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小菜蛾抗氟苯虫酰胺种群的基因差异表达分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
1 前言第10-17页
    1.1 氟苯虫酰胺杀虫剂的研究概况第10-11页
        1.1.1 氟苯虫酰胺的概述第10页
        1.1.2 氟苯虫酰胺的作用机理第10-11页
    1.2 小菜蛾的研究概况第11页
    1.3 小菜蛾的抗药性发展及其抗药性机制第11-12页
        1.3.1 小菜蛾抗药性的发展第11-12页
        1.3.2 小菜蛾的抗药性机制第12页
    1.4 转录组测序技术的概述第12-15页
        1.4.1 高通量中转录组技术的介绍第12-13页
        1.4.2 第二代测序技术特点及发展第13页
        1.4.3 高通量测序在分子水平上的应用第13页
        1.4.4 RNA-Seq测序在昆虫抗药机制研究中的应用第13-15页
    1.5 选题的目的和意义第15-16页
    1.6 本研究的技术路线第16-17页
2 材料与方法第17-23页
    2.1 供试虫源第17页
    2.2 主要试剂及器材第17-18页
        2.2.1 主要试剂第17-18页
        2.2.2 主要仪器第18页
    2.3 实验方法第18-23页
        2.3.1 小菜蛾总RNA的提取第18-19页
        2.3.2 小菜蛾RNA-Seq及数据分析第19-23页
            2.3.2.1 Illumina HiSeqTM 2000 测序第19-20页
            2.3.2.2 标准信息分析流程第20-23页
                2.3.2.2.1 过滤杂质数据第20-21页
                2.3.2.2.2 与参考序列比对第21页
                2.3.2.2.3 测序评估第21页
                2.3.2.2.4 基因表达量统计第21-22页
                2.3.2.2.5 Gene Ontology功能显著性富集分析第22页
                2.3.2.2.6 Pathway显著性富集分析第22-23页
3 结果与分析第23-41页
    3.1 小菜蛾样品RNA电泳检测结果第23页
    3.2 RNA-Seq样品RNA的质量评估第23-24页
    3.3 表达信息分析结果第24-34页
        3.3.1 测序质量评估第24-25页
        3.3.2 样品重复性检测第25-26页
        3.3.3 基因覆盖度统计第26页
        3.3.4 测序饱和度分析第26-27页
        3.3.5 基因表达定量分析第27-29页
            3.3.5.1 基因定量的方法第27页
            3.3.5.2 差异表达基因筛选第27-29页
        3.3.6 GO功能显著性富集分析第29-31页
        3.3.7 Pathway显著性富集分析第31-34页
    3.4 显著上调基因与抗逆性的研究分析第34-40页
    3.5 氟苯虫酰胺靶标受体的表达研究第40-41页
4 讨论第41-46页
    4.1 小菜蛾差异基因的GO及pathway富集的分析研究第41-42页
    4.2 小菜蛾抗逆基因的筛选及生物信息学分析第42-44页
    4.3 小菜蛾鱼尼丁受体的表达差异研究第44页
    4.4 对后续研究的思考第44-46页
5 结论第46-47页
6 参考文献第47-55页
7 附录第55-71页
8 致谢第71-72页
9 攻读学位期间发表论文情况第72页

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