| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 符号说明 | 第10-11页 |
| 第1章 禾本科植物基因组研究进展和进化机制 | 第11-21页 |
| 1.1 禾本科基因组研究进展 | 第12-13页 |
| 1.2 基因重复 | 第13-15页 |
| 1.3 适应性进化与中性进化 | 第15-17页 |
| 1.3.1 自然选择 | 第15-16页 |
| 1.3.2 正选择与适应性进化之间的联系 | 第16页 |
| 1.3.3 中性进化 | 第16页 |
| 1.3.4 自然选择学说与中性进化理论的相互补充 | 第16-17页 |
| 1.4 禾本科基因家族的进化 | 第17-18页 |
| 1.4.1 什么是基因家族 | 第17页 |
| 1.4.2 多基因家族 | 第17-18页 |
| 参考文献 | 第18-21页 |
| 第2章 禾本科物种中F-box基因数目变异以及适应性进化 | 第21-41页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-26页 |
| 2.1.1 序列获取和结构域分析 | 第23页 |
| 2.1.2 多序列比对和构建系统进化树 | 第23-24页 |
| 2.1.3 正选择作用检测 | 第24页 |
| 2.1.4 两个保守结构域位点间的共进化 | 第24-26页 |
| 2.2 结果与分析 | 第26-37页 |
| 2.2.1 本文所研究的5个禾本科物种基因组中F-box基因的鉴定以及分类 | 第26-28页 |
| 2.2.2 进化保守的F-box基因的数目变异 | 第28-31页 |
| 2.2.3 禾本科F-box直系同源簇的适应性进化分析 | 第31-34页 |
| 2.2.4 禾本科F-box基因的适应性进化分析 | 第34-35页 |
| 2.2.5 F-box蛋白两个保守结构域间的共进化 | 第35-37页 |
| 2.3 讨论 | 第37-39页 |
| 参考文献 | 第39-41页 |
| 第3章 禾本科植物LBD基因家族的分子进化研究及非生物胁迫下的表达模式分析 | 第41-54页 |
| 3.1 材料与方法 | 第43-44页 |
| 3.1.1 禾本科植物LBD基因鉴定 | 第43页 |
| 3.1.2 序列分析 | 第43页 |
| 3.1.3 正选择作用检测 | 第43-44页 |
| 3.1.4 微阵列数据分析 | 第44页 |
| 3.2 结果与分析 | 第44-51页 |
| 3.2.1 LBD基因系统发育分析 | 第44-45页 |
| 3.2.2 LBD同源基因簇的适应性进化 | 第45-48页 |
| 3.2.3 禾本科植物LBD基因的适应性进化分析 | 第48页 |
| 3.2.4 非生物胁迫下水稻LBD基因的表达谱分析 | 第48-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-54页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
