应用低分辨率数据搭建蛋白结构的方法研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 引言 | 第8-10页 |
| 1 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第10页 |
| 1.2 研究现状 | 第10-13页 |
| 1.2.1 蛋白质结构研究 | 第10-12页 |
| 1.2.2 蛋白质结构解析 | 第12-13页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第13页 |
| 1.4 研究内容 | 第13-14页 |
| 1.5 本章小结 | 第14-16页 |
| 2 经典算法与相关技术 | 第16-22页 |
| 2.1 分子结构对称性算法 | 第16-17页 |
| 2.2 蛋白质结构解析算法 | 第17-19页 |
| 2.2.1 ACMI算法 | 第17-18页 |
| 2.2.2 TEXTAL算法 | 第18页 |
| 2.2.3 RESOLVE算法 | 第18页 |
| 2.2.4 Buccaneer算法 | 第18-19页 |
| 2.2.5 ARP/wARP算法 | 第19页 |
| 2.3 相关技术 | 第19-21页 |
| 2.3.1 Phenix解决方案 | 第19-20页 |
| 2.3.2 CCP4库 | 第20页 |
| 2.3.3 Clipper项目 | 第20-21页 |
| 2.3.4 Coot建模工具 | 第21页 |
| 2.4 本章小结 | 第21-22页 |
| 3 利用区域分块和分子对称的搭建方法 | 第22-41页 |
| 3.1 分子的对称性 | 第22-24页 |
| 3.2 定位蛋白质分子 | 第24-25页 |
| 3.3 勾勒蛋白质范围 | 第25-33页 |
| 3.3.1 电子密度归一 | 第26-27页 |
| 3.3.2 划分局部区域 | 第27-29页 |
| 3.3.3 寻找对称分子 | 第29-33页 |
| 3.4 搭建蛋白质结构 | 第33-40页 |
| 3.4.1 序列分割 | 第34-35页 |
| 3.4.2 片段定位 | 第35-38页 |
| 3.4.3 片段拼接 | 第38-40页 |
| 3.5 本章小结 | 第40-41页 |
| 4 算法实现与结果 | 第41-56页 |
| 4.1 算法实现 | 第41-45页 |
| 4.2 勾勒蛋白质范围结果 | 第45-52页 |
| 4.2.1 4ymx蛋白质分子实验 | 第45-49页 |
| 4.2.2 3x21蛋白质分子实验 | 第49-52页 |
| 4.3 搭建蛋白质结构结果 | 第52-54页 |
| 4.4 本章小结 | 第54-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
