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柔嫩艾美耳球虫耐药相关基因特性初步研究及耐药株与敏感株全基因组重测序分析

摘要第6-8页
abstract第8-10页
第一章 文献综述第16-23页
    1.1 鸡球虫病的耐药现状第16页
    1.2 基因差异表达在寄生虫耐药性的研究第16-17页
    1.3 单核苷酸多态性在寄生虫上的应用第17-22页
        1.3.1 SNP分子标记在原虫上的应用第17-19页
        1.3.2 SNP分子标记在蠕虫上的应用第19-21页
        1.3.3 SNP分子标记在节肢动物上的应用第21-22页
    1.4 展望第22-23页
第二章 4个耐药相关基因的克隆和生物信息学分析第23-42页
    2.1 引言第23-24页
    2.2 材料与方法第24-33页
        2.2.1 实验动物第24页
        2.2.2 实验虫株和原核表达载体第24页
        2.2.3 实验药物第24页
        2.2.4 实验主要试剂第24-25页
        2.2.5 实验主要设备第25-26页
        2.2.6 实验步骤第26-27页
        2.2.7 总RNA提取和cDNA模板的制备第27-28页
        2.2.8 耐药相关基因的扩增和测序第28-30页
        2.2.9 生物信息学分析第30页
        2.2.10 4个耐药相关基因在4个不同发育阶段转录水平的差异分析第30-33页
    2.3 结果第33-40页
        2.3.1 4个不同发育阶段虫体的收集和纯化第33页
        2.3.2 柔嫩艾美耳球虫孢子化卵囊总RNA的提取第33-34页
        2.3.3 4个耐药相关基因的克隆第34-35页
        2.3.4 4个耐药相关基因的生物信息学分析第35-39页
        2.3.5 4个耐药相关基因在不同发育阶段的转录水平差异分析第39-40页
    2.4 讨论第40-42页
第三章 4个耐药相关基因原核重组蛋白的表达和功能初步分析第42-71页
    3.1 引言第42页
    3.2 材料与方法第42-51页
        3.2.1 实验动物第42页
        3.2.2 实验虫株、原核表达载体和细胞第42页
        3.2.3 实验主要试剂第42-43页
        3.2.4 实验主要设备第43页
        3.2.5 重组表达质粒的构建与鉴定第43-45页
        3.2.6 重组表达质粒的诱导表达第45-46页
        3.2.7 重组蛋白的纯化第46-47页
        3.2.8 4个耐药相关基因重组蛋白多克隆抗体的制备与抗体的纯化第47页
        3.2.9 重组蛋白的反应原性分析第47-48页
        3.2.10 4个耐药相关基因在3个虫株体内的转录和翻译水平差异第48页
        3.2.11 3-磷酸甘油醛脱氢酶活性的测定第48-49页
        3.2.12 苹果酸脱氢酶活性的测定第49页
        3.2.13 DF-1细胞的复苏与传代培养第49页
        3.2.14 4个耐药相关基因在球虫入侵DF-1细胞不同发育阶段的分布与定位分析第49-50页
        3.2.15 兔抗重组蛋白多克隆抗体对子孢子入侵DF-1细胞的体外抑制实验第50页
        3.2.16 4个耐药相关基因在球虫不同的发育阶段中蛋白质翻译水平的差异第50-51页
    3.3 结果第51-68页
        3.3.1 原核重组表达质粒的构建和鉴定第51-52页
        3.3.2 重组蛋白的表达和纯化第52-55页
        3.3.3 兔抗重组蛋白多克隆抗体的制备第55-56页
        3.3.4 重组蛋白反应原性的分析第56-57页
        3.3.5 耐药相关基因在3个虫株体内的转录和翻译第57-60页
        3.3.6 酶活实验第60-61页
        3.3.7 4个耐药相关基因蛋白在虫体的分布第61-64页
        3.3.8 2个耐药基因重组蛋白多克隆抗体对子孢子入侵DF-1细胞的体外抑制实验第64-66页
        3.3.9 4个耐药相关基因在球虫不同发育阶段的蛋白翻译水平差异第66-68页
    3.4 讨论第68-71页
第四章 基于全基因组重测序的敏感株与耐药株SNP位点筛选第71-82页
    4.1 引言第71页
    4.2 材料与方法第71-75页
        4.2.1 实验动物与虫株第71页
        4.2.2 饲料第71页
        4.2.3 实验药物第71-72页
        4.2.4 实验试剂和设备第72页
        4.2.5 DS、DZR和MRR孢子化卵囊的繁殖和纯化第72页
        4.2.6 DS、DZR和MRR孢子化卵囊基因组DNA的提取第72-73页
        4.2.7 DNA样品文库的构建第73页
        4.2.8 DS、DZR和MRR孢子化卵囊的全基因组重测序第73-75页
    4.3 结果第75-80页
        4.3.1 DS、DZR和MRR基因组DNA的提取第75页
        4.3.2 DS、DZR和MRR全基因组重测序第75-80页
        4.3.3 耐药相关位点的筛选第80页
    4.4 讨论第80-82页
第五章 全文结论第82-83页
参考文献第83-92页
致谢第92-93页
作者简历第93页

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