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鸭疫里默氏杆菌双重PCR方法的建立及50S L27转座子插入突变株的部分生物学特性分析

中文摘要第9-11页
Abstract第11-13页
1 前言第14-26页
    1.1 鸭疫的研究第14-21页
        1.1.1 病原介绍第14-16页
        1.1.2 血清型及检测方法第16-17页
        1.1.3 鸭疫PCR检测方法第17-18页
        1.1.4 毒力因子研究进展第18-21页
            1.1.4.1 外膜蛋白A第18页
            1.1.4.2 TonB依赖受体第18-19页
            1.1.4.3 铁载体相互作用蛋白第19-20页
            1.1.4.4 辅溶血素和溶血素第20页
            1.1.4.5 其他可能与鸭疫里默是杆菌相关毒力蛋白第20-21页
    1.2 细菌的耐药性研究第21-23页
        1.2.1 抗生素的主要作用机理第22页
        1.2.2 细菌耐药性的产生机制第22页
        1.2.3 细菌耐药性的遗传机制第22-23页
        1.2.4 细菌耐药性的检测方法第23页
    1.3 基因盒-整合子系统第23-24页
    1.4 细菌卡那霉素的耐药机制第24页
    1.5 50S核糖体蛋白质L27第24-26页
2 材料和方法第26-43页
    2.1 试验材料第26-29页
        2.1.1 供试菌株及病料样品第26页
        2.1.2 载体和酶第26页
        2.1.2 主要试剂第26-27页
        2.1.3 主要培养基和溶液第27页
        2.1.4 主要仪器第27-28页
        2.1.5 抗生素第28页
        2.1.6 引物的设计第28-29页
    2.2 试验方法第29-43页
        2.2.1 鸭疫里默氏杆菌16S rRNA和dnaB基因的双重PCR方法建立第29-30页
            2.2.1.1 基于16S rRNA和danB单重PCR检测鸭疫里默氏杆菌第29页
            2.2.1.2 双重PCR反应体系及条件的优化第29页
            2.2.1.3 双重PCR特异性试验第29页
            2.2.1.4 双重PCR敏感性试验第29-30页
            2.2.1.5 双重PCR重复性试验第30页
            2.2.1.6 临床样品的检测第30页
        2.2.2 贵州大学鸭疫里默氏杆菌双重PCR、血清型鉴定和药敏试验第30页
            2.2.2.1 血清型鉴定第30页
            2.2.2.2 血清型鉴定第30页
            2.2.2.3 kana药敏片鉴定第30页
        2.2.3 Yb2株转座子突变库的构建及卡那霉素耐药基因的筛选鉴定第30-37页
            2.2.3.1 细菌培养及PEP4351转入BW19851第30-31页
            2.2.3.2 鸭疫里默氏杆菌Yb2株和大肠杆菌E.coli BW-19851药敏试验第31页
            2.2.3.3 多粘霉素和红霉素对Yb2株和E.coli BW-19851的MIC测定第31-32页
            2.2.3.4 接合转导第32-33页
            2.2.3.5 鉴定缺失Kana抗性突变株第33页
            2.2.3.6 基因组模板的制备第33-34页
            2.2.3.7 转座子插入位点鉴定第34-37页
        2.2.4 构建突变株DK-2的回复株第37-43页
            2.2.4.1 感受态细胞的制备第37-38页
            2.2.4.2 高保真扩增DK-2的11-50S基因第38页
            2.2.4.3 重组质粒提取第38-39页
            2.2.4.4 酶切第39页
            2.2.4.5 目的片段的回收第39-40页
            2.2.4.6 构建回复质粒第40-41页
            2.2.4.7 突变株DK-2回复株的筛选第41页
            2.2.4.8 检测DK-2、cDK-2和Yb2的最小抑菌浓度(MIC)的测定第41-42页
            2.2.4.9 检测DK-2、cDK-2和Yb2的生长曲线的测定第42页
            2.2.4.10 检测DK-2、cDK-2和Yb2的生长曲线的药敏试验的测定第42-43页
3 结果与分析第43-58页
    3.1 鸭疫里默氏杆菌16S rRNA和dnaB基因的双重PCR结果第43-45页
        3.1.1 基于16S rRNA或danB单重PCR检测鸭疫里默氏杆菌结果第43页
        3.1.2 双重PCR反应条件优化结果第43页
        3.1.3 双重PCR方法特异性结果第43-44页
        3.1.4 双重PCR方法敏感性试验第44-45页
        3.1.5 双重PCR方法重复性试验第45页
        3.1.6 临床样品的检测结果第45页
    3.2 贵州大学鸭疫里默氏杆菌双重PCR、血清型鉴定和药敏试验结果第45-46页
    3.3 Yb2转座子随机插入卡那霉素耐药基因的筛选鉴定第46-51页
        3.3.1 鸭疫里默氏杆菌Yb2株和大肠杆菌E.coli BW-19851药敏试验结果第46-48页
        3.3.2 Yb2株和E.coli BW-19851对红霉素和多粘菌素B的MIC测定第48页
        3.3.3 转座子插入的阳性突变株PCR鉴定第48-49页
        3.3.4 Genome Walking结果第49页
        3.3.5 插入位点序列分析结果第49-51页
    3.4 突变株DK-2的回复株构建结果第51-58页
        3.4.1 DK21150S基因的克隆第51页
        3.4.2 回复质粒的鉴定第51-52页
        3.4.3 缺失突变株回复株鉴定第52-54页
        3.4.4 DK-2、cDK-2和Yb2的对卡那霉素最小抑菌浓度(MIC)的测定第54-56页
        3.4.6 检测突变株、回复株和野生株的药敏试验结果第56-58页
4 讨论第58-61页
    4.1 鸭疫里默氏杆菌16S rRNA和dnaB基因的双重PCR方法第58页
    4.2 贵州大学鸭疫里默氏杆菌血清型鉴定和药敏试验第58-59页
    4.3 Yb2转座子随机插入卡那霉素耐药基因的筛选第59-61页
5 结论第61-62页
参考文献第62-69页
致谢第69-71页
攻读学位期间发表论文情况第71页

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