| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第1章 文献综述 | 第13-31页 |
| 1.1 黑木耳概述 | 第13-16页 |
| 1.1.1 黑木耳的营养和药用价值 | 第13-14页 |
| 1.1.2 黑木耳的生物学特性 | 第14-16页 |
| 1.2 转录组 | 第16-20页 |
| 1.2.1 转录组的定义 | 第16页 |
| 1.2.2 转录组的研究方法及应用 | 第16-20页 |
| 1.3 真菌功能基因研究进展 | 第20-25页 |
| 1.3.1 全长基因克隆方法 | 第20-21页 |
| 1.3.2 食用菌的功能基因研究 | 第21-25页 |
| 1.4 木耳属分子系统发育研究进展 | 第25-29页 |
| 1.4.1 真菌的分子系统学研究 | 第25-27页 |
| 1.4.2 系统发育树的构建方法 | 第27-28页 |
| 1.4.3 木耳属分类与系统发育关系 | 第28-29页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第29-31页 |
| 第2章 黑木耳RNA-seq及分析 | 第31-40页 |
| 2.1 前言 | 第31页 |
| 2.2 材料和方法 | 第31-34页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第31页 |
| 2.2.2 供试培养基 | 第31-32页 |
| 2.2.3 主要仪器和试剂 | 第32页 |
| 2.2.4 RNA提取 | 第32-33页 |
| 2.2.5 RNA完整性和质量检测 | 第33页 |
| 2.2.6 转录组测序(RNA-seq) | 第33-34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-39页 |
| 2.3.1 RNA提取结果 | 第34-35页 |
| 2.3.2 RNA-seq结果分析 | 第35-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-40页 |
| 第3章 黑木耳gpd基因结构、表达及分子进化分析 | 第40-71页 |
| 3.1 前言 | 第40-41页 |
| 3.2 材料和方法 | 第41-60页 |
| 3.2.1 试验材料 | 第41页 |
| 3.2.2 供试培养基 | 第41页 |
| 3.2.3 主要仪器和试剂 | 第41-43页 |
| 3.2.4 黑木耳DNA及RNA提取 | 第43-44页 |
| 3.2.5 gpd-cDNA全长的克隆 | 第44-49页 |
| 3.2.6 gpd-gDNA全长的克隆 | 第49-51页 |
| 3.2.7 扩增片段克隆测序 | 第51-53页 |
| 3.2.8 Southern杂交 | 第53-56页 |
| 3.2.9 序列结构和同源性分析 | 第56-58页 |
| 3.2.10 基因表达分析 | 第58-59页 |
| 3.2.11 分子进化分析 | 第59-60页 |
| 3.3 结果和分析 | 第60-69页 |
| 3.3.1 黑木耳DNA和RNA提取结果 | 第60页 |
| 3.3.2 gpd-cDNA全长序列 | 第60-63页 |
| 3.3.3 gpd-gDNA全长序列 | 第63-64页 |
| 3.3.4 Southern杂交结果 | 第64-65页 |
| 3.3.5 黑木耳gpd基因结构 | 第65-68页 |
| 3.3.6 gpd等位基因表达分析 | 第68-69页 |
| 3.3.7 基于GPD氨基酸序列的分子进化分析 | 第69页 |
| 3.4 讨论 | 第69-71页 |
| 第4章 基于gpd等位基因InDel的原生质体单核体快速鉴定 | 第71-81页 |
| 4.1 前言 | 第71-72页 |
| 4.2 材料和方法 | 第72-74页 |
| 4.2.1 试验材料 | 第72页 |
| 4.2.2 供试培养基 | 第72页 |
| 4.2.3 主要仪器和试剂 | 第72-73页 |
| 4.2.4 黑木耳原生质体制备和再生 | 第73页 |
| 4.2.5 黑木耳DNA提取与检测 | 第73-74页 |
| 4.2.6 荧光显微镜检 | 第74页 |
| 4.2.7 引物设计及PCR检测 | 第74页 |
| 4.2.8 黑木耳再生菌株杂交及栽培试验 | 第74页 |
| 4.3 结果和分析 | 第74-79页 |
| 4.3.1 黑木耳原生质体再生 | 第74-75页 |
| 4.3.2 再生菌株DNA提取效果 | 第75-76页 |
| 4.3.3 InDel引物设计和PCR | 第76-77页 |
| 4.3.4 荧光显微镜镜检和配对试验 | 第77-79页 |
| 4.4 讨论 | 第79-81页 |
| 第5章 基于gpd基因的木耳属分子系统发育分析 | 第81-96页 |
| 5.1 前言 | 第81-82页 |
| 5.2 材料和方法 | 第82-86页 |
| 5.2.1 试验材料 | 第82页 |
| 5.2.2 主要仪器和试剂 | 第82-84页 |
| 5.2.3 相关基因片段扩增、克隆、测序 | 第84-85页 |
| 5.2.4 分子鉴定和系统发育树的构建 | 第85-86页 |
| 5.3 结果和分析 | 第86-94页 |
| 5.3.1 DNA提取效果 | 第86-87页 |
| 5.3.2 PCR引物 | 第87页 |
| 5.3.3 序列扩增结果 | 第87-90页 |
| 5.3.4 木耳属分子系统发育分析 | 第90-94页 |
| 5.4 讨论 | 第94-96页 |
| 第6章 黑木耳漆酶基因克隆、表达及分子进化分析 | 第96-119页 |
| 6.1 前言 | 第96-100页 |
| 6.2 材料和方法 | 第100-107页 |
| 6.2.1 试验材料 | 第100页 |
| 6.2.2 供试培养基和试剂 | 第100页 |
| 6.2.3 推测漆酶基因cDNA和DNA全长的克隆 | 第100-105页 |
| 6.2.4 漆酶基因结构分析 | 第105-106页 |
| 6.2.5 qRT-PCR | 第106-107页 |
| 6.3 结果和分析 | 第107-117页 |
| 6.3.1 cDNA和DNA全长分析 | 第107-108页 |
| 6.3.2 漆酶基因序列及结构分析 | 第108-111页 |
| 6.3.3 基因表达差异分析 | 第111-114页 |
| 6.3.4 漆酶基因分子进化分析 | 第114-117页 |
| 6.4 讨论 | 第117-119页 |
| 全文结论 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-140页 |
| 附录1 常用试剂配方 | 第140-141页 |
| 附录2 木耳属分子系统发育树 | 第141-144页 |
| 附录3 攻读博士学位期间发表与课题相关的论文 | 第144-145页 |
| 致谢 | 第145页 |