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miR-505-3p调控神经元轴突发育以及肿瘤细胞系增殖的研究

摘要第5-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略词表第15-20页
1 绪论第20-45页
    1.1 引言第20-21页
    1.2 microRNA的多重生物学功能第21-23页
        1.2.1 microRNA形成过程第21-22页
        1.2.2 microRNA的多重生物学功能第22-23页
    1.3 神经元轴突发育与细胞自噬第23-31页
        1.3.1 神经元轴突发育第23-28页
            1.3.1.1 神经元结构第23页
            1.3.1.2 神经元极性形成第23-24页
            1.3.1.3 轴突延伸、分支和分支稳定第24-25页
            1.3.1.4 轴突发育的影响因素第25-28页
            1.3.1.5 microRNA调控轴突发育的案例第28页
        1.3.2 细胞自噬第28-31页
            1.3.2.1 细胞自噬概念及分类第28-29页
            1.3.2.2 自噬过程第29-30页
            1.3.2.3 自噬对神经元轴突的影响第30页
            1.3.2.4 microRNA调控细胞自噬的案例第30-31页
    1.4 Srsf1参与肿瘤增殖调控以及Srsf1基因自调控第31-34页
        1.4.1 Srsf1参与肿瘤增殖调控第31-33页
            1.4.1.1 Srsf1基因的经典功能第31-32页
            1.4.1.2 Srsf1与肿瘤增殖第32页
            1.4.1.3 microRNA调控肿瘤增殖案例第32-33页
        1.4.2 Srsf1基因自调控第33-34页
            1.4.2.1 Srsf1/miRNA负反馈环调控第33页
            1.4.2.2 SRSF1自结合调控第33-34页
    1.5 miR5053p已知生物学功能第34页
        1.5.1 miR5053p是一种肿瘤相关基因第34页
    1.6 本论文的研究目标、内容和创新性第34-38页
        1.6.1 研究目标第34-35页
        1.6.2 研究内容第35-37页
            1.6.2.1 研究内容第35-36页
            1.6.2.2 技术路线第36页
            1.6.2.3 拟解决的关键性问题第36-37页
        1.6.3 创新性第37-38页
    参考文献第38-45页
2 miR5053p通过影响Atg12/细胞自噬/线粒体通路调控轴突发育第45-98页
    2.1 引言第45页
    2.2 材料与方法第45-72页
        2.2.1 原料试剂第45-46页
        2.2.2 仪器设备第46页
        2.2.3 实验方法第46-72页
            2.2.3.1 神经元分离及体外培养第46-47页
            2.2.3.2 脂质体转染及神经元形态观察第47-48页
            2.2.3.3 电穿孔转染及神经元形态观察第48页
            2.2.3.4 细胞与组织总RNA抽提第48-49页
            2.2.3.5 miRNA qPCR检测第49-51页
            2.2.3.6 轴突及各级分支定义第51-52页
            2.2.3.7 胚胎电转第52页
            2.2.3.8 灌流、取脑及脑组织样本后固定第52-53页
            2.2.3.9 冰冻切片第53-54页
            2.2.3.10 sgRNA设计第54-55页
            2.2.3.11 PCR分型鉴定第55页
            2.2.3.12 测序分型鉴定第55-57页
            2.2.3.13 脱靶预测第57-58页
            2.2.3.14 HE染色第58-59页
            2.2.3.15 生物信息学分析预测靶基因第59-60页
            2.2.3.16 巣式PCR结合一步克隆法构建靶位点荧光素酶表达载体第60-62页
            2.2.3.17 病毒包装及滴度检测第62-65页
            2.2.3.18 qPCR检测靶基因mRNA表达量第65页
            2.2.3.19 电转神经元过表达外源基因第65-66页
            2.2.3.20 ATG12 ORF过表达载体构建第66-68页
            2.2.3.21 电镜用小鼠神经元体外培养第68页
            2.2.3.22 电镜用神经元样品制备第68-69页
            2.2.3.23 电镜用皮层组织样品制备第69页
            2.2.3.24 细胞免疫荧光染色第69页
            2.2.3.25 电镜用成纤维细胞样品制备第69-70页
            2.2.3.26 RPMC及CQ给药方案第70页
            2.2.3.27 拍图及数据处理第70-72页
    2.3 结果与讨论第72-90页
        2.3.1 miR-505 与神经系统发育的潜在联系第72页
        2.3.2 miR-505 前体和成熟体在大脑皮层中的表达第72-73页
        2.3.3 miR5053p促进神经元轴突分支第73-74页
        2.3.4 miR5053p促进神经元极性建立和轴突生长第74页
        2.3.5 miR5053p不影响其他神经突起发育第74-75页
        2.3.6 抑制miR5053p干扰轴突发育第75-76页
        2.3.7 miR5053p在P3时促进对侧皮层神经元轴突生长第76页
        2.3.8 miR5053p在P8时促进同侧和对侧皮层神经元轴突分支第76-77页
        2.3.9 miR5053p敲除阻碍轴突发育第77-78页
        2.3.10 miR5053p敲除不影响神经元增殖第78-79页
        2.3.11 Atg12在各候选靶基因中 3’UTR受miR5053p抑制最显著第79页
        2.3.12 Atg12在各候选靶基因中mRNA受miR5053p抑制最显著第79-80页
        2.3.13 Atg123’UTR受miR5053p特异性抑制第80-81页
        2.3.14 ATG12蛋白表达受miR5053p显著抑制第81页
        2.3.15 ATG12抑制体外培养神经元极性建立、轴突生长及分支第81-82页
        2.3.16 ATG12抑制体内皮层神经元轴突生长及分支第82-84页
        2.3.17 ATG12不影响其他神经突起发育第84页
        2.3.18 miR5053p敲除引起神经元自噬激活第84-86页
        2.3.19 miR5053p敲除引起神经元线粒体减少第86页
        2.3.20 miR5053p敲除引起自噬通路关键蛋白表达量改变第86-87页
        2.3.21 过表达ATG12类似RPMC上游激活自噬通路第87-88页
        2.3.22 miR5053p调控Atg12抑制自噬小体数目和面积第88页
        2.3.23 miR5053p调控Atg12促进线粒体数目增加但不影响面积第88-89页
        2.3.24 miR5053p调控Atg12影响自噬通路相关蛋白表达第89-90页
        2.3.25 miR5053p调控Atg12影响ATG12聚集体和自噬小体形成第90页
    2.4 本章小结第90-92页
    参考文献第92-98页
3 miR5053p通过SRSF1调控肿瘤细胞系增殖受SRSF1自调控影响第98-124页
    3.1 引言第98页
    3.2 材料与方法第98-105页
        3.2.1 原料试剂第98-99页
        3.2.2 仪器设备第99页
        3.2.3 实验方法第99-105页
            3.2.3.1 肿瘤细胞系培养第99-100页
            3.2.3.2 质粒载体构建、miRNA模拟物及抑制物合成第100页
            3.2.3.3 质粒抽提第100-101页
            3.2.3.4 双荧光素酶活性检测第101页
            3.2.3.5 WB检测靶基因蛋白表达量第101-102页
            3.2.3.6 SRSF1 ORF过表达载体构建第102-104页
            3.2.3.7 MEF细胞原代培养第104-105页
            3.2.3.8 ki67阳性细胞统计方法第105页
    3.3 结果与讨论第105-117页
        3.3.1 Srsf13'UTR上3个潜在靶位点中存在唯一真实靶位点第105-107页
        3.3.2 靶位点在进化上极端保守第107-108页
        3.3.3 miR5053p减血清条件下能抑制肿瘤细胞系增殖第108-110页
        3.3.4 miR5053p全血清条件下不能抑制肿瘤细胞系增殖第110-111页
        3.3.5 SRSF1蛋白表达量以及ki67表达量与血清浓度呈正比第111-112页
        3.3.6 过表达外源SRSF1蛋白阻断miR5053p对于Srsf1的抑制第112-113页
        3.3.7 生信预测靶位点附近存在SRSF1蛋白自调控结合位点第113-114页
        3.3.8 荧光素酶鉴定SRSF1蛋白自调控结合位点第114-115页
        3.3.9 SRSF1通过蛋白-mRNA自调控结合干扰miRNA-mRNA结合第115页
        3.3.10 肿瘤微环境与基因互作的复杂性第115页
        3.3.11 miR5053p通过SRSF1影响其他生理功能第115-117页
    3.4 本章小结第117-119页
    参考文献第119-124页
4 总结与展望第124-128页
附录I 攻读学位期间所发表的学术论文情况及基金支持第128-129页
附录II 致谢第129-130页

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