2 软件 | 第122-123页 |
| 4.2 试验方法 | 第123-124页 |
| 4.2.1 基于基因组序列的类芽胞杆菌分类地位整理 | 第123页 |
| 4.2.2 基因组进化分析 | 第123-124页 |
| 4.3 结果分析与讨论 | 第124-142页 |
| 4.3.1 基于基因组序列的类芽胞杆菌分类地位整理 | 第124-130页 |
| 4.3.2 基于基因组序列的类芽胞杆菌分类地位评价 | 第130-138页 |
| 4.3.3 基因组进化分析 | 第138-142页 |
| 结论与期望 | 第142-145页 |
| 结论 | 第142-144页 |
| 期望 | 第144-145页 |
| 参考文献 | 第145-151页 |
| 致谢 | 第151-152页 |
| 个人简历 | 第152页 |
