摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
第1章 绪论 | 第12-28页 |
1.1 研究背景 | 第12-19页 |
1.1.1 抗生素应用与污染现状及潜在风险 | 第12-14页 |
1.1.2 毒理代谢组学研究进展 | 第14-16页 |
1.1.3 肠道微生物学研究进展 | 第16-17页 |
1.1.4 宏基因组学和高通量测序技术研究进展 | 第17-19页 |
1.2 选题依据与研究目的 | 第19-20页 |
1.3 研究内容和技术路线 | 第20-21页 |
参考文献 | 第21-28页 |
第2章 盐酸四环素暴露对小鼠代谢的影响 | 第28-50页 |
2.1 引言 | 第28页 |
2.2 材料和方法 | 第28-31页 |
2.2.1 小鼠暴露处理和样品收集 | 第28-29页 |
2.2.2 小鼠肝脏组织切片实验 | 第29-30页 |
2.2.3 小鼠尿液和血清代谢分析预处理 | 第30页 |
2.2.4 小鼠尿液和血清1~H-NMR代谢分析 | 第30-31页 |
2.3 试验结果 | 第31-45页 |
2.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠表型和肝脏病理学的影响 | 第31-34页 |
2.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠血清代谢的影响 | 第34-40页 |
2.3.3 盐酸四环素暴露对小鼠尿液代谢的影响 | 第40-45页 |
2.4 本章小结 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-50页 |
第3章 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道抗生素耐药的影响 | 第50-66页 |
3.1 引言 | 第50页 |
3.2 材料和方法 | 第50-56页 |
3.2.1 小鼠暴露处理和样品收集 | 第50-51页 |
3.2.2 小鼠胃肠道微生物总DNA提取 | 第51页 |
3.2.3 耐药基因PCR和qPCR | 第51-55页 |
3.2.4 Illumina高通量测序及质量控制 | 第55页 |
3.2.5 耐药基因blast比对分析 | 第55页 |
3.2.6 可移动元件blast比对分析 | 第55-56页 |
3.3 结果与讨论 | 第56-62页 |
3.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道耐药基因丰度和多样性的影响 | 第56-60页 |
3.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道可移动元件的多样性和丰度的影响 | 第60-62页 |
3.4 本章小结 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-66页 |
第4章 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群结构与功能的影响 | 第66-90页 |
4.1 引言 | 第66-67页 |
4.2 材料和方法 | 第67-69页 |
4.2.1 小鼠暴露处理和样品收集 | 第67页 |
4.2.2 小鼠胃肠道微生物总DNA提取 | 第67页 |
4.2.3 454-焦磷酸测序及质量控制 | 第67-68页 |
4.2.4 胃肠道微生物群落结构多样性分析 | 第68页 |
4.2.5 Illumina高通量测序及质量控制 | 第68页 |
4.2.6 COG功能数据库构建及微生物功能分析 | 第68-69页 |
4.3 结果与讨论 | 第69-85页 |
4.3.1 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群结构的影响 | 第69-77页 |
4.3.2 盐酸四环素暴露对小鼠胃肠道菌群功能的影响 | 第77-81页 |
4.3.3 小鼠肠道菌群结构和功能与肝脏组织病变和尿液、血清代谢相关性结果 | 第81-84页 |
4.3.4 小鼠肠道菌群结构和功能与耐药基因相关性结果 | 第84-85页 |
4.4 本章小结 | 第85-86页 |
参考文献 | 第86-90页 |
第5章 结论与展望 | 第90-92页 |
5.1 结论 | 第90-91页 |
5.2 研究展望 | 第91-92页 |
第6章 创新点 | 第92-93页 |
项目支持 | 第93-94页 |
成果清单 | 第94-95页 |
致谢 | 第95-96页 |