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B细胞淋巴瘤内miR-17-92基因转录调控机制研究

Introduction第1-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-13页
Part Ⅰ Literature review第13-25页
   ·Biogenesis and Functions of microRNAs第13-17页
   ·Genomic organization and function of the miR-17~92 cluster第17-21页
   ·The regulation of the miR-17~92 cluster第21-25页
     ·c-Myc regulates the expression of miR-17~92 cluster第22-23页
     ·E2F family regulate the expression of miR-17~92 cluster第23页
     ·p53 and STAT3第23-25页
Part Ⅱ Experiment Report第25-91页
   ·Introduction第25页
   ·Materials and Methods第25-57页
     ·cells第26-27页
     ·miRNA profiling using the TaqMan(?) microRNA assays第27页
     ·Reverse transcriptase PCR (RT-PCR)第27-28页
     ·Real-time quantitative PCR第28-29页
     ·Plasmids第29-32页
     ·Overlap extension PCR第32-36页
     ·Luciferase assay第36页
     ·Cell transfection using TurboFectTM method第36-37页
     ·Transiently transfected using an Amaxa Nucleofector第37-38页
     ·Dnase Ⅰ hypersensitivity analysis第38-42页
     ·ChIP-on-chip第42-44页
     ·Chromatin Immunprecipation (ChIP)第44-54页
       ·The standad method第44-47页
       ·The method of ChampionChIPTM One-Day kit第47-54页
     ·Immunoblotting第54-57页
   ·Results第57-83页
     ·Full promoter activity requires sequences extending approximately from -188 nt to+115 nt from the transcriptional start site第57-58页
     ·The promoter is regulated by the collaborative activity of several transcription factors, each of which individually has only a moderate effect第58-62页
       ·The C13orf25 gene highly conserved in vertebrates第58-59页
       ·The study of several putative transcription factors binding sites in the promoter region of C13orf25 gene第59-62页
     ·Mxi1 binds to the promoter第62-68页
     ·miR-17~92 cluster expression profiling in B-cells第68-69页
     ·Histone modifications in C13orf25 locus第69-73页
     ·Evolutionarily conserved DNase Ⅰ hypersensitive sites within the promoter and intron regions of C13orf25 locus in B cell lymphoma DHL 16 and Granta 519 cells第73-75页
     ·Enhancer of the C13orf25 locus第75-78页
     ·E-box motifs function in the C13orf25 locus第78-83页
   ·Discussion第83-91页
     ·The miRNAs in the miR-17-92 cluster is regulated at several levels第83-84页
     ·The SP1 sites may be important in promoting cooperative recruitment of SP1 along with other transcription factors that bind the miR-17-92 cluster promoter第84-85页
     ·The relationship between the Histone Modifications in the C13orf25 Locus and C-MYC第85-86页
     ·Histone modifications involved in the C13orf25 gene regulation in B-Cell Malignancies第86-87页
     ·The C13orf25 gene is bound not only by MYC but also by inhibitory members of the MYC family第87-91页
Conclusion第91-92页
Acknowledgements第92-93页
References第93-103页
Appendix第103-144页

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