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十红滩铀矿床地下水与矿石中细菌类群分布特征研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 前言第11-21页
    1. 十红滩铀矿床地下水的水文地质概况第11-13页
        1.1 十红滩铀矿床地下水含水层的划分第12页
        1.2 含矿层地下水的特征第12-13页
        1.3 铀成矿的水文地质成因机制分析第13页
    2. 十红滩砂岩型铀矿的地质条件概况第13-15页
        2.1 十红滩铀矿床的地球化学分带第14页
        2.2 十红滩铀矿床形成的机理第14-15页
    3. 微生物的成矿作用第15-17页
        3.1 硫酸盐还原菌对铀的成矿作用第16-17页
        3.2 铁细菌的成矿作用第17页
        3.3 参与氮循环微生物的成矿作用第17页
    4. 环境微生物多样性的研究方法第17-20页
        4.1 传统的微生物纯培养方法第18页
        4.2 分子生物学方法第18-20页
    5. 研究内容、目的及意义第20-21页
        5.1 研究的内容第20页
        5.2 研究目的、意义第20-21页
第二章 容矿层地下水与矿石中细菌类群分布特征第21-59页
    1. 材料第21-25页
        1.1 矿水样与矿石样品的采集与处理第21-22页
        1.2 培养基第22-23页
        1.3 实验中使用的试剂第23-24页
        1.4 实验仪器第24-25页
        1.5 数据分析相关软件第25页
    2. 实验方法第25-29页
        2.1 矿水及矿石中各元素及离子的测定方法第25-26页
        2.2 可培养细菌的富集第26页
        2.3 可培养细菌的计数第26页
        2.4 可培养细菌的分离纯化第26-27页
        2.5 纯菌株的16S rDNA鉴定第27页
        2.6 可培养细菌富集培养物DNA的提取第27-28页
        2.7 可培养细菌富集培养物DNA-PCR扩增第28页
        2.8 可培养细菌富集培养物PCR-DGGE分析第28-29页
        2.9 系统发育分析第29页
    3. 结果与分析第29-59页
        3.1 矿水中可培养细菌数量分布特征第29-30页
        3.2 矿床地下水及矿石样品中固氮菌、反硝化菌的分布特征分析第30-47页
            3.2.1 矿水与矿石样品中固氮菌、反硝化菌的数量分布特征第30-31页
            3.2.2 矿床地下水及矿石样品中固氮菌分布特征第31-39页
                3.2.2.1 矿床地下水及矿石样品中固氮菌的初步鉴定结果第31-34页
                3.2.2.2 固氮菌富集培养物基因组DNA的提取及PCR扩增结果第34-35页
                3.2.2.3 固氮菌富集培养物PCR-DGGE图谱分析第35-39页
            3.2.3 矿床地下水及矿石样品中反硝化菌分布特征第39-47页
                3.2.3.1 矿床地下水及矿石样品中反硝化菌的初步鉴定结果第39-42页
                3.2.3.2 反硝化菌富集培养物基因组DNA提取及PCR扩增结果第42-43页
                3.2.3.3 反硝化菌富集培养物PCR-DGGE分析第43-47页
        3.3 矿床地下水及矿石样品中铁细菌富集培养物分布特征第47-55页
            3.3.1 矿床地下水及矿石样品中铁细菌的数量分布特征第47-48页
            3.3.2 矿床地下水及矿石样品中铁细菌的初步鉴定结果第48-49页
            3.3.3 铁细菌富集培养物基因组DNA提取及PCR结果第49-50页
            3.3.4 铁细菌富集培养物DGGE分析第50-55页
        3.4 矿床地下水与矿石中硫酸盐还原菌的分布特征第55-57页
            3.4.1 矿石中硫酸盐还原数量分布特征第55页
            3.4.2 硫酸盐还原菌富集培养物DNA-PCR扩增第55-56页
            3.4.3 矿床地下水中与矿石中硫酸盐还原菌富集培养物DGGE分析第56-57页
        3.5 本章小结第57-59页
第三章 矿床地下水中免培养的微生物类群第59-67页
    1. 材料与方法第59页
        1.1 样品处理第59页
        1.2 方法第59页
            1.2.1 宏基因组DNA提取第59页
            1.2.2 宏基因16SrDNA V3区PCR扩增第59页
            1.2.3 宏基因组PCR-DGGE分析第59页
    2. 结果与分析第59-64页
        2.1 矿床地下水宏基因组DNA的提取结果第59-60页
        2.2 矿床地下水宏基因组DNA-PCR扩增结果第60页
        2.3 矿床地下水宏基因组PCR-DGGE扩增结果第60-64页
    3. 本章小结第64-67页
小结与展望第67-69页
参考文献第69-77页
攻读硕士学位期间取得的科研成果第77-79页
致谢第79页

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