锌指蛋白WT1与DNA识别机制的分子动力学模拟研究
| 中文摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 引言 | 第10-19页 |
| 1.1 生命科学概述 | 第10-11页 |
| 1.2 DNA概述 | 第11-14页 |
| 1.3 蛋白质概述 | 第14-17页 |
| 1.3.1 蛋白质简介 | 第14-16页 |
| 1.3.2 锌指蛋白简介 | 第16-17页 |
| 1.3.3 锌指蛋白WT1简介 | 第17页 |
| 1.4 研究目的与内容 | 第17-19页 |
| 第2章 理论基础与计算方法 | 第19-29页 |
| 2.1 分子力学 | 第19-24页 |
| 2.1.1 分子力场 | 第19-22页 |
| 2.1.2 能量最小化 | 第22-24页 |
| 2.2 分子动力学 | 第24-26页 |
| 2.3 结合自由能 | 第26-29页 |
| 2.3.1 结合自由能计算 | 第27页 |
| 2.3.2 MM-PBSA方法 | 第27-29页 |
| 第3章 锌指蛋白WT1与DNA识别机制的研究 | 第29-50页 |
| 3.1 引言 | 第29-30页 |
| 3.2 计算方法 | 第30-32页 |
| 3.2.1 初始模型的建立 | 第30-31页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第31页 |
| 3.2.3 MM-PBSA计算 | 第31-32页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第32-49页 |
| 3.3.1 各复合物系统的结构与动力学特性 | 第32-35页 |
| 3.3.2 结合自由能分析 | 第35-36页 |
| 3.3.3 DNA残基分解能分析 | 第36-40页 |
| 3.3.4 氨基酸残基分解能分析 | 第40-44页 |
| 3.3.5 分子间相互作用 | 第44-49页 |
| 3.4 本章小结 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-58页 |
| 个人简介及攻读学位期间发表论文 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
