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溶葡萄球菌酶高效裂解细菌细胞壁的机制研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
一、前言第10-29页
    1.1 金黄色葡萄球菌的耐药性问题第10-11页
    1.2 新型抗菌剂—溶葡萄球菌酶第11-27页
        1.2.1 溶葡萄球菌酶的发现第11页
        1.2.2 溶葡萄球菌酶的理化性质第11-12页
        1.2.3 溶葡萄球菌酶的溶菌机制第12-13页
        1.2.4 溶葡萄球菌酶的克隆与表达第13-15页
        1.2.5 溶葡萄球菌酶的体外抗菌活性研究第15-16页
        1.2.6 溶葡萄球菌酶的实验动物体内药效学研究第16-20页
        1.2.7 溶葡萄球菌酶的临床应用研究第20-22页
        1.2.8 金葡菌对溶葡萄球菌酶的耐药性研究第22-23页
        1.2.9 溶葡萄球菌酶的药代动力学研究第23页
        1.2.10 溶葡萄球菌酶的安全性研究第23-25页
        1.2.11 溶葡萄球菌酶的结构研究第25-27页
    1.3 论文的立题依据第27-29页
二、材料与方法第29-36页
    2.1 材料第29页
        2.1.1 菌株和质粒第29页
        2.1.2 主要试剂第29页
        2.1.3 引物和DNA序列测定第29页
        2.1.4 培养基和抗生素第29页
    2.2 方法第29-36页
        2.2.1 生物信息学分析软件第29-30页
        2.2.2 工程菌的构建与表达第30-31页
        2.2.3 重组蛋白的纯化第31页
        2.2.4 重组蛋白的鉴定第31页
        2.2.5 圆二色性分析第31页
        2.2.6 比浊法测定溶菌活性第31-32页
        2.2.7 与金葡菌亲和力检测第32页
        2.2.8 同源模建第32页
        2.2.9 分子对接第32页
        2.2.10 蛋白氢氘交换反应第32-33页
        2.2.11 胃蛋白酶酶解方法第33页
        2.2.12 质谱检测酶解肽段第33页
        2.2.13 酶解肽段鉴定第33页
        2.2.14 肽段氢氘交换率分析第33-34页
        2.2.15 突变体的构建、表达和纯化第34-35页
        2.2.16 双半胱氨酸突变体的交联分析第35-36页
三、结果第36-75页
    3.1 溶葡萄球菌酶的生物信息学分析第36-39页
        3.1.1 溶葡萄球菌酶的一级序列分析第36-38页
        3.1.2 溶葡萄球菌酶的二级结构分析第38-39页
        3.1.3 溶葡萄球菌酶的高级结构检索第39页
    3.2 溶葡萄球菌酶及其两个结构域的克隆、表达、纯化与活性研究第39-50页
        3.2.1 重组蛋白的工程菌构建和表达第39-40页
        3.2.2 重组蛋白的纯化和鉴定第40-44页
        3.2.3 重组溶葡萄球菌酶的圆二色性分析第44-46页
        3.2.4 重组溶葡萄球菌酶及其催化区对金葡菌的溶活性第46-48页
        3.2.5 重组溶葡萄球菌酶及其结合区与金葡菌的亲和力分析第48-50页
    3.3 溶葡萄球菌酶催化区和结合区的结构模建以及结构域之间的分子对接第50-53页
        3.3.3 溶葡萄球菌酶催化区和结合区的结构模建第50-51页
        3.3.4 分子对接预测溶葡萄球菌酶的高级结构第51-53页
    3.4 氢氘交换质谱法鉴定溶葡萄球菌酶结构域之间相互作用界面上的肽段第53-69页
        3.4.1 溶葡萄球菌酶经胃蛋白酶酶解后的肽段鉴定第56-59页
        3.4.2 MALDI-TOF MS检测酶解肽段的覆盖率第59-63页
        3.4.3 建立MALDI-TOF MS检测氘代肽段的方法第63-66页
        3.4.4 溶葡萄球菌酶和它的两个结构域之间的氢氘交换率比较第66-69页
    3.5 位点特异二硫键交联验证结构域之间的相互作用界面第69-75页
        3.5.4 溶葡萄球菌酶的单半胱氨酸突变体的构建及其溶菌活性研究第69-72页
        3.5.5 溶葡萄球菌酶的双半胱氨酸突变体的构建和交联分析第72-73页
        3.5.6 二硫键交联突变体(K332C/T464C)的生物活性分析第73-75页
四、讨论第75-78页
参考文献第78-90页
总结与展望第90-92页
博士期间发表的论文第92-97页
致谢第97-98页

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