摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
1 前言 | 第10-17页 |
1.1 氟苯虫酰胺杀虫剂的研究概况 | 第10-11页 |
1.1.1 氟苯虫酰胺的概述 | 第10页 |
1.1.2 氟苯虫酰胺的作用机理 | 第10-11页 |
1.2 小菜蛾的研究概况 | 第11页 |
1.3 小菜蛾的抗药性发展及其抗药性机制 | 第11-12页 |
1.3.1 小菜蛾抗药性的发展 | 第11-12页 |
1.3.2 小菜蛾的抗药性机制 | 第12页 |
1.4 转录组测序技术的概述 | 第12-15页 |
1.4.1 高通量中转录组技术的介绍 | 第12-13页 |
1.4.2 第二代测序技术特点及发展 | 第13页 |
1.4.3 高通量测序在分子水平上的应用 | 第13页 |
1.4.4 RNA-Seq测序在昆虫抗药机制研究中的应用 | 第13-15页 |
1.5 选题的目的和意义 | 第15-16页 |
1.6 本研究的技术路线 | 第16-17页 |
2 材料与方法 | 第17-23页 |
2.1 供试虫源 | 第17页 |
2.2 主要试剂及器材 | 第17-18页 |
2.2.1 主要试剂 | 第17-18页 |
2.2.2 主要仪器 | 第18页 |
2.3 实验方法 | 第18-23页 |
2.3.1 小菜蛾总RNA的提取 | 第18-19页 |
2.3.2 小菜蛾RNA-Seq及数据分析 | 第19-23页 |
2.3.2.1 Illumina HiSeqTM 2000 测序 | 第19-20页 |
2.3.2.2 标准信息分析流程 | 第20-23页 |
2.3.2.2.1 过滤杂质数据 | 第20-21页 |
2.3.2.2.2 与参考序列比对 | 第21页 |
2.3.2.2.3 测序评估 | 第21页 |
2.3.2.2.4 基因表达量统计 | 第21-22页 |
2.3.2.2.5 Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第22页 |
2.3.2.2.6 Pathway显著性富集分析 | 第22-23页 |
3 结果与分析 | 第23-41页 |
3.1 小菜蛾样品RNA电泳检测结果 | 第23页 |
3.2 RNA-Seq样品RNA的质量评估 | 第23-24页 |
3.3 表达信息分析结果 | 第24-34页 |
3.3.1 测序质量评估 | 第24-25页 |
3.3.2 样品重复性检测 | 第25-26页 |
3.3.3 基因覆盖度统计 | 第26页 |
3.3.4 测序饱和度分析 | 第26-27页 |
3.3.5 基因表达定量分析 | 第27-29页 |
3.3.5.1 基因定量的方法 | 第27页 |
3.3.5.2 差异表达基因筛选 | 第27-29页 |
3.3.6 GO功能显著性富集分析 | 第29-31页 |
3.3.7 Pathway显著性富集分析 | 第31-34页 |
3.4 显著上调基因与抗逆性的研究分析 | 第34-40页 |
3.5 氟苯虫酰胺靶标受体的表达研究 | 第40-41页 |
4 讨论 | 第41-46页 |
4.1 小菜蛾差异基因的GO及pathway富集的分析研究 | 第41-42页 |
4.2 小菜蛾抗逆基因的筛选及生物信息学分析 | 第42-44页 |
4.3 小菜蛾鱼尼丁受体的表达差异研究 | 第44页 |
4.4 对后续研究的思考 | 第44-46页 |
5 结论 | 第46-47页 |
6 参考文献 | 第47-55页 |
7 附录 | 第55-71页 |
8 致谢 | 第71-72页 |
9 攻读学位期间发表论文情况 | 第72页 |