核蛋白的结构分析及蛋白质亚核定位预测研究
摘要 | 第3-4页 |
abstract | 第4页 |
缩略语表 | 第9-10页 |
1 绪论 | 第10-14页 |
1.1 核蛋白结构与功能的研究背景及意义 | 第10页 |
1.2 细胞核的结构与功能简介 | 第10-11页 |
1.3 蛋白质亚核定位概述 | 第11-12页 |
1.4 蛋白质亚核定位预测的国内外研究现状 | 第12-13页 |
1.5 论文研究内容及安排 | 第13-14页 |
2 核蛋白的结构分析 | 第14-26页 |
2.1 引言 | 第14页 |
2.2 数据集 | 第14-15页 |
2.3 核蛋白的结构域分析 | 第15-22页 |
2.3.1 染色体区域独有的结构域 | 第17-19页 |
2.3.2 核仁区域独有的结构域 | 第19-20页 |
2.3.3 核膜区域独有的结构域 | 第20页 |
2.3.4 六个区域共有的结构域 | 第20-22页 |
2.4 核蛋白的模体分析 | 第22-24页 |
2.4.1 Q motif | 第22-23页 |
2.4.2 LXXLL motif | 第23-24页 |
2.5 小结 | 第24-26页 |
3 特征参数的提取与预测算法的运用 | 第26-34页 |
3.1 引言 | 第26页 |
3.2 特征参数提取 | 第26-31页 |
3.2.1 氨基酸n肽组分信息 | 第26-27页 |
3.2.2 蛋白质骨架 | 第27-28页 |
3.2.3 蛋白质结构域 | 第28页 |
3.2.4 GO注释 | 第28-29页 |
3.2.5 氨基酸粘性 | 第29-31页 |
3.3 预测算法 | 第31-33页 |
3.3.1 支持向量机 | 第31-32页 |
3.3.2 算法评价 | 第32-33页 |
3.4 小结 | 第33-34页 |
4 蛋白质亚核定位预测研究 | 第34-42页 |
4.1 引言 | 第34页 |
4.2 数据集 | 第34-36页 |
4.3 特征参数的筛选 | 第36-38页 |
4.3.1 氨基酸n肽组分信息预测结果 | 第36页 |
4.3.2 蛋白质骨架预测结果 | 第36-37页 |
4.3.3 蛋白质结构域预测结果 | 第37页 |
4.3.4 GO注释预测结果 | 第37页 |
4.3.5 氨基酸粘性预测结果 | 第37-38页 |
4.4 结果与讨论 | 第38-41页 |
4.4.1 单特征预测结果分析 | 第38-39页 |
4.4.2 融合特征预测结果分析 | 第39-41页 |
4.5 小结 | 第41-42页 |
5 总结与展望 | 第42-44页 |
5.1 工作总结 | 第42页 |
5.2 工作展望 | 第42-44页 |
致谢 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-51页 |
附录 | 第51-58页 |
作者简介 | 第58页 |