摘要 | 第3-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
1 引言 | 第11-28页 |
1.1 研究背景 | 第11-12页 |
1.2 沟眶象研究现状 | 第12-14页 |
1.2.1 形态特征 | 第12页 |
1.2.2 地理分布 | 第12页 |
1.2.3 生物学特性 | 第12-13页 |
1.2.4 危害特点 | 第13页 |
1.2.5 防治现状 | 第13-14页 |
1.3 转录组研究进展 | 第14-26页 |
1.3.1 转录组概念 | 第14-15页 |
1.3.2 测序技术进展 | 第15-22页 |
1.3.3 转录组测序 | 第22-25页 |
1.3.4 鞘翅目昆虫的转录组研究进展 | 第25-26页 |
1.4 研究目的和意义 | 第26-27页 |
1.5 技术路线 | 第27-28页 |
2 材料与方法 | 第28-36页 |
2.1 试验材料 | 第28-30页 |
2.1.1 试验标本 | 第28页 |
2.1.2 试验仪器与试剂 | 第28-30页 |
2.2 试验方法 | 第30-36页 |
2.2.1 沟眶象总RNA的提取 | 第30-31页 |
2.2.2 转录组测序 | 第31页 |
2.2.3 转录组数据的组装 | 第31-32页 |
2.2.4 Unigene的功能注释 | 第32-33页 |
2.2.5 编码蛋白框(CDS)预测 | 第33-34页 |
2.2.6 SSR分析 | 第34页 |
2.2.7 基因差异表达分析 | 第34-36页 |
3 结果与分析 | 第36-61页 |
3.1 总RNA质量检测 | 第36-39页 |
3.2 测序产量统计 | 第39-40页 |
3.3 测序数据组装 | 第40-47页 |
3.4 All-Unigene的功能注释 | 第47-51页 |
3.4.1 NR注释 | 第47-48页 |
3.4.2 COG分类 | 第48-49页 |
3.4.3 GO功能分类 | 第49-50页 |
3.4.4 KEGG代谢通路分析 | 第50-51页 |
3.5 编码蛋白框(CDS)预测 | 第51页 |
3.6 SSR分析 | 第51-53页 |
3.7 沟眶象基因差异表达分析 | 第53-61页 |
3.7.1 样品重复相关性分析 | 第53-54页 |
3.7.2 差异表达基因的筛选 | 第54页 |
3.7.3 差异表达基因的COG分类 | 第54-56页 |
3.7.4 差异表达基因的GO功能分析 | 第56-58页 |
3.7.5 差异表达基因的KEGG pathway分析 | 第58-61页 |
4 结论与讨论 | 第61-66页 |
4.1 结论 | 第61-62页 |
4.2 讨论 | 第62-64页 |
4.2.1 试验样品的获取 | 第62页 |
4.2.2 沟眶象All-Unigene的组装及功能注释 | 第62-63页 |
4.2.3 SSR分析 | 第63-64页 |
4.2.4 基因差异表达分析 | 第64页 |
4.3 不足与展望 | 第64-66页 |
4.3.1 不足 | 第64-65页 |
4.3.2 展望 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-73页 |
附表 | 第73-84页 |
个人简介 | 第84-85页 |
导师简介 | 第85-86页 |
致谢 | 第86页 |