多样性增量特征选择技术的应用
摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第9-15页 |
1.1 课题的研究背景 | 第9-13页 |
1.1.1 多样性特征选择技术的发展 | 第9-10页 |
1.1.2 核小体定位的研究与发展 | 第10-11页 |
1.1.3 蛋白质磷酸化的特点及研究进展 | 第11-13页 |
1.2 本文的结构组织及主要研究内容 | 第13-15页 |
第二章 研究方法 | 第15-20页 |
2.1 多样性增量特征选择技术 | 第15-16页 |
2.2 序列的k-mer组分 | 第16页 |
2.3 k间隔氨基酸对 | 第16-17页 |
2.4 位置保守的氨基酸组分 | 第17页 |
2.5 序列的非均匀指数 | 第17-18页 |
2.6 预测算法 | 第18-19页 |
2.7 10折交叉检验 | 第19页 |
2.8 分类性能评价指标 | 第19-20页 |
第三章 基于特征选择技术预测酵母中核小体定位序列 | 第20-24页 |
3.1 引言 | 第20页 |
3.2 数据集与方法 | 第20-21页 |
3.2.1 酵母核小体定位序列和连接序列数据集 | 第20-21页 |
3.2.2 k联体特征 | 第21页 |
3.3 结果与讨论 | 第21-22页 |
3.3.1 基于多样性增量的特征选择 | 第21-22页 |
3.3.2 SVM预测结果 | 第22页 |
3.4 本章小结 | 第22-24页 |
第四章 基于特征选择技术解决磷酸化分类问题 | 第24-31页 |
4.1 引言 | 第24页 |
4.2 数据集与方法 | 第24-26页 |
4.2.1 数据集 | 第24-25页 |
4.2.2 特征提取方法 | 第25-26页 |
4.3 结果与讨论 | 第26-30页 |
4.3.1 FSID特征选择结果 | 第26-28页 |
4.3.2 FSID_PhSite模型的识别结果 | 第28-29页 |
4.3.3 讨论 | 第29-30页 |
4.4 本章小结 | 第30-31页 |
第五章 酵母基因组中核小体定位序列的周期性研究 | 第31-36页 |
5.1 引言 | 第31页 |
5.2 数据集与方法 | 第31-33页 |
5.2.1 酵母核小体定位序列和连接序列的数据集 | 第31页 |
5.2.2 染色体编码序列 | 第31页 |
5.2.3 序列拼接 | 第31-32页 |
5.2.4 碱基约化 | 第32页 |
5.2.5 序列转换 | 第32-33页 |
5.2.6 随机序列 | 第33页 |
5.3 结果与讨论 | 第33-35页 |
5.3.1 核小体定位序列的周期信号 | 第33-34页 |
5.3.2 周期信号的起源 | 第34-35页 |
5.4 本章小结 | 第35-36页 |
第六章 总结与展望 | 第36-38页 |
6.1 本文研究工作总结 | 第36页 |
6.2 研究展望 | 第36-38页 |
参考文献 | 第38-43页 |
致谢 | 第43-44页 |
在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第44页 |