| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第19-41页 |
| 1.1 研究背景 | 第19-20页 |
| 1.2 项目来源和经费支持 | 第20-21页 |
| 1.3 国内外研究综述 | 第21-38页 |
| 1.3.1 土壤微生物分布特征 | 第21-26页 |
| 1.3.2 土壤微生物的功能分布特征 | 第26-31页 |
| 1.3.3 植被对微生物的影响 | 第31-33页 |
| 1.3.4 土壤微生物的群落结构维持机制理论 | 第33-35页 |
| 1.3.5 土壤微生物维持机制假说 | 第35-36页 |
| 1.3.6 基因组学 | 第36-38页 |
| 1.4 关键科学问题 | 第38页 |
| 1.5 研究内容及技术路线 | 第38-41页 |
| 1.5.1 研究目标 | 第38-39页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第39-40页 |
| 1.5.3 研究技术路线 | 第40-41页 |
| 第二章 样地概况，实验设置和试验方法简介 | 第41-47页 |
| 2.1 三峡库区自然概况 | 第41页 |
| 2.2 研究样地概况 | 第41-42页 |
| 2.3 样地设置 | 第42-43页 |
| 2.4 土壤样品采集 | 第43页 |
| 2.5 提取土壤微生物的DNA | 第43-44页 |
| 2.5.1 土壤样品DNA提取 | 第43页 |
| 2.5.2 PCR扩增 | 第43-44页 |
| 2.6 序列数据处理 | 第44-45页 |
| 2.6.1 原始样本统计 | 第44页 |
| 2.6.2 有效数据统计 | 第44页 |
| 2.6.3 数据去杂方法和参数 | 第44-45页 |
| 2.6.4 物种注释 | 第45页 |
| 2.7 数据分析方法简介 | 第45-47页 |
| 第三章 马尾松人工林不同营林措施下土壤微生物量碳氮特征及影响因素 | 第47-59页 |
| 3.1 引言 | 第47-48页 |
| 3.2 研究方法 | 第48页 |
| 3.2.1 样地设置 | 第48页 |
| 3.2.2 实验材料 | 第48页 |
| 3.3 统计分析 | 第48-49页 |
| 3.4 结果 | 第49-55页 |
| 3.4.1 不同营林措施下的土壤微生物量碳氮 | 第49页 |
| 3.4.2 土壤微生物熵及环境因子变异特征 | 第49-53页 |
| 3.4.3 土壤微生物生物量碳氮和环境因子的关系 | 第53-55页 |
| 3.5 讨论 | 第55-59页 |
| 3.5.1 不同营林措施下土壤微生物生物量碳氮响应特征 | 第55-56页 |
| 3.5.2 土壤微生物量与环境因子的关系 | 第56-57页 |
| 3.5.3 营林措施对微生物生物量碳氮差异解释 | 第57-59页 |
| 第四章 马尾松人工林不同营林措施下土壤微生物多样性及组成特征 | 第59-74页 |
| 4.1 引言 | 第59-60页 |
| 4.2 研究方法 | 第60-61页 |
| 4.2.0 样地设置 | 第60页 |
| 4.2.1 土壤样品 | 第60页 |
| 4.2.2 高通量测序数处理 | 第60页 |
| 4.2.3 数据分析方法 | 第60-61页 |
| 4.3 结果 | 第61-72页 |
| 4.3.1 土壤微生物群落组成分布特征 | 第61-63页 |
| 4.3.2 土壤微生物的alpha多样性 | 第63-64页 |
| 4.3.3 土壤微生物的beta多样性 | 第64页 |
| 4.3.4 土壤微生物群落组成特征 | 第64-72页 |
| 4.4 讨论 | 第72-74页 |
| 4.4.1 土壤微生物多样性、组成响应探究 | 第72-74页 |
| 第五章 马尾松人工林不同营林措施下土壤微生物群落结构响应及其与环境因子的关系 | 第74-90页 |
| 5.1 引言 | 第74-75页 |
| 5.2 研究方法 | 第75页 |
| 5.2.0 样地设置 | 第75页 |
| 5.2.1 土壤样品 | 第75页 |
| 5.2.2 高通量测序数处理 | 第75页 |
| 5.3 数据分析 | 第75-76页 |
| 5.4 结果 | 第76-87页 |
| 5.4.1 环境因子对营林干扰的响应 | 第76页 |
| 5.4.2 不同营林措施下土壤微生物的群落结构 | 第76-77页 |
| 5.4.3 土壤微生物群落结构的差异物种分析 | 第77-79页 |
| 5.4.4 土壤微生物群落结构相似性 | 第79-81页 |
| 5.4.5 土壤微生物群落组成和环境因子的关系 | 第81-87页 |
| 5.5 讨论 | 第87-90页 |
| 5.5.1 营林措施对土壤微生物群落结构影响 | 第87-88页 |
| 5.5.2 环境因子与土壤微生物群落结构异质性的关系 | 第88-90页 |
| 第六章 马尾松人工林不同营林措施下土壤微生物功能响应特征 | 第90-101页 |
| 6.1 引言 | 第90-91页 |
| 6.2 研究方法 | 第91-92页 |
| 6.2.1 实验样品和数据处理 | 第91页 |
| 6.2.2 细菌功能预测 | 第91页 |
| 6.2.3 真菌功能预测 | 第91-92页 |
| 6.2.4 数据分析 | 第92页 |
| 6.3 结果 | 第92-98页 |
| 6.3.1 细菌的功能多样性特征 | 第92-96页 |
| 6.3.2 真菌的功能多样性特征 | 第96-98页 |
| 6.4 讨论 | 第98-101页 |
| 6.4.1 细菌功能家族特征 | 第98-99页 |
| 6.4.2 真菌的功能群特征 | 第99-101页 |
| 第七章 马尾松人工林不同营林措施下土壤微生物的交互作用响应机制 | 第101-121页 |
| 7.1 引言 | 第101-102页 |
| 7.2 研究方法 | 第102-104页 |
| 7.2.1 实验设置 | 第102页 |
| 7.2.2 实验材料高通量测序处理 | 第102页 |
| 7.2.3 分子生态学网络模型的构建 | 第102-103页 |
| 7.2.4 分子生态学网络模型的分析方法 | 第103-104页 |
| 7.3 结果 | 第104-117页 |
| 7.3.1 土壤细菌分子生态网络模型的拓扑学属性 | 第104页 |
| 7.3.2 土壤细菌分子生态学模型的模块和关键节点、 | 第104-111页 |
| 7.3.3 土壤真菌分子生态学网络模型拓扑学属性 | 第111-113页 |
| 7.3.4 土壤真菌分子生态学模型的模块和关键节点、 | 第113-116页 |
| 7.3.5 网络拓扑学性质与环境参数之间的参数 | 第116-117页 |
| 7.4 讨论 | 第117-121页 |
| 7.4.1 基于细菌分子生态学网络模型对营林干扰响应机制 | 第117-119页 |
| 7.4.2 基于真菌分子生态学网络模型对营林干扰响应机制 | 第119-120页 |
| 7.4.3 环境因子和土壤微生物的分子生态学网络模型 | 第120-121页 |
| 第八章 马尾松人工林不同营林措施下土壤微生物的系统发育学特征 | 第121-133页 |
| 8.1 引言 | 第121-122页 |
| 8.2 材料与方法 | 第122-124页 |
| 8.2.1 研究样地微生物群落系统发育树构建 | 第122页 |
| 8.2.2 系统发育多样性指数计算 | 第122-124页 |
| 8.2.3 数据分析 | 第124页 |
| 8.3 结果 | 第124-129页 |
| 8.3.1 不同营林干扰下的细菌系统发育多样性指数的响应 | 第125-127页 |
| 8.3.2 不同营林干扰下的真菌系统发育多样性指数的响应 | 第127-128页 |
| 8.3.3 谱系发育树上的关键物种 | 第128-129页 |
| 8.4 讨论 | 第129-133页 |
| 8.4.1 基于系统发育指数细菌对营林干扰的响应机制 | 第129-131页 |
| 8.4.2 基于系统发育指数指数真菌对营林干扰的响应机制 | 第131-133页 |
| 第九章 结论与展望 | 第133-137页 |
| 9.1 主要结论 | 第133-136页 |
| 9.1.1 土壤微生物生物群落生物量、组成、结构和功能对营林干扰的响应特征 | 第133-134页 |
| 9.1.2 土壤微生物群落结构与环境因子的关系 | 第134页 |
| 9.1.3 基于分子生态学网络模型土壤微生物对营林干扰的响应机制 | 第134-135页 |
| 9.1.4 基于系统发育学特征土壤微生物对营林干扰的响应机制 | 第135页 |
| 9.1.5 基于土壤微生物的响应特征，评估营林措施的影响 | 第135-136页 |
| 9.2 主要创新点和展望 | 第136-137页 |
| 9.2.1 主要创新点 | 第136页 |
| 9.2.2 研究展望 | 第136-137页 |
| 参考文献 | 第137-163页 |
| 在读期间的学术研究 | 第163-164页 |
| 致谢 | 第164-165页 |
